MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 chromosome

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009792	CTTATT	2	12	14105	14116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009792	GTGATG	2	12	33397	33408	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009792	TTTCTT	2	12	83060	83071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009792	AAAATA	2	12	102223	102234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009792	TAAGCG	2	12	116423	116434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009792	AAGCGC	2	12	250701	250712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009792	GTTTTT	2	12	275225	275236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009792	GTTGTA	2	12	339622	339633	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009792	GCACTT	2	12	365118	365129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009792	ATCATA	2	12	417489	417500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009792	TATTCG	2	12	423134	423145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009792	TTTTCT	2	12	454668	454679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009792	TGGCGC	2	12	496848	496859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009792	TATAAA	2	12	542390	542401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009792	TTTTCC	2	12	629316	629327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009792	GCGCTT	2	12	637859	637870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009792	ACGGAA	2	12	723100	723111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009792	GATATA	2	12	727748	727759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009792	CAACGC	2	12	746440	746451	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009792	CTGACA	2	12	919690	919701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009792	AGGTTG	2	12	921929	921940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009792	TTGTTT	2	12	1003386	1003397	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009792	CGATAA	2	12	1099867	1099878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009792	ACGTTG	2	12	1117784	1117795	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009792	TGTCAT	2	12	1173319	1173330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009792	GCCGAA	2	12	1192506	1192517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009792	GACACT	2	12	1195937	1195948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009792	GACACT	2	12	1196653	1196664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009792	ATGTTG	2	12	1254859	1254870	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009792	TCTAAC	2	12	1287627	1287638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009792	GCTTAC	2	12	1312706	1312717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009792	TAATTT	2	12	1329576	1329587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009792	TCTTTA	2	12	1420936	1420947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009792	CACACG	2	12	1459001	1459012	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009792	TCAACG	2	12	1461776	1461787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009792	GCATGG	2	12	1466979	1466990	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009792	TTTTAT	2	12	1574052	1574063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009792	AGCGCT	2	12	1589498	1589509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009792	AATATA	2	12	1602932	1602943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009792	AAGACT	2	12	1633706	1633717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009792	ATATAA	2	12	1669715	1669726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009792	AATCAC	2	12	1721890	1721901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009792	AACGCG	2	12	1800202	1800213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009792	GCATTT	2	12	1824426	1824437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009792	GAGATT	2	12	1964511	1964522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009792	CGGTTA	2	12	2039584	2039595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009792	ATTTAA	2	12	2075511	2075522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009792	GTAAAG	2	12	2113436	2113447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009792	GATCAC	2	12	2212584	2212595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009792	TTACTT	2	12	2301191	2301202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009792	ACGCAG	2	12	2302033	2302044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009792	ATTTTC	2	12	2311138	2311149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009792	CGATAA	2	12	2373074	2373085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009792	CATAAC	2	12	2388410	2388421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009792	GTGAAT	2	12	2421586	2421597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009792	GGAAAG	2	12	2425764	2425775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009792	AATGAT	2	12	2454746	2454757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009792	CATAAA	2	12	2474036	2474047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009792	CGGAGG	2	12	2661830	2661841	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009792	AAACAA	2	12	2700136	2700147	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009792	GAAAAA	2	12	2763193	2763204	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009792	AGCGCC	2	12	2853354	2853365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009792	GCGCTT	2	12	2855452	2855463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009792	AAGCGC	2	12	2944779	2944790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009792	GCTTAC	2	12	2979827	2979838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009792	AGCGCC	2	12	3012570	3012581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009792	GCTTAC	2	12	3134458	3134469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009792	CACGTA	2	12	3183720	3183731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009792	ATCATT	2	12	3194510	3194521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009792	AGCGCC	2	12	3206056	3206067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009792	TCAGTT	2	12	3267136	3267147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009792	AGCGCC	2	12	3316536	3316547	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009792	AAGCGC	2	12	3334464	3334475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009792	TAAAAA	2	12	3411053	3411064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009792	AAAGAC	2	12	3554456	3554467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009792	TTTATT	2	12	3565709	3565720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009792	AATAAA	2	12	3639626	3639637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009792	TAAAAA	2	12	3704332	3704343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009792	CAATAA	2	12	3735226	3735237	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009792	CATCTA	2	12	3743019	3743030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009792	AGAGAA	2	12	3761498	3761509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009792	CGCTTG	2	12	3766445	3766456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009792	TAGTTA	2	12	3828420	3828431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009792	CCTTCT	2	12	3917482	3917493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009792	ATTTAT	2	12	3937244	3937255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009792	GCCAGC	2	12	3941173	3941184	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009792	CAGTTT	2	12	3941309	3941320	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009792	GCGCTT	2	12	3954790	3954801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009792	ATAAAA	2	12	3991518	3991529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009792	TAAAAA	2	12	4037706	4037717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009792	ATAGTG	2	12	4042552	4042563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009792	AGTTGT	2	12	4129147	4129158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009792	TTTTAT	2	12	4187586	4187597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009792	ATTTTT	2	12	4333542	4333553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009792	TTAAAA	2	12	4418842	4418853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009792	GCTTAC	2	12	4445679	4445690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009792	GCGCTT	2	12	4461304	4461315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009792	TTTGAT	2	12	4622997	4623008	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.