MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	GCCGGA	2	12	4014	4025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149560
2	NC_009790	AGCCGC	2	12	7564	7575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009790	GTGGCG	2	12	8659	8670	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157149555
4	NC_009790	GCCGGA	2	12	8910	8921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149555
5	NC_009790	CACTGG	2	12	10313	10324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157149506
6	NC_009790	TGGCAG	2	12	10989	11000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149554
7	NC_009790	GCAGAA	2	12	15398	15409	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009790	GCGACA	2	12	19582	19593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009790	TCAGCA	2	12	30485	30496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157149546
10	NC_009790	TACCGC	2	12	30915	30926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157149546
11	NC_009790	CTGCTA	3	18	31794	31811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009790	GTCTTC	2	12	39404	39415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157149568
13	NC_009790	AGGTGC	2	12	39685	39696	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149568
14	NC_009790	GTTCGA	2	12	42510	42521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157149536
15	NC_009790	ACTTAT	2	12	43309	43320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157149525
16	NC_009790	GAGTTT	2	12	44107	44118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009790	GCCGGA	2	12	44740	44751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149569
18	NC_009790	GATGGA	2	12	47793	47804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157149572
19	NC_009790	AAATAT	2	12	49554	49565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149562
20	NC_009790	TAACAA	3	18	50874	50891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157149562
21	NC_009790	AAATGA	2	12	50928	50939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157149562
22	NC_009790	AAAGAC	2	12	53086	53097	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157149562
23	NC_009790	ACAGAA	2	12	54498	54509	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009790	ATCAGT	2	12	64094	64105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009790	AGTTCC	2	12	64520	64531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009790	GTCTTC	2	12	66008	66019	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157149542
27	NC_009790	AGGTGC	2	12	66289	66300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149542
28	NC_009790	GAAGAT	2	12	67707	67718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157149539
29	NC_009790	TCAGTA	2	12	69255	69266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009790	CTGACG	2	12	71781	71792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157149563
31	NC_009790	AACAGA	2	12	72466	72477	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.