MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 chromosome

Total Repeats: 3281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009792	TGCTT	2	10	495	504	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009792	GCCCC	2	10	5904	5913	0 %	0 %	20 %	80 %	157144302
3	NC_009792	AGCCA	2	10	6495	6504	40 %	0 %	20 %	40 %	157144302
4	NC_009792	ACCAG	2	10	7557	7566	40 %	0 %	20 %	40 %	157144303
5	NC_009792	GCGCT	2	10	8744	8753	0 %	20 %	40 %	40 %	157144304
6	NC_009792	ACGTC	2	10	10042	10051	20 %	20 %	20 %	40 %	157144306
7	NC_009792	GCGCC	2	10	10824	10833	0 %	0 %	40 %	60 %	157144309
8	NC_009792	GCCCG	2	10	11854	11863	0 %	0 %	40 %	60 %	157144309
9	NC_009792	CAAAA	2	10	12459	12468	80 %	0 %	0 %	20 %	157144308
10	NC_009792	CTGCA	2	10	12903	12912	20 %	20 %	20 %	40 %	157144310
11	NC_009792	CGCCC	2	10	13215	13224	0 %	0 %	20 %	80 %	157144311
12	NC_009792	GCACC	2	10	13346	13355	20 %	0 %	20 %	60 %	157144311
13	NC_009792	TGAAC	2	10	14253	14262	40 %	20 %	20 %	20 %	157144313
14	NC_009792	CGGCG	2	10	15767	15776	0 %	0 %	60 %	40 %	157144314
15	NC_009792	GGCCG	2	10	20089	20098	0 %	0 %	60 %	40 %	157144317
16	NC_009792	CACGC	2	10	20162	20171	20 %	0 %	20 %	60 %	157144317
17	NC_009792	CAGAA	2	10	21578	21587	60 %	0 %	20 %	20 %	157144319
18	NC_009792	AGCGC	2	10	22149	22158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009792	CCAGA	2	10	23814	23823	40 %	0 %	20 %	40 %	157144322
20	NC_009792	AAAAT	2	10	25540	25549	80 %	20 %	0 %	0 %	157144323
21	NC_009792	TCATT	2	10	26337	26346	20 %	60 %	0 %	20 %	157144323
22	NC_009792	GGCGG	2	10	32079	32088	0 %	0 %	80 %	20 %	157144328
23	NC_009792	CAGGT	2	10	33218	33227	20 %	20 %	40 %	20 %	157144331
24	NC_009792	GATAC	2	10	33679	33688	40 %	20 %	20 %	20 %	157144332
25	NC_009792	GAAAA	2	10	36587	36596	80 %	0 %	20 %	0 %	157144336
26	NC_009792	AGCGA	2	10	36724	36733	40 %	0 %	40 %	20 %	157144336
27	NC_009792	CAGAC	2	10	38001	38010	40 %	0 %	20 %	40 %	157144337
28	NC_009792	TAACG	2	10	38133	38142	40 %	20 %	20 %	20 %	157144337
29	NC_009792	TTCAG	2	10	38580	38589	20 %	40 %	20 %	20 %	157144337
30	NC_009792	GCTCC	2	10	44659	44668	0 %	20 %	20 %	60 %	157144342
31	NC_009792	AGTAA	2	10	44996	45005	60 %	20 %	20 %	0 %	157144342
32	NC_009792	CAACG	2	10	46293	46302	40 %	0 %	20 %	40 %	157144343
33	NC_009792	AACGG	2	10	47191	47200	40 %	0 %	40 %	20 %	157144344
34	NC_009792	TCCGC	2	10	47669	47678	0 %	20 %	20 %	60 %	157144344
35	NC_009792	TCCCG	2	10	49185	49194	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_009792	CGCAA	2	10	49234	49243	40 %	0 %	20 %	40 %	157144347
37	NC_009792	GCACC	2	10	50187	50196	20 %	0 %	20 %	60 %	157144347
38	NC_009792	AAGCA	2	10	52091	52100	60 %	0 %	20 %	20 %	157144348
39	NC_009792	CGGGG	2	10	52828	52837	0 %	0 %	80 %	20 %	157144350
40	NC_009792	TGGCG	2	10	53446	53455	0 %	20 %	60 %	20 %	157144350
41	NC_009792	TCTGG	2	10	55343	55352	0 %	40 %	40 %	20 %	157144352
42	NC_009792	GCTCA	2	10	56316	56325	20 %	20 %	20 %	40 %	157144355
43	NC_009792	CCCAG	2	10	60243	60252	20 %	0 %	20 %	60 %	157144359
44	NC_009792	ATGCG	2	10	60965	60974	20 %	20 %	40 %	20 %	157144359
45	NC_009792	CAGAC	2	10	61169	61178	40 %	0 %	20 %	40 %	157144360
46	NC_009792	GCCGG	2	10	61521	61530	0 %	0 %	60 %	40 %	157144360
47	NC_009792	AACAG	2	10	63468	63477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009792	CGCGC	2	10	64881	64890	0 %	0 %	40 %	60 %	157144362
49	NC_009792	GTAAT	2	10	66488	66497	40 %	40 %	20 %	0 %	157144363
50	NC_009792	GACCA	2	10	67753	67762	40 %	0 %	20 %	40 %	157144365
51	NC_009792	TTCAC	2	10	70748	70757	20 %	40 %	0 %	40 %	157144369
52	NC_009792	CTGCT	2	10	72444	72453	0 %	40 %	20 %	40 %	157144370
53	NC_009792	CAGAA	2	10	72670	72679	60 %	0 %	20 %	20 %	157144372
54	NC_009792	TGGCC	2	10	72698	72707	0 %	20 %	40 %	40 %	157144372
55	NC_009792	ATCAG	2	10	72894	72903	40 %	20 %	20 %	20 %	157144373
56	NC_009792	AAATT	2	10	74895	74904	60 %	40 %	0 %	0 %	157144376
57	NC_009792	AAGCG	2	10	75594	75603	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009792	CACGC	2	10	80579	80588	20 %	0 %	20 %	60 %	157144381
59	NC_009792	CACTT	2	10	81006	81015	20 %	40 %	0 %	40 %	157144381
60	NC_009792	GCGTC	2	10	82161	82170	0 %	20 %	40 %	40 %	157144382
61	NC_009792	TGACG	2	10	86370	86379	20 %	20 %	40 %	20 %	157144385
62	NC_009792	CAACC	2	10	88508	88517	40 %	0 %	0 %	60 %	157144387
63	NC_009792	TGCGC	2	10	88907	88916	0 %	20 %	40 %	40 %	157144387
64	NC_009792	TGATG	2	10	88940	88949	20 %	40 %	40 %	0 %	157144387
65	NC_009792	AAAAG	2	10	89214	89223	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009792	CGAGC	2	10	92331	92340	20 %	0 %	40 %	40 %	157144390
67	NC_009792	AAGCG	2	10	93639	93648	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009792	TAATT	2	10	99407	99416	40 %	60 %	0 %	0 %	157144394
69	NC_009792	ATCGA	2	10	100816	100825	40 %	20 %	20 %	20 %	157144396
70	NC_009792	AAACG	2	10	103073	103082	60 %	0 %	20 %	20 %	157144398
71	NC_009792	GCACT	2	10	104554	104563	20 %	20 %	20 %	40 %	157144400
72	NC_009792	CGATG	2	10	104889	104898	20 %	20 %	40 %	20 %	157144400
73	NC_009792	CGGTC	2	10	105303	105312	0 %	20 %	40 %	40 %	157144400
74	NC_009792	GATCA	2	10	105934	105943	40 %	20 %	20 %	20 %	157144401
75	NC_009792	CCGGC	2	10	106811	106820	0 %	0 %	40 %	60 %	157144401
76	NC_009792	GGGCA	2	10	107811	107820	20 %	0 %	60 %	20 %	157144402
77	NC_009792	GCGAT	2	10	108118	108127	20 %	20 %	40 %	20 %	157144402
78	NC_009792	CCGTT	2	10	108401	108410	0 %	40 %	20 %	40 %	157144402
79	NC_009792	GCGCT	2	10	108887	108896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009792	GGCAA	2	10	109321	109330	40 %	0 %	40 %	20 %	157144403
81	NC_009792	CATCG	2	10	109448	109457	20 %	20 %	20 %	40 %	157144403
82	NC_009792	ACGGT	2	10	109683	109692	20 %	20 %	40 %	20 %	157144403
83	NC_009792	CGAAC	2	10	109968	109977	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009792	CGGCG	2	10	110383	110392	0 %	0 %	60 %	40 %	157144404
85	NC_009792	ATGAA	2	10	111231	111240	60 %	20 %	20 %	0 %	157144404
86	NC_009792	AAGCG	2	10	111553	111562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009792	CTTCT	2	10	111841	111850	0 %	60 %	0 %	40 %	157144407
88	NC_009792	TGAAA	2	10	114566	114575	60 %	20 %	20 %	0 %	157144411
89	NC_009792	GGCGC	2	10	115132	115141	0 %	0 %	60 %	40 %	157144411
90	NC_009792	CGGCC	2	10	115622	115631	0 %	0 %	40 %	60 %	157144411
91	NC_009792	GGACA	2	10	117613	117622	40 %	0 %	40 %	20 %	157144412
92	NC_009792	CAGGC	2	10	118130	118139	20 %	0 %	40 %	40 %	157144413
93	NC_009792	AGGCC	2	10	118857	118866	20 %	0 %	40 %	40 %	157144413
94	NC_009792	CCTGC	2	10	119055	119064	0 %	20 %	20 %	60 %	157144413
95	NC_009792	TTCTG	2	10	119183	119192	0 %	60 %	20 %	20 %	157144413
96	NC_009792	CGGCG	2	10	120927	120936	0 %	0 %	60 %	40 %	157144415
97	NC_009792	ATCTG	2	10	121341	121350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009792	TACGC	2	10	124295	124304	20 %	20 %	20 %	40 %	157144418
99	NC_009792	CAGGT	2	10	125346	125355	20 %	20 %	40 %	20 %	157144419
100	NC_009792	CGTTT	2	10	126497	126506	0 %	60 %	20 %	20 %	157144420
101	NC_009792	AGCCG	2	10	134227	134236	20 %	0 %	40 %	40 %	157144427
102	NC_009792	GCGCG	2	10	137184	137193	0 %	0 %	60 %	40 %	157144430
103	NC_009792	GGCGC	2	10	138882	138891	0 %	0 %	60 %	40 %	157144431
104	NC_009792	TGGTT	2	10	141450	141459	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009792	TCGTT	2	10	142398	142407	0 %	60 %	20 %	20 %	229593536
106	NC_009792	CGAAC	2	10	142852	142861	40 %	0 %	20 %	40 %	229593536
107	NC_009792	GGGCC	2	10	142885	142894	0 %	0 %	60 %	40 %	229593536
108	NC_009792	GCCGC	2	10	143408	143417	0 %	0 %	40 %	60 %	229593536
109	NC_009792	TTCCG	2	10	143979	143988	0 %	40 %	20 %	40 %	229593536
110	NC_009792	AGCGC	2	10	144118	144127	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009792	CTGCG	2	10	147400	147409	0 %	20 %	40 %	40 %	157144440
112	NC_009792	TGGGC	2	10	147701	147710	0 %	20 %	60 %	20 %	157144440
113	NC_009792	GCGCT	2	10	148029	148038	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009792	CCGTA	2	10	149189	149198	20 %	20 %	20 %	40 %	157144441
115	NC_009792	GCCGC	2	10	149427	149436	0 %	0 %	40 %	60 %	157144441
116	NC_009792	GGGCA	2	10	150182	150191	20 %	0 %	60 %	20 %	157144441
117	NC_009792	AAATA	2	10	152460	152469	80 %	20 %	0 %	0 %	157144444
118	NC_009792	GAAGT	2	10	153449	153458	40 %	20 %	40 %	0 %	157144446
119	NC_009792	TCCGA	2	10	153695	153704	20 %	20 %	20 %	40 %	157144446
120	NC_009792	CCAGG	2	10	154235	154244	20 %	0 %	40 %	40 %	157144447
121	NC_009792	GCGCG	2	10	155470	155479	0 %	0 %	60 %	40 %	157144447
122	NC_009792	TGCCG	2	10	155683	155692	0 %	20 %	40 %	40 %	157144447
123	NC_009792	GTTGC	2	10	156209	156218	0 %	40 %	40 %	20 %	157144448
124	NC_009792	CAGAT	2	10	157077	157086	40 %	20 %	20 %	20 %	157144451
125	NC_009792	GCAAC	2	10	157888	157897	40 %	0 %	20 %	40 %	157144452
126	NC_009792	ATTGC	2	10	159100	159109	20 %	40 %	20 %	20 %	157144453
127	NC_009792	TACCG	2	10	162716	162725	20 %	20 %	20 %	40 %	157144457
128	NC_009792	GTTTT	2	10	162846	162855	0 %	80 %	20 %	0 %	157144457
129	NC_009792	CGGGC	2	10	163405	163414	0 %	0 %	60 %	40 %	157144457
130	NC_009792	CGCGC	2	10	163556	163565	0 %	0 %	40 %	60 %	157144457
131	NC_009792	CTTTT	2	10	165572	165581	0 %	80 %	0 %	20 %	157144461
132	NC_009792	GAGCA	2	10	166044	166053	40 %	0 %	40 %	20 %	157144460
133	NC_009792	GCGCT	2	10	167650	167659	0 %	20 %	40 %	40 %	157144462
134	NC_009792	GCGAA	2	10	170499	170508	40 %	0 %	40 %	20 %	157144465
135	NC_009792	AGAAA	2	10	171040	171049	80 %	0 %	20 %	0 %	157144466
136	NC_009792	GCCGC	2	10	171238	171247	0 %	0 %	40 %	60 %	157144467
137	NC_009792	CTGCT	2	10	171631	171640	0 %	40 %	20 %	40 %	157144467
138	NC_009792	CAGTA	2	10	173177	173186	40 %	20 %	20 %	20 %	157144469
139	NC_009792	GCCGC	2	10	173899	173908	0 %	0 %	40 %	60 %	157144470
140	NC_009792	TCCAG	2	10	178565	178574	20 %	20 %	20 %	40 %	157144474
141	NC_009792	CGTTC	2	10	179946	179955	0 %	40 %	20 %	40 %	157144476
142	NC_009792	ATTTT	2	10	181412	181421	20 %	80 %	0 %	0 %	157144478
143	NC_009792	GGGGC	2	10	181469	181478	0 %	0 %	80 %	20 %	157144478
144	NC_009792	AAGGA	2	10	188654	188663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009792	AGGCC	2	10	193208	193217	20 %	0 %	40 %	40 %	157144483
146	NC_009792	GCTTA	2	10	193919	193928	20 %	40 %	20 %	20 %	157144483
147	NC_009792	GCCAG	2	10	194719	194728	20 %	0 %	40 %	40 %	157144483
148	NC_009792	CGCCC	2	10	196475	196484	0 %	0 %	20 %	80 %	157144486
149	NC_009792	GCGCT	2	10	197398	197407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_009792	GCGCT	2	10	197463	197472	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_009792	GCAAA	2	10	197529	197538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_009792	TCCCA	2	10	197807	197816	20 %	20 %	0 %	60 %	157144487
153	NC_009792	GCCTG	2	10	197834	197843	0 %	20 %	40 %	40 %	157144487
154	NC_009792	TGTGG	2	10	198411	198420	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009792	TTTGG	2	10	203192	203201	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009792	CGCAC	2	10	204064	204073	20 %	0 %	20 %	60 %	157144493
157	NC_009792	TGTAG	2	10	206088	206097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009792	AAACG	2	10	208646	208655	60 %	0 %	20 %	20 %	157144497
159	NC_009792	CGTTT	2	10	210535	210544	0 %	60 %	20 %	20 %	157144498
160	NC_009792	TGCGC	2	10	210747	210756	0 %	20 %	40 %	40 %	157144498
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162	NC_009792	AATAT	2	10	213951	213960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009792	CGCGA	2	10	216017	216026	20 %	0 %	40 %	40 %	157144506
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166	NC_009792	AGCGA	2	10	222721	222730	40 %	0 %	40 %	20 %	157144512
167	NC_009792	GCCGA	2	10	223627	223636	20 %	0 %	40 %	40 %	157144512
168	NC_009792	TGCCT	2	10	224068	224077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_009792	AGCGC	2	10	226566	226575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
170	NC_009792	GACCG	2	10	226689	226698	20 %	0 %	40 %	40 %	157144516
171	NC_009792	TGCGA	2	10	227124	227133	20 %	20 %	40 %	20 %	157144516
172	NC_009792	CCTGG	2	10	227441	227450	0 %	20 %	40 %	40 %	157144516
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174	NC_009792	GTGAT	2	10	236281	236290	20 %	40 %	40 %	0 %	157144522
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176	NC_009792	TCGGC	2	10	236987	236996	0 %	20 %	40 %	40 %	157144524
177	NC_009792	TTGCT	2	10	240217	240226	0 %	60 %	20 %	20 %	157144528
178	NC_009792	ATTAC	2	10	241561	241570	40 %	40 %	0 %	20 %	157144529
179	NC_009792	AAGCG	2	10	242522	242531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_009792	CAACC	2	10	249022	249031	40 %	0 %	0 %	60 %	157144539
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186	NC_009792	CGATC	2	10	257728	257737	20 %	20 %	20 %	40 %	157144544
187	NC_009792	CTGCG	2	10	259009	259018	0 %	20 %	40 %	40 %	157144544
188	NC_009792	GAATA	2	10	259891	259900	60 %	20 %	20 %	0 %	157144549
189	NC_009792	CGGCG	2	10	260388	260397	0 %	0 %	60 %	40 %	157144549
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192	NC_009792	ACCGT	2	10	264418	264427	20 %	20 %	20 %	40 %	157144552
193	NC_009792	TTGTT	2	10	264559	264568	0 %	80 %	20 %	0 %	157144552
194	NC_009792	GTGAA	2	10	272364	272373	40 %	20 %	40 %	0 %	157144559
195	NC_009792	ACCTG	2	10	274340	274349	20 %	20 %	20 %	40 %	157144560
196	NC_009792	TCCAT	2	10	276068	276077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
197	NC_009792	TTATT	2	10	277259	277268	20 %	80 %	0 %	0 %	157144565
198	NC_009792	TGATT	2	10	277919	277928	20 %	60 %	20 %	0 %	157144565
199	NC_009792	GATTT	2	10	282484	282493	20 %	60 %	20 %	0 %	157144567
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201	NC_009792	TGAAA	2	10	285968	285977	60 %	20 %	20 %	0 %	157144572
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207	NC_009792	GCGCT	2	10	295348	295357	0 %	20 %	40 %	40 %	157144582
208	NC_009792	CAGCG	2	10	295767	295776	20 %	0 %	40 %	40 %	157144582
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213	NC_009792	GTGGG	2	10	297310	297319	0 %	20 %	80 %	0 %	157144584
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215	NC_009792	TGGCG	2	10	299316	299325	0 %	20 %	60 %	20 %	157144586
216	NC_009792	GAGGT	2	10	300753	300762	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
217	NC_009792	TGATA	2	10	302846	302855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
218	NC_009792	CGATG	2	10	303371	303380	20 %	20 %	40 %	20 %	157144591
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221	NC_009792	CGCTG	2	10	305081	305090	0 %	20 %	40 %	40 %	157144593
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230	NC_009792	GGTTG	2	10	320853	320862	0 %	40 %	60 %	0 %	157144609
231	NC_009792	AACGG	2	10	322462	322471	40 %	0 %	40 %	20 %	157144612
232	NC_009792	AAGTG	2	10	323325	323334	40 %	20 %	40 %	0 %	157144612
233	NC_009792	ATCCG	2	10	323754	323763	20 %	20 %	20 %	40 %	157144612
234	NC_009792	GCCTG	2	10	326154	326163	0 %	20 %	40 %	40 %	157144615
235	NC_009792	CGCGC	2	10	326529	326538	0 %	0 %	40 %	60 %	157144616
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238	NC_009792	TGCCG	2	10	331507	331516	0 %	20 %	40 %	40 %	157144622
239	NC_009792	CGCGA	2	10	332048	332057	20 %	0 %	40 %	40 %	157144622
240	NC_009792	GCGCT	2	10	332313	332322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
241	NC_009792	TGGCG	2	10	333517	333526	0 %	20 %	60 %	20 %	157144623
242	NC_009792	AGATC	2	10	337030	337039	40 %	20 %	20 %	20 %	157144626
243	NC_009792	TATCG	2	10	341491	341500	20 %	40 %	20 %	20 %	157144632
244	NC_009792	TTTCA	2	10	341542	341551	20 %	60 %	0 %	20 %	157144632
245	NC_009792	TCTGC	2	10	342380	342389	0 %	40 %	20 %	40 %	157144634
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247	NC_009792	TACGG	2	10	343966	343975	20 %	20 %	40 %	20 %	157144636
248	NC_009792	CGGCG	2	10	345469	345478	0 %	0 %	60 %	40 %	157144637
249	NC_009792	GGCGC	2	10	345497	345506	0 %	0 %	60 %	40 %	157144637
250	NC_009792	CGTAA	2	10	348532	348541	40 %	20 %	20 %	20 %	157144640
251	NC_009792	CCAGT	2	10	349951	349960	20 %	20 %	20 %	40 %	157144643
252	NC_009792	AATTT	2	10	350945	350954	40 %	60 %	0 %	0 %	157144644
253	NC_009792	GGTCT	2	10	354001	354010	0 %	40 %	40 %	20 %	157144647
254	NC_009792	GCGCT	2	10	355643	355652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
255	NC_009792	AAGCG	2	10	355688	355697	40 %	0 %	40 %	20 %	157144649
256	NC_009792	ACCGT	2	10	358547	358556	20 %	20 %	20 %	40 %	157144651
257	NC_009792	GAGAG	2	10	358818	358827	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009792	GCCAG	2	10	359437	359446	20 %	0 %	40 %	40 %	157144652
259	NC_009792	AGCGC	2	10	360006	360015	20 %	0 %	40 %	40 %	157144654
260	NC_009792	CTGCT	2	10	360715	360724	0 %	40 %	20 %	40 %	157144656
261	NC_009792	ATCAT	2	10	360959	360968	40 %	40 %	0 %	20 %	157144656
262	NC_009792	GTCAG	2	10	361877	361886	20 %	20 %	40 %	20 %	157144656
263	NC_009792	CGGGC	2	10	363353	363362	0 %	0 %	60 %	40 %	157144659
264	NC_009792	CGCGG	2	10	368541	368550	0 %	0 %	60 %	40 %	157144664
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