MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	TCAG	2	8	1319	1326	25 %	25 %	25 %	25 %	157149552
2	NC_009790	ATCC	2	8	1505	1512	25 %	25 %	0 %	50 %	157149552
3	NC_009790	TATC	2	8	2242	2249	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
4	NC_009790	CAAA	2	8	2250	2257	75 %	0 %	0 %	25 %	157149551
5	NC_009790	AGTG	2	8	3108	3115	25 %	25 %	50 %	0 %	157149551
6	NC_009790	GGCT	2	8	3123	3130	0 %	25 %	50 %	25 %	157149551
7	NC_009790	TTAC	2	8	3323	3330	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
8	NC_009790	ATAA	2	8	3342	3349	75 %	25 %	0 %	0 %	157149551
9	NC_009790	TGCC	2	8	3726	3733	0 %	25 %	25 %	50 %	157149560
10	NC_009790	GCCG	2	8	4104	4111	0 %	0 %	50 %	50 %	157149560
11	NC_009790	CTGG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	50 %	25 %	157149541
12	NC_009790	CGCC	2	8	4584	4591	0 %	0 %	25 %	75 %	157149509
13	NC_009790	CCGG	2	8	4929	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	157149509
14	NC_009790	CCTG	2	8	4951	4958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149509
15	NC_009790	ATCC	2	8	5473	5480	25 %	25 %	0 %	50 %	157149509
16	NC_009790	TGCA	2	8	5612	5619	25 %	25 %	25 %	25 %	157149509
17	NC_009790	CAGC	2	8	6378	6385	25 %	0 %	25 %	50 %	157149505
18	NC_009790	GCAA	2	8	6402	6409	50 %	0 %	25 %	25 %	157149505
19	NC_009790	AGAA	2	8	7321	7328	75 %	0 %	25 %	0 %	157149518
20	NC_009790	TTCC	2	8	8324	8331	0 %	50 %	0 %	50 %	157149529
21	NC_009790	GAAC	2	8	8955	8962	50 %	0 %	25 %	25 %	157149555
22	NC_009790	ACGC	2	8	9252	9259	25 %	0 %	25 %	50 %	157149555
23	NC_009790	GTCA	2	8	9431	9438	25 %	25 %	25 %	25 %	157149555
24	NC_009790	CTGG	2	8	9833	9840	0 %	25 %	50 %	25 %	157149555
25	NC_009790	CAGA	2	8	10842	10849	50 %	0 %	25 %	25 %	157149554
26	NC_009790	TGGC	2	8	13467	13474	0 %	25 %	50 %	25 %	157149565
27	NC_009790	CTGG	2	8	14621	14628	0 %	25 %	50 %	25 %	157149565
28	NC_009790	CGAT	2	8	16368	16375	25 %	25 %	25 %	25 %	157149567
29	NC_009790	CTGG	2	8	16378	16385	0 %	25 %	50 %	25 %	157149567
30	NC_009790	CTGA	2	8	16654	16661	25 %	25 %	25 %	25 %	157149521
31	NC_009790	CAAC	2	8	17699	17706	50 %	0 %	0 %	50 %	157149521
32	NC_009790	GCCA	2	8	18653	18660	25 %	0 %	25 %	50 %	157149535
33	NC_009790	TGAA	2	8	18775	18782	50 %	25 %	25 %	0 %	157149535
34	NC_009790	CAGC	2	8	19188	19195	25 %	0 %	25 %	50 %	157149535
35	NC_009790	ATAC	2	8	19413	19420	50 %	25 %	0 %	25 %	157149535
36	NC_009790	CAGC	2	8	20449	20456	25 %	0 %	25 %	50 %	157149553
37	NC_009790	ATTC	2	8	20476	20483	25 %	50 %	0 %	25 %	157149553
38	NC_009790	CAGT	2	8	20701	20708	25 %	25 %	25 %	25 %	157149553
39	NC_009790	AGGA	2	8	21576	21583	50 %	0 %	50 %	0 %	157149534
40	NC_009790	GCCA	2	8	23522	23529	25 %	0 %	25 %	50 %	157149507
41	NC_009790	CAGC	2	8	24675	24682	25 %	0 %	25 %	50 %	157149507
42	NC_009790	GCAG	2	8	28051	28058	25 %	0 %	50 %	25 %	157149549
43	NC_009790	TGCC	2	8	28846	28853	0 %	25 %	25 %	50 %	157149550
44	NC_009790	ACTG	2	8	28914	28921	25 %	25 %	25 %	25 %	157149550
45	NC_009790	ATTT	2	8	29146	29153	25 %	75 %	0 %	0 %	157149538
46	NC_009790	GTCA	2	8	29185	29192	25 %	25 %	25 %	25 %	157149538
47	NC_009790	CGCT	2	8	29902	29909	0 %	25 %	25 %	50 %	157149546
48	NC_009790	CCCG	2	8	30014	30021	0 %	0 %	25 %	75 %	157149546
49	NC_009790	GCCA	2	8	30774	30781	25 %	0 %	25 %	50 %	157149546
50	NC_009790	CAGT	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	157149513
51	NC_009790	GTCT	2	8	31489	31496	0 %	50 %	25 %	25 %	157149513
52	NC_009790	ATTT	2	8	33376	33383	25 %	75 %	0 %	0 %	157149537
53	NC_009790	CGAT	2	8	34897	34904	25 %	25 %	25 %	25 %	157149559
54	NC_009790	CTGG	2	8	34907	34914	0 %	25 %	50 %	25 %	157149559
55	NC_009790	CTGA	2	8	35183	35190	25 %	25 %	25 %	25 %	157149531
56	NC_009790	CAAC	2	8	36228	36235	50 %	0 %	0 %	50 %	157149531
57	NC_009790	CCAG	2	8	36515	36522	25 %	0 %	25 %	50 %	157149557
58	NC_009790	GGAT	2	8	39302	39309	25 %	25 %	50 %	0 %	157149568
59	NC_009790	GTCA	2	8	39469	39476	25 %	25 %	25 %	25 %	157149568
60	NC_009790	GCCG	2	8	39573	39580	0 %	0 %	50 %	50 %	157149568
61	NC_009790	GCGA	2	8	40706	40713	25 %	0 %	50 %	25 %	157149511
62	NC_009790	CAGC	2	8	41913	41920	25 %	0 %	25 %	50 %	157149532
63	NC_009790	GCAA	2	8	41937	41944	50 %	0 %	25 %	25 %	157149532
64	NC_009790	GAAA	2	8	42477	42484	75 %	0 %	25 %	0 %	157149536
65	NC_009790	TCGC	2	8	42951	42958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149536
66	NC_009790	GTCA	2	8	43220	43227	25 %	25 %	25 %	25 %	157149525
67	NC_009790	TGCC	2	8	44452	44459	0 %	25 %	25 %	50 %	157149569
68	NC_009790	GCCG	2	8	44830	44837	0 %	0 %	50 %	50 %	157149569
69	NC_009790	CTGG	2	8	44946	44953	0 %	25 %	50 %	25 %	157149526
70	NC_009790	CGCC	2	8	45310	45317	0 %	0 %	25 %	75 %	157149558
71	NC_009790	CCGG	2	8	45655	45662	0 %	0 %	50 %	50 %	157149558
72	NC_009790	CCTG	2	8	45677	45684	0 %	25 %	25 %	50 %	157149558
73	NC_009790	ATCC	2	8	46199	46206	25 %	25 %	0 %	50 %	157149558
74	NC_009790	TGCA	2	8	46338	46345	25 %	25 %	25 %	25 %	157149558
75	NC_009790	GCGG	2	8	47598	47605	0 %	0 %	75 %	25 %	157149572
76	NC_009790	TAAA	2	8	50090	50097	75 %	25 %	0 %	0 %	157149562
77	NC_009790	CATG	2	8	50346	50353	25 %	25 %	25 %	25 %	157149562
78	NC_009790	GGCT	2	8	50445	50452	0 %	25 %	50 %	25 %	157149562
79	NC_009790	CAAG	2	8	50694	50701	50 %	0 %	25 %	25 %	157149562
80	NC_009790	TACT	2	8	51021	51028	25 %	50 %	0 %	25 %	157149562
81	NC_009790	ACTG	2	8	51750	51757	25 %	25 %	25 %	25 %	157149562
82	NC_009790	TCCT	2	8	52552	52559	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
83	NC_009790	CAGA	2	8	52703	52710	50 %	0 %	25 %	25 %	157149562
84	NC_009790	ACAG	2	8	52762	52769	50 %	0 %	25 %	25 %	157149562
85	NC_009790	GTAG	2	8	53131	53138	25 %	25 %	50 %	0 %	157149562
86	NC_009790	CTCA	2	8	53959	53966	25 %	25 %	0 %	50 %	157149523
87	NC_009790	GAAA	2	8	54017	54024	75 %	0 %	25 %	0 %	157149523
88	NC_009790	AATC	2	8	54847	54854	50 %	25 %	0 %	25 %	157149510
89	NC_009790	TAAT	2	8	54879	54886	50 %	50 %	0 %	0 %	157149510
90	NC_009790	AAAT	2	8	54994	55001	75 %	25 %	0 %	0 %	157149510
91	NC_009790	AAAT	2	8	55141	55148	75 %	25 %	0 %	0 %	157149510
92	NC_009790	GAAC	2	8	56381	56388	50 %	0 %	25 %	25 %	157149522
93	NC_009790	CCTG	2	8	57110	57117	0 %	25 %	25 %	50 %	157149514
94	NC_009790	GCTG	2	8	57172	57179	0 %	25 %	50 %	25 %	157149514
95	NC_009790	CTGG	2	8	57225	57232	0 %	25 %	50 %	25 %	157149514
96	NC_009790	CACT	2	8	57424	57431	25 %	25 %	0 %	50 %	157149514
97	NC_009790	GGCG	2	8	57691	57698	0 %	0 %	75 %	25 %	157149570
98	NC_009790	GGAT	2	8	58474	58481	25 %	25 %	50 %	0 %	157149533
99	NC_009790	AATG	2	8	58649	58656	50 %	25 %	25 %	0 %	157149533
100	NC_009790	GCTG	2	8	58783	58790	0 %	25 %	50 %	25 %	157149520
101	NC_009790	GCCG	2	8	58913	58920	0 %	0 %	50 %	50 %	157149520
102	NC_009790	CCGC	2	8	59021	59028	0 %	0 %	25 %	75 %	157149520
103	NC_009790	TAAA	2	8	59261	59268	75 %	25 %	0 %	0 %	157149520
104	NC_009790	AGAA	2	8	60181	60188	75 %	0 %	25 %	0 %	157149519
105	NC_009790	GAAT	2	8	60189	60196	50 %	25 %	25 %	0 %	157149519
106	NC_009790	AGGA	2	8	60782	60789	50 %	0 %	50 %	0 %	157149517
107	NC_009790	CTGG	2	8	60882	60889	0 %	25 %	50 %	25 %	157149517
108	NC_009790	GTTG	2	8	61004	61011	0 %	50 %	50 %	0 %	157149517
109	NC_009790	GCAT	2	8	61073	61080	25 %	25 %	25 %	25 %	157149517
110	NC_009790	CAGT	2	8	62109	62116	25 %	25 %	25 %	25 %	157149530
111	NC_009790	AGCC	2	8	63476	63483	25 %	0 %	25 %	50 %	157149508
112	NC_009790	CAGC	2	8	63674	63681	25 %	0 %	25 %	50 %	157149508
113	NC_009790	CCGC	2	8	65127	65134	0 %	0 %	25 %	75 %	157149540
114	NC_009790	GGAT	2	8	65906	65913	25 %	25 %	50 %	0 %	157149542
115	NC_009790	GTCA	2	8	66073	66080	25 %	25 %	25 %	25 %	157149542
116	NC_009790	GCCG	2	8	66177	66184	0 %	0 %	50 %	50 %	157149542
117	NC_009790	GCGA	2	8	67310	67317	25 %	0 %	50 %	25 %	157149512
118	NC_009790	TCAC	2	8	68638	68645	25 %	25 %	0 %	50 %	157149544
119	NC_009790	CTGG	2	8	68679	68686	0 %	25 %	50 %	25 %	157149544
120	NC_009790	TCAT	2	8	68705	68712	25 %	50 %	0 %	25 %	157149544
121	NC_009790	TCCT	2	8	68809	68816	0 %	50 %	0 %	50 %	157149544
122	NC_009790	ACTA	2	8	70174	70181	50 %	25 %	0 %	25 %	157149556
123	NC_009790	TGGC	2	8	70281	70288	0 %	25 %	50 %	25 %	157149556
124	NC_009790	AGCG	2	8	70975	70982	25 %	0 %	50 %	25 %	157149556
125	NC_009790	CTGG	2	8	71462	71469	0 %	25 %	50 %	25 %	157149556
126	NC_009790	GCAG	2	8	71840	71847	25 %	0 %	50 %	25 %	157149563

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.