MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CCTGT	2	10	628	637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009790	GCCCC	2	10	784	793	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_009790	AAATC	2	10	2058	2067	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009790	AATTT	2	10	3425	3434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009790	GTCTG	2	10	3481	3490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009790	CCGCC	2	10	9925	9934	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_009790	ATCAC	2	10	11783	11792	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009790	TACTC	2	10	14974	14983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009790	CCCGT	2	10	18370	18379	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_009790	GCCGC	2	10	18420	18429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009790	GAGTA	2	10	23168	23177	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009790	GTGAT	2	10	38355	38364	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009790	GATAA	2	10	41676	41685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009790	GTCTG	2	10	44207	44216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009790	CGCCA	2	10	46995	47004	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009790	ATCAC	2	10	47504	47513	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009790	CAAAC	2	10	48884	48893	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009790	TTTTA	2	10	49191	49200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009790	AAGCG	2	10	58208	58217	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009790	CACTG	2	10	59269	59278	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009790	AGAGG	2	10	72093	72102	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009790	AGTCT	2	10	72137	72146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009790	GTGTT	2	10	72716	72725	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009790	TCATT	2	10	72953	72962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009790	TAAAG	2	10	73357	73366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009790	ACTTT	2	10	73367	73376	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.