MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	157149552
2	NC_009790	CA	3	6	1546	1551	50 %	0 %	0 %	50 %	157149552
3	NC_009790	TG	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009790	CT	4	8	2068	2075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009790	TA	3	6	2133	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009790	AC	3	6	2649	2654	50 %	0 %	0 %	50 %	157149551
7	NC_009790	AT	3	6	3447	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009790	TG	3	6	3883	3888	0 %	50 %	50 %	0 %	157149560
9	NC_009790	TC	3	6	4197	4202	0 %	50 %	0 %	50 %	157149541
10	NC_009790	TG	3	6	8233	8238	0 %	50 %	50 %	0 %	157149529
11	NC_009790	TG	3	6	8520	8525	0 %	50 %	50 %	0 %	157149529
12	NC_009790	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	157149555
13	NC_009790	TG	3	6	9842	9847	0 %	50 %	50 %	0 %	157149555
14	NC_009790	AC	3	6	10063	10068	50 %	0 %	0 %	50 %	157149506
15	NC_009790	TC	3	6	10214	10219	0 %	50 %	0 %	50 %	157149506
16	NC_009790	GC	3	6	10402	10407	0 %	0 %	50 %	50 %	157149554
17	NC_009790	GC	3	6	11190	11195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009790	TG	3	6	11270	11275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009790	GT	4	8	11417	11424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009790	GT	3	6	11430	11435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009790	AG	4	8	12448	12455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009790	TC	3	6	15643	15648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009790	TC	3	6	15994	15999	0 %	50 %	0 %	50 %	157149567
24	NC_009790	CA	3	6	16806	16811	50 %	0 %	0 %	50 %	157149521
25	NC_009790	TA	3	6	17599	17604	50 %	50 %	0 %	0 %	157149521
26	NC_009790	CT	3	6	17770	17775	0 %	50 %	0 %	50 %	157149521
27	NC_009790	CT	3	6	17988	17993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009790	CA	3	6	18977	18982	50 %	0 %	0 %	50 %	157149535
29	NC_009790	GT	3	6	19182	19187	0 %	50 %	50 %	0 %	157149535
30	NC_009790	AG	3	6	19937	19942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009790	CG	3	6	20890	20895	0 %	0 %	50 %	50 %	157149553
32	NC_009790	GC	3	6	21435	21440	0 %	0 %	50 %	50 %	157149534
33	NC_009790	AC	3	6	22470	22475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009790	GC	3	6	25591	25596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009790	TC	4	8	25695	25702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009790	GA	3	6	26673	26678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009790	TG	3	6	26956	26961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009790	TC	3	6	27167	27172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009790	AT	3	6	27198	27203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009790	CG	3	6	28404	28409	0 %	0 %	50 %	50 %	157149550
41	NC_009790	CA	3	6	28859	28864	50 %	0 %	0 %	50 %	157149550
42	NC_009790	CG	3	6	29703	29708	0 %	0 %	50 %	50 %	157149546
43	NC_009790	GA	3	6	29878	29883	50 %	0 %	50 %	0 %	157149546
44	NC_009790	GC	3	6	31086	31091	0 %	0 %	50 %	50 %	157149513
45	NC_009790	TG	3	6	31277	31282	0 %	50 %	50 %	0 %	157149513
46	NC_009790	CG	3	6	31556	31561	0 %	0 %	50 %	50 %	157149513
47	NC_009790	GC	3	6	31605	31610	0 %	0 %	50 %	50 %	157149513
48	NC_009790	CG	3	6	31669	31674	0 %	0 %	50 %	50 %	157149547
49	NC_009790	AT	3	6	32972	32977	50 %	50 %	0 %	0 %	157149537
50	NC_009790	GT	3	6	33219	33224	0 %	50 %	50 %	0 %	157149537
51	NC_009790	AT	4	8	33827	33834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009790	TG	4	8	33896	33903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009790	TC	3	6	34523	34528	0 %	50 %	0 %	50 %	157149559
54	NC_009790	CA	3	6	35335	35340	50 %	0 %	0 %	50 %	157149531
55	NC_009790	TA	3	6	36128	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	157149531
56	NC_009790	CT	3	6	36299	36304	0 %	50 %	0 %	50 %	157149531
57	NC_009790	AG	3	6	37218	37223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009790	GT	3	6	37653	37658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009790	TC	3	6	38343	38348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009790	CT	3	6	39962	39967	0 %	50 %	0 %	50 %	157149568
61	NC_009790	CT	3	6	40763	40768	0 %	50 %	0 %	50 %	157149511
62	NC_009790	AG	3	6	41218	41223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009790	AG	3	6	42816	42821	50 %	0 %	50 %	0 %	157149536
64	NC_009790	GT	3	6	43295	43300	0 %	50 %	50 %	0 %	157149525
65	NC_009790	AT	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009790	TG	3	6	44609	44614	0 %	50 %	50 %	0 %	157149569
67	NC_009790	TC	3	6	44923	44928	0 %	50 %	0 %	50 %	157149526
68	NC_009790	GT	3	6	47652	47657	0 %	50 %	50 %	0 %	157149572
69	NC_009790	GA	3	6	48300	48305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009790	TA	3	6	49015	49020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009790	TA	3	6	49301	49306	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
72	NC_009790	TC	3	6	49319	49324	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
73	NC_009790	AT	3	6	49490	49495	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
74	NC_009790	GA	3	6	49766	49771	50 %	0 %	50 %	0 %	157149562
75	NC_009790	AT	3	6	49926	49931	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
76	NC_009790	TA	3	6	49961	49966	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
77	NC_009790	CT	3	6	50130	50135	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
78	NC_009790	TG	3	6	50337	50342	0 %	50 %	50 %	0 %	157149562
79	NC_009790	CT	3	6	51217	51222	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
80	NC_009790	TC	3	6	51414	51419	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
81	NC_009790	CT	3	6	51807	51812	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
82	NC_009790	CA	3	6	53829	53834	50 %	0 %	0 %	50 %	157149523
83	NC_009790	TC	3	6	53987	53992	0 %	50 %	0 %	50 %	157149523
84	NC_009790	AC	3	6	54439	54444	50 %	0 %	0 %	50 %	157149523
85	NC_009790	TA	3	6	54696	54701	50 %	50 %	0 %	0 %	157149510
86	NC_009790	CT	4	8	54801	54808	0 %	50 %	0 %	50 %	157149510
87	NC_009790	AG	3	6	54813	54818	50 %	0 %	50 %	0 %	157149510
88	NC_009790	TA	3	6	54951	54956	50 %	50 %	0 %	0 %	157149510
89	NC_009790	CT	3	6	55072	55077	0 %	50 %	0 %	50 %	157149510
90	NC_009790	CA	3	6	55127	55132	50 %	0 %	0 %	50 %	157149510
91	NC_009790	AT	3	6	55382	55387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009790	AG	3	6	55844	55849	50 %	0 %	50 %	0 %	157149522
93	NC_009790	TA	3	6	56509	56514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009790	AT	3	6	56748	56753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009790	GC	3	6	57353	57358	0 %	0 %	50 %	50 %	157149514
96	NC_009790	CT	4	8	57777	57784	0 %	50 %	0 %	50 %	157149570
97	NC_009790	CT	3	6	58052	58057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009790	CA	3	6	58059	58064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009790	GC	3	6	58885	58890	0 %	0 %	50 %	50 %	157149520
100	NC_009790	GA	3	6	60058	60063	50 %	0 %	50 %	0 %	157149519
101	NC_009790	TA	3	6	60171	60176	50 %	50 %	0 %	0 %	157149519
102	NC_009790	AT	3	6	61714	61719	50 %	50 %	0 %	0 %	157149530
103	NC_009790	GA	3	6	61821	61826	50 %	0 %	50 %	0 %	157149530
104	NC_009790	TC	3	6	64594	64599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009790	TC	3	6	64752	64757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009790	CT	3	6	66566	66571	0 %	50 %	0 %	50 %	157149542
107	NC_009790	CT	3	6	67367	67372	0 %	50 %	0 %	50 %	157149512
108	NC_009790	GT	3	6	67982	67987	0 %	50 %	50 %	0 %	157149571
109	NC_009790	TC	3	6	68019	68024	0 %	50 %	0 %	50 %	157149571
110	NC_009790	TA	3	6	68470	68475	50 %	50 %	0 %	0 %	157149524
111	NC_009790	AG	3	6	68896	68901	50 %	0 %	50 %	0 %	157149544
112	NC_009790	TA	3	6	71604	71609	50 %	50 %	0 %	0 %	157149563
113	NC_009790	GT	3	6	72157	72162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009790	AG	3	6	72276	72281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009790	AG	3	6	72655	72660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009790	GT	3	6	72704	72709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009790	AC	3	6	73221	73226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009790	GC	3	6	74155	74160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.