MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 chromosome

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009792	TGCTT	2	10	495	504	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009792	AGCGC	2	10	22149	22158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009792	TCCCG	2	10	49185	49194	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_009792	AACAG	2	10	63468	63477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009792	AAGCG	2	10	75594	75603	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009792	AAAAG	2	10	89214	89223	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009792	AAGCG	2	10	93639	93648	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009792	GCGCT	2	10	108887	108896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009792	CGAAC	2	10	109968	109977	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009792	AAGCG	2	10	111553	111562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009792	ATCTG	2	10	121341	121350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009792	TGGTT	2	10	141450	141459	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009792	AGCGC	2	10	144118	144127	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009792	GCGCT	2	10	148029	148038	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009792	AAGGA	2	10	188654	188663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009792	GCGCT	2	10	197398	197407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009792	GCGCT	2	10	197463	197472	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009792	GCAAA	2	10	197529	197538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009792	TGTGG	2	10	198411	198420	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009792	TTTGG	2	10	203192	203201	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009792	TGTAG	2	10	206088	206097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009792	AATAT	2	10	213951	213960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009792	TGCCT	2	10	224068	224077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009792	AGCGC	2	10	226566	226575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009792	AAGCG	2	10	242522	242531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009792	TCCAT	2	10	276068	276077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009792	GAGGT	2	10	300753	300762	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009792	TGATA	2	10	302846	302855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009792	CGTTT	2	10	317827	317836	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009792	GCGCT	2	10	332313	332322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009792	GCGCT	2	10	355643	355652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009792	GAGAG	2	10	358818	358827	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009792	AAGCG	2	10	374259	374268	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009792	GCGCT	2	10	376449	376458	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009792	GCATG	2	10	377471	377480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009792	GCATG	2	10	377586	377595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009792	AAATG	2	10	400447	400456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009792	ATCAA	2	10	428223	428232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009792	TTATT	2	10	431331	431340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009792	AGGGC	2	10	452415	452424	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009792	GCGCT	2	10	459599	459608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009792	GACAG	2	10	459711	459720	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009792	ACTTC	2	10	486074	486083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009792	GCGCT	2	10	513769	513778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009792	AGCGC	2	10	524833	524842	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009792	CCATT	2	10	525704	525713	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009792	AATTG	2	10	586600	586609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009792	TAAAA	2	10	603991	604000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009792	CAGGG	2	10	612395	612404	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009792	CTGCC	2	10	614981	614990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009792	GCGCT	2	10	619806	619815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009792	TTAAA	2	10	620831	620840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009792	GCTGC	2	10	671530	671539	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009792	AAAGG	2	10	673296	673305	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009792	GTTTT	2	10	723001	723010	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009792	CATTA	2	10	800350	800359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009792	TAACA	2	10	800374	800383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009792	CTGTA	2	10	806298	806307	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009792	AAAGG	2	10	843283	843292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009792	GGGGA	2	10	867718	867727	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009792	CCGGG	2	10	885564	885573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009792	TAACA	2	10	922688	922697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009792	TAACA	2	10	927461	927470	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009792	GTCAT	2	10	929438	929447	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009792	ATGTT	2	10	930745	930754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009792	ATCAG	2	10	931257	931266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009792	TAACA	2	10	949957	949966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009792	AATGT	2	10	949967	949976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009792	GGCCA	2	10	982862	982871	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009792	AAAGT	2	10	986071	986080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009792	ATGTT	2	10	986083	986092	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009792	CTGTA	2	10	1004591	1004600	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009792	TTTGC	2	10	1028050	1028059	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009792	TTTAG	2	10	1033935	1033944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009792	CTTAT	2	10	1038568	1038577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009792	TTCTC	2	10	1044720	1044729	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009792	GCGCT	2	10	1063360	1063369	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009792	AAGCG	2	10	1083277	1083286	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009792	AGCGC	2	10	1090365	1090374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009792	TCGAC	2	10	1097121	1097130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009792	AGACC	2	10	1109010	1109019	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009792	AGGCC	2	10	1110480	1110489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009792	AGCGG	2	10	1137037	1137046	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009792	CAATT	2	10	1146340	1146349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009792	GAAAT	2	10	1146366	1146375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009792	TGGCG	2	10	1148081	1148090	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009792	GGCAT	2	10	1157868	1157877	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009792	GAAAA	2	10	1172520	1172529	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009792	CAGCC	2	10	1194169	1194178	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_009792	ACCAG	2	10	1249869	1249878	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009792	ATCGA	2	10	1268922	1268931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009792	TCGAA	2	10	1277886	1277895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009792	GATGA	2	10	1283828	1283837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009792	CCAGA	2	10	1299043	1299052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009792	ACTGT	2	10	1301824	1301833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009792	ATGAC	2	10	1318995	1319004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009792	AGTTA	2	10	1343501	1343510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009792	ATAAA	2	10	1374888	1374897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009792	AATTT	2	10	1374906	1374915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009792	TCCAT	2	10	1381037	1381046	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009792	AAGTT	2	10	1381386	1381395	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009792	CAATT	2	10	1400481	1400490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009792	TGTGA	2	10	1421105	1421114	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009792	TCAGC	2	10	1447192	1447201	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009792	GCTGG	2	10	1465904	1465913	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009792	GTTGG	2	10	1466969	1466978	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009792	GTCCA	2	10	1471382	1471391	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009792	GTCGG	2	10	1472057	1472066	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009792	AAAAC	2	10	1493733	1493742	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009792	AAGTT	2	10	1506779	1506788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009792	CGGGT	2	10	1521165	1521174	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009792	TGATT	2	10	1523563	1523572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009792	ATTAA	2	10	1556566	1556575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009792	TCTCT	2	10	1557916	1557925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009792	GCGCT	2	10	1575120	1575129	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009792	GCGCT	2	10	1575206	1575215	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_009792	TGCTT	2	10	1602053	1602062	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009792	TCGCG	2	10	1648817	1648826	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_009792	AAATG	2	10	1653000	1653009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009792	TGTAG	2	10	1656981	1656990	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009792	AAGCG	2	10	1673192	1673201	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009792	AAGCG	2	10	1685367	1685376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009792	AGCGC	2	10	1703277	1703286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009792	ACTTC	2	10	1709180	1709189	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009792	AAGCG	2	10	1710938	1710947	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009792	TGAGA	2	10	1713048	1713057	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009792	GTCAG	2	10	1718836	1718845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009792	GCCTG	2	10	1722043	1722052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009792	TCGCC	2	10	1723464	1723473	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_009792	CAATG	2	10	1725436	1725445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009792	ACGCC	2	10	1726544	1726553	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_009792	TATAA	2	10	1732764	1732773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009792	ATTAA	2	10	1736638	1736647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009792	GCCGC	2	10	1737834	1737843	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_009792	GTTAT	2	10	1739503	1739512	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009792	GTCTG	2	10	1779404	1779413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009792	GAAAC	2	10	1779811	1779820	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009792	TGAAA	2	10	1787030	1787039	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009792	GCGCT	2	10	1805602	1805611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009792	CTCTT	2	10	1824336	1824345	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009792	AAGCG	2	10	1868967	1868976	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009792	CCTTA	2	10	1880862	1880871	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009792	CCGCC	2	10	1885117	1885126	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
144	NC_009792	CAGGA	2	10	1916282	1916291	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_009792	GCTAT	2	10	2357672	2357681	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_009792	ATATA	2	10	2358822	2358831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_009792	TTTAG	2	10	4645323	4645332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_009792	GCCCG	2	10	4645952	4645961	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
424	NC_009792	AGCGC	2	10	4650486	4650495	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
425	NC_009792	TGATA	2	10	4662032	4662041	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
426	NC_009792	CCGAA	2	10	4673544	4673553	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
427	NC_009792	CGATG	2	10	4682886	4682895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
428	NC_009792	AAATC	2	10	4706314	4706323	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_009792	TCTTT	2	10	4706777	4706786	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
430	NC_009792	AGACG	2	10	4715559	4715568	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.