MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CCTGT	2	10	628	637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009790	GCCCC	2	10	784	793	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_009790	AAATC	2	10	2058	2067	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009790	GAGGG	2	10	2719	2728	20 %	0 %	80 %	0 %	157149551
5	NC_009790	AATTT	2	10	3425	3434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009790	GTCTG	2	10	3481	3490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009790	GAACG	2	10	4510	4519	40 %	0 %	40 %	20 %	157149541
8	NC_009790	GATGT	2	10	4982	4991	20 %	40 %	40 %	0 %	157149509
9	NC_009790	CCGGA	2	10	5458	5467	20 %	0 %	40 %	40 %	157149509
10	NC_009790	CCGCC	2	10	9925	9934	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_009790	ACTGA	2	10	9973	9982	40 %	20 %	20 %	20 %	157149506
12	NC_009790	GCAGA	2	10	10803	10812	40 %	0 %	40 %	20 %	157149554
13	NC_009790	ATCAC	2	10	11783	11792	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009790	AACAA	2	10	13536	13545	80 %	0 %	0 %	20 %	157149565
15	NC_009790	CGTGT	2	10	14595	14604	0 %	40 %	40 %	20 %	157149565
16	NC_009790	GGCAA	2	10	14770	14779	40 %	0 %	40 %	20 %	157149565
17	NC_009790	TACTC	2	10	14974	14983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009790	TGGCG	2	10	15857	15866	0 %	20 %	60 %	20 %	157149567
19	NC_009790	AGTTC	2	10	16513	16522	20 %	40 %	20 %	20 %	157149567
20	NC_009790	ACCTT	2	10	17099	17108	20 %	40 %	0 %	40 %	157149521
21	NC_009790	CCCGT	2	10	18370	18379	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009790	GCCGC	2	10	18420	18429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_009790	ACGCC	2	10	19225	19234	20 %	0 %	20 %	60 %	157149535
24	NC_009790	GAGTA	2	10	23168	23177	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009790	ACACG	2	10	23547	23556	40 %	0 %	20 %	40 %	157149507
26	NC_009790	TTGTT	2	10	24606	24615	0 %	80 %	20 %	0 %	157149507
27	NC_009790	TGTAC	2	10	27761	27770	20 %	40 %	20 %	20 %	157149549
28	NC_009790	GGAAG	2	10	28437	28446	40 %	0 %	60 %	0 %	157149550
29	NC_009790	GGCGG	2	10	28624	28633	0 %	0 %	80 %	20 %	157149550
30	NC_009790	CCGGG	2	10	29844	29853	0 %	0 %	60 %	40 %	157149546
31	NC_009790	TGGCG	2	10	34386	34395	0 %	20 %	60 %	20 %	157149559
32	NC_009790	AGTTC	2	10	35042	35051	20 %	40 %	20 %	20 %	157149559
33	NC_009790	ACCTT	2	10	35628	35637	20 %	40 %	0 %	40 %	157149531
34	NC_009790	GTGAT	2	10	38355	38364	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009790	CCGAA	2	10	38823	38832	40 %	0 %	20 %	40 %	157149568
36	NC_009790	CAGCC	2	10	38901	38910	20 %	0 %	20 %	60 %	157149568
37	NC_009790	GATAA	2	10	41676	41685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009790	GCACT	2	10	42586	42595	20 %	20 %	20 %	40 %	157149536
39	NC_009790	GTCTG	2	10	44207	44216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009790	GAACG	2	10	45236	45245	40 %	0 %	40 %	20 %	157149526
41	NC_009790	GATGT	2	10	45708	45717	20 %	40 %	40 %	0 %	157149558
42	NC_009790	CCGGA	2	10	46184	46193	20 %	0 %	40 %	40 %	157149558
43	NC_009790	CGCCA	2	10	46995	47004	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_009790	ATCAC	2	10	47504	47513	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009790	CAAAC	2	10	48884	48893	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009790	TTTTA	2	10	49191	49200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009790	ATATA	2	10	53358	53367	60 %	40 %	0 %	0 %	157149562
48	NC_009790	AAGCG	2	10	58208	58217	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009790	GGCCA	2	10	58806	58815	20 %	0 %	40 %	40 %	157149520
50	NC_009790	CAGAA	2	10	58947	58956	60 %	0 %	20 %	20 %	157149520
51	NC_009790	CACTG	2	10	59269	59278	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009790	AAATG	2	10	59622	59631	60 %	20 %	20 %	0 %	157149519
53	NC_009790	TTCAC	2	10	60005	60014	20 %	40 %	0 %	40 %	157149519
54	NC_009790	CCGAA	2	10	65427	65436	40 %	0 %	20 %	40 %	157149542
55	NC_009790	CAGCC	2	10	65505	65514	20 %	0 %	20 %	60 %	157149542
56	NC_009790	ATGGC	2	10	67967	67976	20 %	20 %	40 %	20 %	157149571
57	NC_009790	ATAAA	2	10	68556	68565	80 %	20 %	0 %	0 %	157149524
58	NC_009790	GGCAG	2	10	69974	69983	20 %	0 %	60 %	20 %	157149556
59	NC_009790	GTGAT	2	10	71752	71761	20 %	40 %	40 %	0 %	157149563
60	NC_009790	AGAGG	2	10	72093	72102	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009790	AGTCT	2	10	72137	72146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009790	GTGTT	2	10	72716	72725	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009790	TCATT	2	10	72953	72962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009790	TAAAG	2	10	73357	73366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009790	ACTTT	2	10	73367	73376	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.