MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	157149552
2	NC_009790	CA	3	6	1546	1551	50 %	0 %	0 %	50 %	157149552
3	NC_009790	AC	3	6	2649	2654	50 %	0 %	0 %	50 %	157149551
4	NC_009790	TG	3	6	3883	3888	0 %	50 %	50 %	0 %	157149560
5	NC_009790	TC	3	6	4197	4202	0 %	50 %	0 %	50 %	157149541
6	NC_009790	TG	3	6	8233	8238	0 %	50 %	50 %	0 %	157149529
7	NC_009790	TG	3	6	8520	8525	0 %	50 %	50 %	0 %	157149529
8	NC_009790	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	157149555
9	NC_009790	TG	3	6	9842	9847	0 %	50 %	50 %	0 %	157149555
10	NC_009790	AC	3	6	10063	10068	50 %	0 %	0 %	50 %	157149506
11	NC_009790	TC	3	6	10214	10219	0 %	50 %	0 %	50 %	157149506
12	NC_009790	GC	3	6	10402	10407	0 %	0 %	50 %	50 %	157149554
13	NC_009790	TC	3	6	15994	15999	0 %	50 %	0 %	50 %	157149567
14	NC_009790	CA	3	6	16806	16811	50 %	0 %	0 %	50 %	157149521
15	NC_009790	TA	3	6	17599	17604	50 %	50 %	0 %	0 %	157149521
16	NC_009790	CT	3	6	17770	17775	0 %	50 %	0 %	50 %	157149521
17	NC_009790	CA	3	6	18977	18982	50 %	0 %	0 %	50 %	157149535
18	NC_009790	GT	3	6	19182	19187	0 %	50 %	50 %	0 %	157149535
19	NC_009790	CG	3	6	20890	20895	0 %	0 %	50 %	50 %	157149553
20	NC_009790	GC	3	6	21435	21440	0 %	0 %	50 %	50 %	157149534
21	NC_009790	CG	3	6	28404	28409	0 %	0 %	50 %	50 %	157149550
22	NC_009790	CA	3	6	28859	28864	50 %	0 %	0 %	50 %	157149550
23	NC_009790	CG	3	6	29703	29708	0 %	0 %	50 %	50 %	157149546
24	NC_009790	GA	3	6	29878	29883	50 %	0 %	50 %	0 %	157149546
25	NC_009790	GC	3	6	31086	31091	0 %	0 %	50 %	50 %	157149513
26	NC_009790	TG	3	6	31277	31282	0 %	50 %	50 %	0 %	157149513
27	NC_009790	CG	3	6	31556	31561	0 %	0 %	50 %	50 %	157149513
28	NC_009790	GC	3	6	31605	31610	0 %	0 %	50 %	50 %	157149513
29	NC_009790	CG	3	6	31669	31674	0 %	0 %	50 %	50 %	157149547
30	NC_009790	AT	3	6	32972	32977	50 %	50 %	0 %	0 %	157149537
31	NC_009790	GT	3	6	33219	33224	0 %	50 %	50 %	0 %	157149537
32	NC_009790	TC	3	6	34523	34528	0 %	50 %	0 %	50 %	157149559
33	NC_009790	CA	3	6	35335	35340	50 %	0 %	0 %	50 %	157149531
34	NC_009790	TA	3	6	36128	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	157149531
35	NC_009790	CT	3	6	36299	36304	0 %	50 %	0 %	50 %	157149531
36	NC_009790	CT	3	6	39962	39967	0 %	50 %	0 %	50 %	157149568
37	NC_009790	CT	3	6	40763	40768	0 %	50 %	0 %	50 %	157149511
38	NC_009790	AG	3	6	42816	42821	50 %	0 %	50 %	0 %	157149536
39	NC_009790	GT	3	6	43295	43300	0 %	50 %	50 %	0 %	157149525
40	NC_009790	TG	3	6	44609	44614	0 %	50 %	50 %	0 %	157149569
41	NC_009790	TC	3	6	44923	44928	0 %	50 %	0 %	50 %	157149526
42	NC_009790	GT	3	6	47652	47657	0 %	50 %	50 %	0 %	157149572
43	NC_009790	TA	3	6	49301	49306	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
44	NC_009790	TC	3	6	49319	49324	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
45	NC_009790	AT	3	6	49490	49495	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
46	NC_009790	GA	3	6	49766	49771	50 %	0 %	50 %	0 %	157149562
47	NC_009790	AT	3	6	49926	49931	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
48	NC_009790	TA	3	6	49961	49966	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
49	NC_009790	CT	3	6	50130	50135	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
50	NC_009790	TG	3	6	50337	50342	0 %	50 %	50 %	0 %	157149562
51	NC_009790	CT	3	6	51217	51222	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
52	NC_009790	TC	3	6	51414	51419	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
53	NC_009790	CT	3	6	51807	51812	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
54	NC_009790	CA	3	6	53829	53834	50 %	0 %	0 %	50 %	157149523
55	NC_009790	TC	3	6	53987	53992	0 %	50 %	0 %	50 %	157149523
56	NC_009790	AC	3	6	54439	54444	50 %	0 %	0 %	50 %	157149523
57	NC_009790	TA	3	6	54696	54701	50 %	50 %	0 %	0 %	157149510
58	NC_009790	CT	4	8	54801	54808	0 %	50 %	0 %	50 %	157149510
59	NC_009790	AG	3	6	54813	54818	50 %	0 %	50 %	0 %	157149510
60	NC_009790	TA	3	6	54951	54956	50 %	50 %	0 %	0 %	157149510
61	NC_009790	CT	3	6	55072	55077	0 %	50 %	0 %	50 %	157149510
62	NC_009790	CA	3	6	55127	55132	50 %	0 %	0 %	50 %	157149510
63	NC_009790	AG	3	6	55844	55849	50 %	0 %	50 %	0 %	157149522
64	NC_009790	GC	3	6	57353	57358	0 %	0 %	50 %	50 %	157149514
65	NC_009790	CT	4	8	57777	57784	0 %	50 %	0 %	50 %	157149570
66	NC_009790	GC	3	6	58885	58890	0 %	0 %	50 %	50 %	157149520
67	NC_009790	GA	3	6	60058	60063	50 %	0 %	50 %	0 %	157149519
68	NC_009790	TA	3	6	60171	60176	50 %	50 %	0 %	0 %	157149519
69	NC_009790	AT	3	6	61714	61719	50 %	50 %	0 %	0 %	157149530
70	NC_009790	GA	3	6	61821	61826	50 %	0 %	50 %	0 %	157149530
71	NC_009790	CT	3	6	66566	66571	0 %	50 %	0 %	50 %	157149542
72	NC_009790	CT	3	6	67367	67372	0 %	50 %	0 %	50 %	157149512
73	NC_009790	GT	3	6	67982	67987	0 %	50 %	50 %	0 %	157149571
74	NC_009790	TC	3	6	68019	68024	0 %	50 %	0 %	50 %	157149571
75	NC_009790	TA	3	6	68470	68475	50 %	50 %	0 %	0 %	157149524
76	NC_009790	AG	3	6	68896	68901	50 %	0 %	50 %	0 %	157149544
77	NC_009790	TA	3	6	71604	71609	50 %	50 %	0 %	0 %	157149563

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.