MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 chromosome

Total Repeats: 2851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009792	GCCCC	2	10	5904	5913	0 %	0 %	20 %	80 %	157144302
2	NC_009792	AGCCA	2	10	6495	6504	40 %	0 %	20 %	40 %	157144302
3	NC_009792	ACCAG	2	10	7557	7566	40 %	0 %	20 %	40 %	157144303
4	NC_009792	GCGCT	2	10	8744	8753	0 %	20 %	40 %	40 %	157144304
5	NC_009792	ACGTC	2	10	10042	10051	20 %	20 %	20 %	40 %	157144306
6	NC_009792	GCGCC	2	10	10824	10833	0 %	0 %	40 %	60 %	157144309
7	NC_009792	GCCCG	2	10	11854	11863	0 %	0 %	40 %	60 %	157144309
8	NC_009792	CAAAA	2	10	12459	12468	80 %	0 %	0 %	20 %	157144308
9	NC_009792	CTGCA	2	10	12903	12912	20 %	20 %	20 %	40 %	157144310
10	NC_009792	CGCCC	2	10	13215	13224	0 %	0 %	20 %	80 %	157144311
11	NC_009792	GCACC	2	10	13346	13355	20 %	0 %	20 %	60 %	157144311
12	NC_009792	TGAAC	2	10	14253	14262	40 %	20 %	20 %	20 %	157144313
13	NC_009792	CGGCG	2	10	15767	15776	0 %	0 %	60 %	40 %	157144314
14	NC_009792	GGCCG	2	10	20089	20098	0 %	0 %	60 %	40 %	157144317
15	NC_009792	CACGC	2	10	20162	20171	20 %	0 %	20 %	60 %	157144317
16	NC_009792	CAGAA	2	10	21578	21587	60 %	0 %	20 %	20 %	157144319
17	NC_009792	CCAGA	2	10	23814	23823	40 %	0 %	20 %	40 %	157144322
18	NC_009792	AAAAT	2	10	25540	25549	80 %	20 %	0 %	0 %	157144323
19	NC_009792	TCATT	2	10	26337	26346	20 %	60 %	0 %	20 %	157144323
20	NC_009792	GGCGG	2	10	32079	32088	0 %	0 %	80 %	20 %	157144328
21	NC_009792	CAGGT	2	10	33218	33227	20 %	20 %	40 %	20 %	157144331
22	NC_009792	GATAC	2	10	33679	33688	40 %	20 %	20 %	20 %	157144332
23	NC_009792	GAAAA	2	10	36587	36596	80 %	0 %	20 %	0 %	157144336
24	NC_009792	AGCGA	2	10	36724	36733	40 %	0 %	40 %	20 %	157144336
25	NC_009792	CAGAC	2	10	38001	38010	40 %	0 %	20 %	40 %	157144337
26	NC_009792	TAACG	2	10	38133	38142	40 %	20 %	20 %	20 %	157144337
27	NC_009792	TTCAG	2	10	38580	38589	20 %	40 %	20 %	20 %	157144337
28	NC_009792	GCTCC	2	10	44659	44668	0 %	20 %	20 %	60 %	157144342
29	NC_009792	AGTAA	2	10	44996	45005	60 %	20 %	20 %	0 %	157144342
30	NC_009792	CAACG	2	10	46293	46302	40 %	0 %	20 %	40 %	157144343
31	NC_009792	AACGG	2	10	47191	47200	40 %	0 %	40 %	20 %	157144344
32	NC_009792	TCCGC	2	10	47669	47678	0 %	20 %	20 %	60 %	157144344
33	NC_009792	CGCAA	2	10	49234	49243	40 %	0 %	20 %	40 %	157144347
34	NC_009792	GCACC	2	10	50187	50196	20 %	0 %	20 %	60 %	157144347
35	NC_009792	AAGCA	2	10	52091	52100	60 %	0 %	20 %	20 %	157144348
36	NC_009792	CGGGG	2	10	52828	52837	0 %	0 %	80 %	20 %	157144350
37	NC_009792	TGGCG	2	10	53446	53455	0 %	20 %	60 %	20 %	157144350
38	NC_009792	TCTGG	2	10	55343	55352	0 %	40 %	40 %	20 %	157144352
39	NC_009792	GCTCA	2	10	56316	56325	20 %	20 %	20 %	40 %	157144355
40	NC_009792	CCCAG	2	10	60243	60252	20 %	0 %	20 %	60 %	157144359
41	NC_009792	ATGCG	2	10	60965	60974	20 %	20 %	40 %	20 %	157144359
42	NC_009792	CAGAC	2	10	61169	61178	40 %	0 %	20 %	40 %	157144360
43	NC_009792	GCCGG	2	10	61521	61530	0 %	0 %	60 %	40 %	157144360
44	NC_009792	CGCGC	2	10	64881	64890	0 %	0 %	40 %	60 %	157144362
45	NC_009792	GTAAT	2	10	66488	66497	40 %	40 %	20 %	0 %	157144363
46	NC_009792	GACCA	2	10	67753	67762	40 %	0 %	20 %	40 %	157144365
47	NC_009792	TTCAC	2	10	70748	70757	20 %	40 %	0 %	40 %	157144369
48	NC_009792	CTGCT	2	10	72444	72453	0 %	40 %	20 %	40 %	157144370
49	NC_009792	CAGAA	2	10	72670	72679	60 %	0 %	20 %	20 %	157144372
50	NC_009792	TGGCC	2	10	72698	72707	0 %	20 %	40 %	40 %	157144372
51	NC_009792	ATCAG	2	10	72894	72903	40 %	20 %	20 %	20 %	157144373
52	NC_009792	AAATT	2	10	74895	74904	60 %	40 %	0 %	0 %	157144376
53	NC_009792	CACGC	2	10	80579	80588	20 %	0 %	20 %	60 %	157144381
54	NC_009792	CACTT	2	10	81006	81015	20 %	40 %	0 %	40 %	157144381
55	NC_009792	GCGTC	2	10	82161	82170	0 %	20 %	40 %	40 %	157144382
56	NC_009792	TGACG	2	10	86370	86379	20 %	20 %	40 %	20 %	157144385
57	NC_009792	CAACC	2	10	88508	88517	40 %	0 %	0 %	60 %	157144387
58	NC_009792	TGCGC	2	10	88907	88916	0 %	20 %	40 %	40 %	157144387
59	NC_009792	TGATG	2	10	88940	88949	20 %	40 %	40 %	0 %	157144387
60	NC_009792	CGAGC	2	10	92331	92340	20 %	0 %	40 %	40 %	157144390
61	NC_009792	TAATT	2	10	99407	99416	40 %	60 %	0 %	0 %	157144394
62	NC_009792	ATCGA	2	10	100816	100825	40 %	20 %	20 %	20 %	157144396
63	NC_009792	AAACG	2	10	103073	103082	60 %	0 %	20 %	20 %	157144398
64	NC_009792	GCACT	2	10	104554	104563	20 %	20 %	20 %	40 %	157144400
65	NC_009792	CGATG	2	10	104889	104898	20 %	20 %	40 %	20 %	157144400
66	NC_009792	CGGTC	2	10	105303	105312	0 %	20 %	40 %	40 %	157144400
67	NC_009792	GATCA	2	10	105934	105943	40 %	20 %	20 %	20 %	157144401
68	NC_009792	CCGGC	2	10	106811	106820	0 %	0 %	40 %	60 %	157144401
69	NC_009792	GGGCA	2	10	107811	107820	20 %	0 %	60 %	20 %	157144402
70	NC_009792	GCGAT	2	10	108118	108127	20 %	20 %	40 %	20 %	157144402
71	NC_009792	CCGTT	2	10	108401	108410	0 %	40 %	20 %	40 %	157144402
72	NC_009792	GGCAA	2	10	109321	109330	40 %	0 %	40 %	20 %	157144403
73	NC_009792	CATCG	2	10	109448	109457	20 %	20 %	20 %	40 %	157144403
74	NC_009792	ACGGT	2	10	109683	109692	20 %	20 %	40 %	20 %	157144403
75	NC_009792	CGGCG	2	10	110383	110392	0 %	0 %	60 %	40 %	157144404
76	NC_009792	ATGAA	2	10	111231	111240	60 %	20 %	20 %	0 %	157144404
77	NC_009792	CTTCT	2	10	111841	111850	0 %	60 %	0 %	40 %	157144407
78	NC_009792	TGAAA	2	10	114566	114575	60 %	20 %	20 %	0 %	157144411
79	NC_009792	GGCGC	2	10	115132	115141	0 %	0 %	60 %	40 %	157144411
80	NC_009792	CGGCC	2	10	115622	115631	0 %	0 %	40 %	60 %	157144411
81	NC_009792	GGACA	2	10	117613	117622	40 %	0 %	40 %	20 %	157144412
82	NC_009792	CAGGC	2	10	118130	118139	20 %	0 %	40 %	40 %	157144413
83	NC_009792	AGGCC	2	10	118857	118866	20 %	0 %	40 %	40 %	157144413
84	NC_009792	CCTGC	2	10	119055	119064	0 %	20 %	20 %	60 %	157144413
85	NC_009792	TTCTG	2	10	119183	119192	0 %	60 %	20 %	20 %	157144413
86	NC_009792	CGGCG	2	10	120927	120936	0 %	0 %	60 %	40 %	157144415
87	NC_009792	TACGC	2	10	124295	124304	20 %	20 %	20 %	40 %	157144418
88	NC_009792	CAGGT	2	10	125346	125355	20 %	20 %	40 %	20 %	157144419
89	NC_009792	CGTTT	2	10	126497	126506	0 %	60 %	20 %	20 %	157144420
90	NC_009792	AGCCG	2	10	134227	134236	20 %	0 %	40 %	40 %	157144427
91	NC_009792	GCGCG	2	10	137184	137193	0 %	0 %	60 %	40 %	157144430
92	NC_009792	GGCGC	2	10	138882	138891	0 %	0 %	60 %	40 %	157144431
93	NC_009792	TCGTT	2	10	142398	142407	0 %	60 %	20 %	20 %	229593536
94	NC_009792	CGAAC	2	10	142852	142861	40 %	0 %	20 %	40 %	229593536
95	NC_009792	GGGCC	2	10	142885	142894	0 %	0 %	60 %	40 %	229593536
96	NC_009792	GCCGC	2	10	143408	143417	0 %	0 %	40 %	60 %	229593536
97	NC_009792	TTCCG	2	10	143979	143988	0 %	40 %	20 %	40 %	229593536
98	NC_009792	CTGCG	2	10	147400	147409	0 %	20 %	40 %	40 %	157144440
99	NC_009792	TGGGC	2	10	147701	147710	0 %	20 %	60 %	20 %	157144440
100	NC_009792	CCGTA	2	10	149189	149198	20 %	20 %	20 %	40 %	157144441
101	NC_009792	GCCGC	2	10	149427	149436	0 %	0 %	40 %	60 %	157144441
102	NC_009792	GGGCA	2	10	150182	150191	20 %	0 %	60 %	20 %	157144441
103	NC_009792	AAATA	2	10	152460	152469	80 %	20 %	0 %	0 %	157144444
104	NC_009792	GAAGT	2	10	153449	153458	40 %	20 %	40 %	0 %	157144446
105	NC_009792	TCCGA	2	10	153695	153704	20 %	20 %	20 %	40 %	157144446
106	NC_009792	CCAGG	2	10	154235	154244	20 %	0 %	40 %	40 %	157144447
107	NC_009792	GCGCG	2	10	155470	155479	0 %	0 %	60 %	40 %	157144447
108	NC_009792	TGCCG	2	10	155683	155692	0 %	20 %	40 %	40 %	157144447
109	NC_009792	GTTGC	2	10	156209	156218	0 %	40 %	40 %	20 %	157144448
110	NC_009792	CAGAT	2	10	157077	157086	40 %	20 %	20 %	20 %	157144451
111	NC_009792	GCAAC	2	10	157888	157897	40 %	0 %	20 %	40 %	157144452
112	NC_009792	ATTGC	2	10	159100	159109	20 %	40 %	20 %	20 %	157144453
113	NC_009792	TACCG	2	10	162716	162725	20 %	20 %	20 %	40 %	157144457
114	NC_009792	GTTTT	2	10	162846	162855	0 %	80 %	20 %	0 %	157144457
115	NC_009792	CGGGC	2	10	163405	163414	0 %	0 %	60 %	40 %	157144457
116	NC_009792	CGCGC	2	10	163556	163565	0 %	0 %	40 %	60 %	157144457
117	NC_009792	CTTTT	2	10	165572	165581	0 %	80 %	0 %	20 %	157144461
118	NC_009792	GAGCA	2	10	166044	166053	40 %	0 %	40 %	20 %	157144460
119	NC_009792	GCGCT	2	10	167650	167659	0 %	20 %	40 %	40 %	157144462
120	NC_009792	GCGAA	2	10	170499	170508	40 %	0 %	40 %	20 %	157144465
121	NC_009792	AGAAA	2	10	171040	171049	80 %	0 %	20 %	0 %	157144466
122	NC_009792	GCCGC	2	10	171238	171247	0 %	0 %	40 %	60 %	157144467
123	NC_009792	CTGCT	2	10	171631	171640	0 %	40 %	20 %	40 %	157144467
124	NC_009792	CAGTA	2	10	173177	173186	40 %	20 %	20 %	20 %	157144469
125	NC_009792	GCCGC	2	10	173899	173908	0 %	0 %	40 %	60 %	157144470
126	NC_009792	TCCAG	2	10	178565	178574	20 %	20 %	20 %	40 %	157144474
127	NC_009792	CGTTC	2	10	179946	179955	0 %	40 %	20 %	40 %	157144476
128	NC_009792	ATTTT	2	10	181412	181421	20 %	80 %	0 %	0 %	157144478
129	NC_009792	GGGGC	2	10	181469	181478	0 %	0 %	80 %	20 %	157144478
130	NC_009792	AGGCC	2	10	193208	193217	20 %	0 %	40 %	40 %	157144483
131	NC_009792	GCTTA	2	10	193919	193928	20 %	40 %	20 %	20 %	157144483
132	NC_009792	GCCAG	2	10	194719	194728	20 %	0 %	40 %	40 %	157144483
133	NC_009792	CGCCC	2	10	196475	196484	0 %	0 %	20 %	80 %	157144486
134	NC_009792	TCCCA	2	10	197807	197816	20 %	20 %	0 %	60 %	157144487
135	NC_009792	GCCTG	2	10	197834	197843	0 %	20 %	40 %	40 %	157144487
136	NC_009792	CGCAC	2	10	204064	204073	20 %	0 %	20 %	60 %	157144493
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146	NC_009792	GACCG	2	10	226689	226698	20 %	0 %	40 %	40 %	157144516
147	NC_009792	TGCGA	2	10	227124	227133	20 %	20 %	40 %	20 %	157144516
148	NC_009792	CCTGG	2	10	227441	227450	0 %	20 %	40 %	40 %	157144516
149	NC_009792	TGCGC	2	10	231928	231937	0 %	20 %	40 %	40 %	157144520
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164	NC_009792	CGGCG	2	10	260388	260397	0 %	0 %	60 %	40 %	157144549
165	NC_009792	GGAAC	2	10	260773	260782	40 %	0 %	40 %	20 %	157144549
166	NC_009792	CGGGC	2	10	263320	263329	0 %	0 %	60 %	40 %	157144551
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172	NC_009792	TGATT	2	10	277919	277928	20 %	60 %	20 %	0 %	157144565
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251	NC_009792	CGGGA	2	10	406582	406591	20 %	0 %	60 %	20 %	157144700
252	NC_009792	ACGCT	2	10	406725	406734	20 %	20 %	20 %	40 %	157144700
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260	NC_009792	GTTCT	2	10	419097	419106	0 %	60 %	20 %	20 %	157144711
261	NC_009792	GGTTC	2	10	420269	420278	0 %	40 %	40 %	20 %	157144711
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