MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_6

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009789	GCT	2	6	206	211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009789	CCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009789	TCT	2	6	565	570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009789	CGC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009789	CTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149501
6	NC_009789	TGC	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149501
7	NC_009789	AAC	2	6	847	852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009789	ATG	2	6	890	895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149500
9	NC_009789	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149500
10	NC_009789	AAT	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009789	TTC	2	6	1318	1323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009789	CAT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009789	GAA	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009789	GGT	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009789	TTG	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009789	GTT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009789	CTC	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009789	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009789	CTG	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009789	CCT	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009789	CAG	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009789	GTA	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009789	GGT	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009789	ATG	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009789	GGT	3	9	2539	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009789	TGG	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009789	ATA	2	6	2561	2566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009789	TCA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009789	GAA	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009789	CTG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009789	TAA	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009789	CAT	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009789	GGC	2	6	2872	2877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009789	GAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009789	GCG	2	6	3160	3165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009789	GCC	2	6	3179	3184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009789	TGA	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009789	AAC	2	6	3210	3215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009789	CTC	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149503
40	NC_009789	GTC	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149503
41	NC_009789	GGC	2	6	3603	3608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149503
42	NC_009789	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149503
43	NC_009789	ATG	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149503
44	NC_009789	TCA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149503
45	NC_009789	CGC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149503
46	NC_009789	ATC	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149503
47	NC_009789	TCA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009789	TCT	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009789	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009789	CTG	2	6	4378	4383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149502
51	NC_009789	GCC	2	6	4390	4395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149502
52	NC_009789	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149502
53	NC_009789	AAC	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149502
54	NC_009789	GCG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149502
55	NC_009789	AAG	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149502
56	NC_009789	TGC	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149502
57	NC_009789	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149502
58	NC_009789	TCC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149502
59	NC_009789	TGA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149502
60	NC_009789	CGG	2	6	4878	4883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149502
61	NC_009789	CAC	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149502
62	NC_009789	TGA	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009789	GCC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149499
64	NC_009789	GCG	3	9	5169	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149499
65	NC_009789	AGC	2	6	5336	5341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149499
66	NC_009789	CGC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149499
67	NC_009789	ATG	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
68	NC_009789	ACG	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149499
69	NC_009789	GAT	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
70	NC_009789	CAC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149499
71	NC_009789	GCG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149499
72	NC_009789	ATG	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
73	NC_009789	TAA	4	12	5899	5910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009789	ATG	3	9	5989	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009789	CTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009789	TGC	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009789	TCT	2	6	6179	6184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.