MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	CTGC	2	8	2803	2810	0 %	25 %	25 %	50 %	157149470
2	NC_009788	GCCA	2	8	4432	4439	25 %	0 %	25 %	50 %	157149449
3	NC_009788	ACTG	2	8	4502	4509	25 %	25 %	25 %	25 %	157149449
4	NC_009788	TCAT	2	8	5389	5396	25 %	50 %	0 %	25 %	157149446
5	NC_009788	CTGC	2	8	5638	5645	0 %	25 %	25 %	50 %	157149435
6	NC_009788	GCCA	2	8	6679	6686	25 %	0 %	25 %	50 %	157149483
7	NC_009788	TGAA	2	8	6801	6808	50 %	25 %	25 %	0 %	157149483
8	NC_009788	CAGC	2	8	7214	7221	25 %	0 %	25 %	50 %	157149483
9	NC_009788	TTTA	2	8	8716	8723	25 %	75 %	0 %	0 %	157149477
10	NC_009788	GATC	2	8	9204	9211	25 %	25 %	25 %	25 %	157149477
11	NC_009788	CCTG	2	8	11666	11673	0 %	25 %	25 %	50 %	157149457
12	NC_009788	GCTG	2	8	11728	11735	0 %	25 %	50 %	25 %	157149457
13	NC_009788	CTCA	2	8	12276	12283	25 %	25 %	0 %	50 %	157149451
14	NC_009788	CATC	2	8	12592	12599	25 %	25 %	0 %	50 %	157149447
15	NC_009788	AGAT	2	8	14387	14394	50 %	25 %	25 %	0 %	157149473
16	NC_009788	GCAG	2	8	14511	14518	25 %	0 %	50 %	25 %	157149473
17	NC_009788	CTGA	2	8	14549	14556	25 %	25 %	25 %	25 %	157149473
18	NC_009788	TGTT	2	8	14910	14917	0 %	75 %	25 %	0 %	157149473
19	NC_009788	TCAA	2	8	15074	15081	50 %	25 %	0 %	25 %	157149473
20	NC_009788	ACTG	2	8	15771	15778	25 %	25 %	25 %	25 %	157149473
21	NC_009788	GGAT	2	8	17009	17016	25 %	25 %	50 %	0 %	157149433
22	NC_009788	GTCA	2	8	17176	17183	25 %	25 %	25 %	25 %	157149433
23	NC_009788	GCCG	2	8	17280	17287	0 %	0 %	50 %	50 %	157149433
24	NC_009788	GCGA	2	8	18413	18420	25 %	0 %	50 %	25 %	157149460
25	NC_009788	GCTG	2	8	19147	19154	0 %	25 %	50 %	25 %	157149441
26	NC_009788	GGCT	2	8	19280	19287	0 %	25 %	50 %	25 %	157149441
27	NC_009788	GCCG	2	8	19337	19344	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
28	NC_009788	CCTG	2	8	19548	19555	0 %	25 %	25 %	50 %	157149441
29	NC_009788	CAGT	2	8	20765	20772	25 %	25 %	25 %	25 %	157149436
30	NC_009788	CAAA	2	8	21525	21532	75 %	0 %	0 %	25 %	157149456
31	NC_009788	GAAA	2	8	21830	21837	75 %	0 %	25 %	0 %	157149456
32	NC_009788	GGCT	2	8	22311	22318	0 %	25 %	50 %	25 %	157149486
33	NC_009788	TTCA	2	8	25968	25975	25 %	50 %	0 %	25 %	157149462
34	NC_009788	TCCT	2	8	27357	27364	0 %	50 %	0 %	50 %	157149440
35	NC_009788	TCCA	2	8	27894	27901	25 %	25 %	0 %	50 %	157149440
36	NC_009788	TCCA	2	8	28020	28027	25 %	25 %	0 %	50 %	157149440
37	NC_009788	AGGA	2	8	29000	29007	50 %	0 %	50 %	0 %	157149469
38	NC_009788	TGGA	2	8	29274	29281	25 %	25 %	50 %	0 %	157149455
39	NC_009788	GAAA	2	8	29528	29535	75 %	0 %	25 %	0 %	157149455
40	NC_009788	TCGC	2	8	29996	30003	0 %	25 %	25 %	50 %	157149455
41	NC_009788	GTTT	2	8	30915	30922	0 %	75 %	25 %	0 %	157149450
42	NC_009788	TTCA	2	8	31843	31850	25 %	50 %	0 %	25 %	157149450
43	NC_009788	TGCA	2	8	31933	31940	25 %	25 %	25 %	25 %	157149430
44	NC_009788	GTAA	2	8	32150	32157	50 %	25 %	25 %	0 %	157149430
45	NC_009788	ATTT	2	8	32251	32258	25 %	75 %	0 %	0 %	157149430
46	NC_009788	GGCT	2	8	32278	32285	0 %	25 %	50 %	25 %	157149430
47	NC_009788	TAAA	2	8	32308	32315	75 %	25 %	0 %	0 %	157149430
48	NC_009788	GCCT	2	8	33374	33381	0 %	25 %	25 %	50 %	157149430
49	NC_009788	AATT	2	8	33952	33959	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
50	NC_009788	TATG	2	8	33967	33974	25 %	50 %	25 %	0 %	157149430
51	NC_009788	TGTT	2	8	34099	34106	0 %	75 %	25 %	0 %	157149430
52	NC_009788	AATG	2	8	35112	35119	50 %	25 %	25 %	0 %	157149448
53	NC_009788	CTTG	2	8	35139	35146	0 %	50 %	25 %	25 %	157149448
54	NC_009788	GATA	2	8	35226	35233	50 %	25 %	25 %	0 %	157149448
55	NC_009788	ATTT	2	8	35451	35458	25 %	75 %	0 %	0 %	157149448
56	NC_009788	CCCT	2	8	35605	35612	0 %	25 %	0 %	75 %	157149448
57	NC_009788	TTTC	2	8	38576	38583	0 %	75 %	0 %	25 %	157149479
58	NC_009788	CGAT	2	8	39308	39315	25 %	25 %	25 %	25 %	157149439
59	NC_009788	CTGG	2	8	39318	39325	0 %	25 %	50 %	25 %	157149439
60	NC_009788	CTGA	2	8	39594	39601	25 %	25 %	25 %	25 %	157149494
61	NC_009788	CAAC	2	8	40639	40646	50 %	0 %	0 %	50 %	157149494
62	NC_009788	CTGG	2	8	41520	41527	0 %	25 %	50 %	25 %	157149463
63	NC_009788	CAGC	2	8	42749	42756	25 %	0 %	25 %	50 %	157149471
64	NC_009788	GGCA	2	8	42882	42889	25 %	0 %	50 %	25 %	157149471
65	NC_009788	CGGA	2	8	43401	43408	25 %	0 %	50 %	25 %	157149471
66	NC_009788	CGTT	2	8	43431	43438	0 %	50 %	25 %	25 %	157149471
67	NC_009788	AAGA	2	8	45774	45781	75 %	0 %	25 %	0 %	157149464
68	NC_009788	TGGC	2	8	46039	46046	0 %	25 %	50 %	25 %	157149464
69	NC_009788	GTCA	2	8	49095	49102	25 %	25 %	25 %	25 %	157149485
70	NC_009788	GGCA	2	8	49547	49554	25 %	0 %	50 %	25 %	157149485
71	NC_009788	GGCA	2	8	50209	50216	25 %	0 %	50 %	25 %	157149492
72	NC_009788	TGGC	2	8	51973	51980	0 %	25 %	50 %	25 %	157149465
73	NC_009788	CTGG	2	8	53127	53134	0 %	25 %	50 %	25 %	157149465
74	NC_009788	GACA	2	8	54860	54867	50 %	0 %	25 %	25 %	157149444
75	NC_009788	AGAT	2	8	55073	55080	50 %	25 %	25 %	0 %	157149444
76	NC_009788	TTGA	2	8	55090	55097	25 %	50 %	25 %	0 %	157149444
77	NC_009788	CTTC	2	8	55856	55863	0 %	50 %	0 %	50 %	157149495
78	NC_009788	TTGT	2	8	55966	55973	0 %	75 %	25 %	0 %	157149495
79	NC_009788	CAGC	2	8	56691	56698	25 %	0 %	25 %	50 %	157149495
80	NC_009788	CAAA	2	8	56733	56740	75 %	0 %	0 %	25 %	157149495
81	NC_009788	CTTT	2	8	56996	57003	0 %	75 %	0 %	25 %	157149495
82	NC_009788	GCCA	2	8	57159	57166	25 %	0 %	25 %	50 %	157149495
83	NC_009788	CCAT	2	8	57596	57603	25 %	25 %	0 %	50 %	157149495
84	NC_009788	GTTT	2	8	57737	57744	0 %	75 %	25 %	0 %	157149495
85	NC_009788	GGCA	2	8	57870	57877	25 %	0 %	50 %	25 %	157149495
86	NC_009788	CGAA	2	8	58404	58411	50 %	0 %	25 %	25 %	157149495
87	NC_009788	CAGG	2	8	59327	59334	25 %	0 %	50 %	25 %	157149438
88	NC_009788	ATCA	2	8	59840	59847	50 %	25 %	0 %	25 %	157149493
89	NC_009788	GCTG	2	8	59944	59951	0 %	25 %	50 %	25 %	157149493
90	NC_009788	AGTC	2	8	60088	60095	25 %	25 %	25 %	25 %	157149493
91	NC_009788	TGCA	2	8	61511	61518	25 %	25 %	25 %	25 %	157149461
92	NC_009788	TGGA	2	8	61649	61656	25 %	25 %	50 %	0 %	157149461
93	NC_009788	CCGG	2	8	62194	62201	0 %	0 %	50 %	50 %	157149461
94	NC_009788	GGCG	2	8	62539	62546	0 %	0 %	75 %	25 %	157149461
95	NC_009788	CCAG	2	8	62903	62910	25 %	0 %	25 %	50 %	157149431
96	NC_009788	CCGG	2	8	63018	63025	0 %	0 %	50 %	50 %	157149452
97	NC_009788	AGGC	2	8	63396	63403	25 %	0 %	50 %	25 %	157149452
98	NC_009788	GTGA	2	8	64092	64099	25 %	25 %	50 %	0 %	157149442
99	NC_009788	TCCT	2	8	64206	64213	0 %	50 %	0 %	50 %	157149442
100	NC_009788	CAGC	2	8	64280	64287	25 %	0 %	25 %	50 %	157149442
101	NC_009788	CCAG	2	8	64559	64566	25 %	0 %	25 %	50 %	157149442
102	NC_009788	TGAA	2	8	65391	65398	50 %	25 %	25 %	0 %	157149434
103	NC_009788	CAGC	2	8	67169	67176	25 %	0 %	25 %	50 %	157149474
104	NC_009788	ACGG	2	8	68684	68691	25 %	0 %	50 %	25 %	157149458
105	NC_009788	CAGC	2	8	68769	68776	25 %	0 %	25 %	50 %	157149458
106	NC_009788	GAAA	2	8	68874	68881	75 %	0 %	25 %	0 %	157149458
107	NC_009788	GTGA	2	8	69339	69346	25 %	25 %	50 %	0 %	157149480

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.