MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	GCTT	2	8	800	807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009788	CCGT	2	8	3137	3144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009788	ACGA	2	8	3734	3741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009788	GCCC	2	8	6520	6527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009788	TGTT	2	8	9871	9878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009788	TACC	2	8	10308	10315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009788	AGCG	2	8	11133	11140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009788	GATG	2	8	11296	11303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009788	GAAA	2	8	12943	12950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009788	GAGC	2	8	13178	13185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009788	GGAT	2	8	18845	18852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009788	CATT	2	8	23683	23690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009788	CTTC	2	8	23978	23985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009788	TCAT	2	8	24022	24029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009788	TATT	2	8	24591	24598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009788	AATC	2	8	25087	25094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009788	CAAA	2	8	26280	26287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009788	CCCT	2	8	26303	26310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009788	AGAA	2	8	26463	26470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009788	AAGC	2	8	26503	26510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009788	ATAG	2	8	26551	26558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009788	AATG	2	8	28533	28540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009788	CAGT	2	8	28696	28703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009788	TGAA	2	8	30303	30310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009788	CCTG	2	8	30570	30577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009788	AGGC	2	8	30584	30591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009788	AAAC	2	8	35853	35860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009788	AAAT	3	12	35875	35886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009788	CCAG	2	8	36459	36466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009788	CGTA	2	8	36924	36931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009788	TATT	2	8	36940	36947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009788	CAAC	2	8	37576	37583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009788	TCAA	2	8	37773	37780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009788	GCCA	2	8	37836	37843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009788	AAGC	2	8	38400	38407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009788	GAAG	2	8	41117	41124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009788	ACCC	2	8	41993	42000	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009788	CCAG	2	8	42149	42156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009788	TTTG	2	8	42541	42548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009788	AAGA	2	8	43900	43907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009788	GGCA	2	8	44797	44804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009788	ACCT	2	8	45079	45086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009788	CGTT	2	8	45155	45162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009788	GAAA	2	8	46309	46316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009788	GGCC	2	8	46357	46364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009788	TTCT	2	8	47188	47195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009788	AATT	2	8	47809	47816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009788	GCCT	2	8	48101	48108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009788	AATA	2	8	48515	48522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009788	CGGA	2	8	48658	48665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009788	GGAA	2	8	51030	51037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009788	TTAC	2	8	51209	51216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009788	GGGC	2	8	51234	51241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009788	GTCT	2	8	51265	51272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009788	GCAA	2	8	51645	51652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009788	CAGG	2	8	51696	51703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009788	GCTG	2	8	51757	51764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009788	GTAT	2	8	53666	53673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009788	GTGG	2	8	53846	53853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009788	AACA	2	8	58559	58566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009788	TCTT	2	8	58771	58778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009788	TCAC	2	8	58788	58795	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009788	ATAG	2	8	65821	65828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009788	CGTC	2	8	66460	66467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009788	CAGG	2	8	66992	66999	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009788	CCAG	2	8	69561	69568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009788	CCTT	2	8	69970	69977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009788	GCGT	2	8	70139	70146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009788	GTTC	2	8	70436	70443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.