MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CGT	2	6	96	101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009790	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009790	CCT	2	6	294	299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009790	AAT	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009790	CAC	2	6	366	371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009790	GCC	2	6	528	533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009790	ACT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009790	GCG	2	6	668	673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009790	ACA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009790	ACC	2	6	715	720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009790	TGT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009790	CAT	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009790	TCG	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009790	CGG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009790	GCC	2	6	1111	1116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009790	TCA	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009790	CTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009790	GCC	2	6	2036	2041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009790	TAT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009790	TCC	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009790	CAC	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009790	TTC	2	6	6875	6880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009790	CAC	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009790	TTC	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009790	TCG	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009790	GCA	2	6	9947	9952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009790	CAA	2	6	11123	11128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009790	ATG	2	6	11209	11214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009790	GGT	2	6	11252	11257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009790	ACA	2	6	11338	11343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009790	GAA	2	6	11378	11383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009790	GGC	2	6	11513	11518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009790	GCT	2	6	11624	11629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009790	AAC	2	6	11676	11681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009790	GCG	2	6	11734	11739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009790	ATT	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009790	CAT	2	6	11817	11822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009790	CTG	2	6	12303	12308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009790	CAT	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009790	GCA	2	6	12428	12433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009790	CGA	2	6	12434	12439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009790	ATC	2	6	12478	12483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009790	GTT	2	6	12515	12520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009790	CAA	2	6	12801	12806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009790	GAT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009790	GAA	2	6	12946	12951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009790	CAC	2	6	12990	12995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009790	AGG	2	6	13022	13027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009790	GCA	2	6	13092	13097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009790	CCT	2	6	13169	13174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009790	GTA	2	6	13270	13275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009790	GAG	2	6	14934	14939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009790	CGT	2	6	15116	15121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009790	AAG	2	6	15192	15197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009790	CGA	2	6	15362	15367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009790	CTC	2	6	15390	15395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009790	TTA	2	6	15415	15420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009790	GAT	2	6	15437	15442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009790	AAG	2	6	15499	15504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009790	TGA	2	6	15662	15667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009790	TGC	2	6	15692	15697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009790	ATT	2	6	15774	15779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009790	ACA	2	6	17820	17825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009790	GCA	2	6	17896	17901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009790	GCG	2	6	17948	17953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009790	GCA	2	6	18112	18117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009790	AAC	2	6	18168	18173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009790	ATC	2	6	18212	18217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009790	TCA	2	6	18305	18310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009790	CCG	2	6	18382	18387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009790	GGA	3	9	19543	19551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009790	ACG	2	6	19552	19557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009790	GAG	2	6	19572	19577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009790	TGT	2	6	19676	19681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009790	CAG	2	6	19696	19701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009790	ACG	2	6	19755	19760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009790	ACA	2	6	19869	19874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009790	TAA	2	6	19898	19903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009790	CGA	2	6	19910	19915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009790	AAG	2	6	22300	22305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009790	TTA	2	6	22324	22329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009790	CGC	2	6	22341	22346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009790	AGA	2	6	22390	22395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009790	AAG	2	6	22429	22434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009790	TAA	2	6	22495	22500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009790	TCA	2	6	22518	22523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009790	ATG	2	6	22524	22529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009790	ATC	2	6	22709	22714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009790	ATA	2	6	22730	22735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009790	GGA	2	6	22755	22760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009790	TCG	2	6	22784	22789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009790	CTT	2	6	22954	22959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009790	CTC	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009790	ACT	2	6	24874	24879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009790	GAG	2	6	24976	24981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009790	GCT	2	6	25052	25057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009790	TCC	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009790	GTG	2	6	25156	25161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009790	TTC	2	6	25200	25205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009790	ATC	2	6	25231	25236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009790	TTG	2	6	25345	25350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009790	AAC	2	6	25631	25636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009790	TGA	2	6	25667	25672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009790	GTC	2	6	25711	25716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009790	TGC	2	6	25718	25723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009790	GAT	2	6	25746	25751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009790	CAG	2	6	25843	25848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009790	AGA	2	6	26253	26258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009790	CAG	2	6	26309	26314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009790	ACT	2	6	26319	26324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009790	ACA	2	6	26442	26447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009790	CTT	2	6	26512	26517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009790	TTG	2	6	26539	26544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009790	AGC	2	6	26547	26552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009790	ATG	2	6	26558	26563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009790	TTG	2	6	26621	26626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009790	AGC	2	6	26631	26636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009790	ATT	2	6	26708	26713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009790	GAC	2	6	26748	26753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009790	GAT	3	9	26759	26767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009790	AAC	2	6	26889	26894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009790	TAA	2	6	26902	26907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009790	ATT	2	6	26991	26996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009790	TGC	2	6	27031	27036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009790	TCA	3	9	27209	27217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009790	GAC	2	6	27269	27274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009790	CAC	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009790	GCG	2	6	28238	28243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009790	CAC	2	6	28268	28273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009790	TTG	2	6	28282	28287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009790	CAG	2	6	28314	28319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009790	CGG	2	6	28331	28336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009790	CGC	2	6	29307	29312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009790	CCG	2	6	29405	29410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009790	GTG	2	6	29509	29514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009790	TGA	2	6	29589	29594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009790	GCC	2	6	29600	29605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009790	GGC	2	6	29614	29619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009790	GGA	2	6	31631	31636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009790	TGT	3	9	31783	31791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.