MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	CACTT	2	10	128	137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009788	GGGCG	2	10	1165	1174	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009788	GCCGG	2	10	2383	2392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009788	ACAGT	2	10	3088	3097	40 %	20 %	20 %	20 %	157149470
5	NC_009788	ACGGT	2	10	3326	3335	20 %	20 %	40 %	20 %	157149453
6	NC_009788	GTGCC	2	10	3616	3625	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009788	GGCAC	2	10	3832	3841	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009788	CCAGC	2	10	5751	5760	20 %	0 %	20 %	60 %	157149435
9	NC_009788	CCCGT	2	10	6396	6405	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_009788	GCCGC	2	10	6446	6455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009788	TTTAG	2	10	8753	8762	20 %	60 %	20 %	0 %	157149477
12	NC_009788	CAGTG	2	10	8860	8869	20 %	20 %	40 %	20 %	157149477
13	NC_009788	GTAAC	2	10	9189	9198	40 %	20 %	20 %	20 %	157149477
14	NC_009788	TTTTG	2	10	10636	10645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009788	CATAA	2	10	11003	11012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009788	CGTTC	2	10	14763	14772	0 %	40 %	20 %	40 %	157149473
17	NC_009788	TGTGC	2	10	14919	14928	0 %	40 %	40 %	20 %	157149473
18	NC_009788	TATTT	2	10	15523	15532	20 %	80 %	0 %	0 %	157149473
19	NC_009788	ATGAT	2	10	16240	16249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009788	CCGAA	2	10	16530	16539	40 %	0 %	20 %	40 %	157149433
21	NC_009788	CAGCC	2	10	16608	16617	20 %	0 %	20 %	60 %	157149433
22	NC_009788	GAATT	2	10	24035	24044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009788	TTCAA	2	10	24851	24860	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009788	ATCTT	2	10	26080	26089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009788	ATAGT	2	10	26131	26140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009788	CATTA	2	10	26153	26162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009788	CAAAT	2	10	27902	27911	60 %	20 %	0 %	20 %	157149440
28	NC_009788	GCACT	2	10	29631	29640	20 %	20 %	20 %	40 %	157149455
29	NC_009788	AGTGG	2	10	29738	29747	20 %	20 %	60 %	0 %	157149455
30	NC_009788	TTCCT	2	10	34202	34211	0 %	60 %	0 %	40 %	157149430
31	NC_009788	TGGCG	2	10	38797	38806	0 %	20 %	60 %	20 %	157149439
32	NC_009788	AGTTC	2	10	39453	39462	20 %	40 %	20 %	20 %	157149439
33	NC_009788	ACCTT	2	10	40039	40048	20 %	40 %	0 %	40 %	157149494
34	NC_009788	CTCAT	2	10	41574	41583	20 %	40 %	0 %	40 %	157149488
35	NC_009788	GCTGC	2	10	42957	42966	0 %	20 %	40 %	40 %	157149471
36	NC_009788	TCTCT	2	10	44111	44120	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009788	CCATA	2	10	44739	44748	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009788	GAAGC	2	10	45087	45096	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009788	CGGGC	2	10	46198	46207	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009788	ACAGC	2	10	48963	48972	40 %	0 %	20 %	40 %	157149485
41	NC_009788	AACAA	2	10	52042	52051	80 %	0 %	0 %	20 %	157149465
42	NC_009788	CGTGT	2	10	53101	53110	0 %	40 %	40 %	20 %	157149465
43	NC_009788	GGCAA	2	10	53276	53285	40 %	0 %	40 %	20 %	157149465
44	NC_009788	TACTC	2	10	53480	53489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009788	ACGAT	2	10	57797	57806	40 %	20 %	20 %	20 %	157149495
46	NC_009788	GTCAT	2	10	58364	58373	20 %	40 %	20 %	20 %	157149495
47	NC_009788	ATAAA	2	10	60837	60846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009788	TCCGG	2	10	61663	61672	0 %	20 %	40 %	40 %	157149461
49	NC_009788	ACATC	2	10	62139	62148	40 %	20 %	0 %	40 %	157149461
50	NC_009788	CGTTC	2	10	62611	62620	0 %	40 %	20 %	40 %	157149431
51	NC_009788	CAGAC	2	10	63640	63649	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009788	TGCTC	2	10	64033	64042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009788	GTAAC	2	10	64674	64683	40 %	20 %	20 %	20 %	157149442
54	NC_009788	GGCAC	2	10	67493	67502	20 %	0 %	40 %	40 %	157149474
55	NC_009788	CCCAT	2	10	67887	67896	20 %	20 %	0 %	60 %	157149489
56	NC_009788	ACCAG	2	10	68497	68506	40 %	0 %	20 %	40 %	157149458
57	NC_009788	TCAGT	2	10	69425	69434	20 %	40 %	20 %	20 %	157149480
58	NC_009788	TGCAG	2	10	69834	69843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.