MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CAGA	2	8	54	61	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009790	CATT	2	8	598	605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009790	GACA	2	8	639	646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009790	CCCT	2	8	761	768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009790	CTGG	2	8	868	875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009790	TCAG	2	8	1319	1326	25 %	25 %	25 %	25 %	157149552
7	NC_009790	ATCC	2	8	1505	1512	25 %	25 %	0 %	50 %	157149552
8	NC_009790	GCCC	2	8	2083	2090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_009790	TATC	2	8	2242	2249	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
10	NC_009790	CAAA	2	8	2250	2257	75 %	0 %	0 %	25 %	157149551
11	NC_009790	AGTG	2	8	3108	3115	25 %	25 %	50 %	0 %	157149551
12	NC_009790	GGCT	2	8	3123	3130	0 %	25 %	50 %	25 %	157149551
13	NC_009790	TTAC	2	8	3323	3330	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
14	NC_009790	ATAA	2	8	3342	3349	75 %	25 %	0 %	0 %	157149551
15	NC_009790	TGCC	2	8	3726	3733	0 %	25 %	25 %	50 %	157149560
16	NC_009790	GCCG	2	8	4104	4111	0 %	0 %	50 %	50 %	157149560
17	NC_009790	CTGG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	50 %	25 %	157149541
18	NC_009790	CGCC	2	8	4584	4591	0 %	0 %	25 %	75 %	157149509
19	NC_009790	CCGG	2	8	4929	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	157149509
20	NC_009790	CCTG	2	8	4951	4958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149509
21	NC_009790	ATCC	2	8	5473	5480	25 %	25 %	0 %	50 %	157149509
22	NC_009790	TGCA	2	8	5612	5619	25 %	25 %	25 %	25 %	157149509
23	NC_009790	CAGC	2	8	6378	6385	25 %	0 %	25 %	50 %	157149505
24	NC_009790	GCAA	2	8	6402	6409	50 %	0 %	25 %	25 %	157149505
25	NC_009790	TGAT	2	8	6933	6940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009790	AGAA	2	8	7321	7328	75 %	0 %	25 %	0 %	157149518
27	NC_009790	TCGA	2	8	7588	7595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009790	TGAT	2	8	7703	7710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009790	TTCC	2	8	8324	8331	0 %	50 %	0 %	50 %	157149529
30	NC_009790	GAAC	2	8	8955	8962	50 %	0 %	25 %	25 %	157149555
31	NC_009790	ACGC	2	8	9252	9259	25 %	0 %	25 %	50 %	157149555
32	NC_009790	GTCA	2	8	9431	9438	25 %	25 %	25 %	25 %	157149555
33	NC_009790	CTGG	2	8	9833	9840	0 %	25 %	50 %	25 %	157149555
34	NC_009790	CAGA	2	8	10842	10849	50 %	0 %	25 %	25 %	157149554
35	NC_009790	GGCG	2	8	11556	11563	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009790	CCTT	2	8	11838	11845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009790	GGAA	2	8	12524	12531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009790	TTAC	2	8	12703	12710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009790	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009790	GTCT	2	8	12759	12766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009790	GCAA	2	8	13139	13146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009790	CAGG	2	8	13190	13197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009790	GCTG	2	8	13251	13258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009790	TGGC	2	8	13467	13474	0 %	25 %	50 %	25 %	157149565
45	NC_009790	CTGG	2	8	14621	14628	0 %	25 %	50 %	25 %	157149565
46	NC_009790	CCAT	2	8	15132	15139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009790	GTGG	2	8	15340	15347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009790	CGAT	2	8	16368	16375	25 %	25 %	25 %	25 %	157149567
49	NC_009790	CTGG	2	8	16378	16385	0 %	25 %	50 %	25 %	157149567
50	NC_009790	CTGA	2	8	16654	16661	25 %	25 %	25 %	25 %	157149521
51	NC_009790	CAAC	2	8	17699	17706	50 %	0 %	0 %	50 %	157149521
52	NC_009790	CAAT	2	8	18053	18060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009790	GCCC	2	8	18494	18501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009790	GCCA	2	8	18653	18660	25 %	0 %	25 %	50 %	157149535
55	NC_009790	TGAA	2	8	18775	18782	50 %	25 %	25 %	0 %	157149535
56	NC_009790	CAGC	2	8	19188	19195	25 %	0 %	25 %	50 %	157149535
57	NC_009790	ATAC	2	8	19413	19420	50 %	25 %	0 %	25 %	157149535
58	NC_009790	CAGC	2	8	20449	20456	25 %	0 %	25 %	50 %	157149553
59	NC_009790	ATTC	2	8	20476	20483	25 %	50 %	0 %	25 %	157149553
60	NC_009790	CAGT	2	8	20701	20708	25 %	25 %	25 %	25 %	157149553
61	NC_009790	AGGA	2	8	21576	21583	50 %	0 %	50 %	0 %	157149534
62	NC_009790	AGCG	2	8	22365	22372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009790	CCAC	2	8	22804	22811	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_009790	GATG	2	8	23011	23018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009790	GACG	2	8	23025	23032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009790	GCCA	2	8	23522	23529	25 %	0 %	25 %	50 %	157149507
67	NC_009790	CAGC	2	8	24675	24682	25 %	0 %	25 %	50 %	157149507
68	NC_009790	GCCA	2	8	24891	24898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009790	CCTG	2	8	24954	24961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009790	CTTG	2	8	25004	25011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009790	CAGA	2	8	25384	25391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009790	GCCC	2	8	25416	25423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009790	GTAA	2	8	25441	25448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009790	CCAC	2	8	25455	25462	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009790	TTCC	2	8	25620	25627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009790	CTGG	2	8	26421	26428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009790	AAAG	2	8	26593	26600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009790	TTTC	2	8	26733	26740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009790	GCGT	2	8	26860	26867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009790	AATC	2	8	26966	26973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009790	GATA	2	8	26978	26985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009790	TTAA	2	8	27066	27073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009790	GCAG	2	8	28051	28058	25 %	0 %	50 %	25 %	157149549
84	NC_009790	TGCC	2	8	28846	28853	0 %	25 %	25 %	50 %	157149550
85	NC_009790	ACTG	2	8	28914	28921	25 %	25 %	25 %	25 %	157149550
86	NC_009790	ATTT	2	8	29146	29153	25 %	75 %	0 %	0 %	157149538
87	NC_009790	GTCA	2	8	29185	29192	25 %	25 %	25 %	25 %	157149538
88	NC_009790	AGTA	2	8	29366	29373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009790	CGCT	2	8	29902	29909	0 %	25 %	25 %	50 %	157149546
90	NC_009790	CCCG	2	8	30014	30021	0 %	0 %	25 %	75 %	157149546
91	NC_009790	GCCA	2	8	30774	30781	25 %	0 %	25 %	50 %	157149546
92	NC_009790	CAGT	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	157149513
93	NC_009790	GTCT	2	8	31489	31496	0 %	50 %	25 %	25 %	157149513
94	NC_009790	CTGT	2	8	31842	31849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009790	CGGG	2	8	31893	31900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009790	ACTG	2	8	32184	32191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009790	ATTT	2	8	33376	33383	25 %	75 %	0 %	0 %	157149537
98	NC_009790	CGAT	2	8	34897	34904	25 %	25 %	25 %	25 %	157149559
99	NC_009790	CTGG	2	8	34907	34914	0 %	25 %	50 %	25 %	157149559
100	NC_009790	CTGA	2	8	35183	35190	25 %	25 %	25 %	25 %	157149531
101	NC_009790	CAAC	2	8	36228	36235	50 %	0 %	0 %	50 %	157149531
102	NC_009790	CCAG	2	8	36515	36522	25 %	0 %	25 %	50 %	157149557
103	NC_009790	TTTA	2	8	37515	37522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009790	ATAA	2	8	37758	37765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009790	ATCA	2	8	37858	37865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009790	TATT	2	8	37887	37894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009790	GGAT	2	8	39302	39309	25 %	25 %	50 %	0 %	157149568
108	NC_009790	GTCA	2	8	39469	39476	25 %	25 %	25 %	25 %	157149568
109	NC_009790	GCCG	2	8	39573	39580	0 %	0 %	50 %	50 %	157149568
110	NC_009790	GCGA	2	8	40706	40713	25 %	0 %	50 %	25 %	157149511
111	NC_009790	ACGG	2	8	41056	41063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009790	GCAT	2	8	41292	41299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009790	GAAC	2	8	41326	41333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009790	CAGC	2	8	41913	41920	25 %	0 %	25 %	50 %	157149532
115	NC_009790	GCAA	2	8	41937	41944	50 %	0 %	25 %	25 %	157149532
116	NC_009790	GAAA	2	8	42477	42484	75 %	0 %	25 %	0 %	157149536
117	NC_009790	TCGC	2	8	42951	42958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149536
118	NC_009790	AAGT	2	8	43111	43118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009790	GTCA	2	8	43220	43227	25 %	25 %	25 %	25 %	157149525
120	NC_009790	TGCC	2	8	44452	44459	0 %	25 %	25 %	50 %	157149569
121	NC_009790	GCCG	2	8	44830	44837	0 %	0 %	50 %	50 %	157149569
122	NC_009790	CTGG	2	8	44946	44953	0 %	25 %	50 %	25 %	157149526
123	NC_009790	CGCC	2	8	45310	45317	0 %	0 %	25 %	75 %	157149558
124	NC_009790	CCGG	2	8	45655	45662	0 %	0 %	50 %	50 %	157149558
125	NC_009790	CCTG	2	8	45677	45684	0 %	25 %	25 %	50 %	157149558
126	NC_009790	ATCC	2	8	46199	46206	25 %	25 %	0 %	50 %	157149558
127	NC_009790	TGCA	2	8	46338	46345	25 %	25 %	25 %	25 %	157149558
128	NC_009790	GCCA	2	8	47307	47314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009790	CAGC	2	8	47440	47447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009790	GCGG	2	8	47598	47605	0 %	0 %	75 %	25 %	157149572
131	NC_009790	CTCC	2	8	48021	48028	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009790	TTTA	2	8	48693	48700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009790	TTAT	2	8	49245	49252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009790	TAAA	2	8	50090	50097	75 %	25 %	0 %	0 %	157149562
135	NC_009790	CATG	2	8	50346	50353	25 %	25 %	25 %	25 %	157149562
136	NC_009790	GGCT	2	8	50445	50452	0 %	25 %	50 %	25 %	157149562
137	NC_009790	CAAG	2	8	50694	50701	50 %	0 %	25 %	25 %	157149562
138	NC_009790	TACT	2	8	51021	51028	25 %	50 %	0 %	25 %	157149562
139	NC_009790	ACTG	2	8	51750	51757	25 %	25 %	25 %	25 %	157149562
140	NC_009790	TCCT	2	8	52552	52559	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
141	NC_009790	CAGA	2	8	52703	52710	50 %	0 %	25 %	25 %	157149562
142	NC_009790	ACAG	2	8	52762	52769	50 %	0 %	25 %	25 %	157149562
143	NC_009790	GTAG	2	8	53131	53138	25 %	25 %	50 %	0 %	157149562
144	NC_009790	TAAT	2	8	53574	53581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009790	ATTT	2	8	53585	53592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009790	CTCA	2	8	53959	53966	25 %	25 %	0 %	50 %	157149523
147	NC_009790	GAAA	2	8	54017	54024	75 %	0 %	25 %	0 %	157149523
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.