MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	ACCTG	2	10	1270	1279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009787	CTGCC	2	10	6108	6117	0 %	20 %	20 %	60 %	157149405
3	NC_009787	AATAA	2	10	7037	7046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009787	TGTTT	2	10	7818	7827	0 %	80 %	20 %	0 %	157149414
5	NC_009787	ATAAA	2	10	8353	8362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009787	CATGG	2	10	10287	10296	20 %	20 %	40 %	20 %	157149422
7	NC_009787	CAGGA	2	10	11804	11813	40 %	0 %	40 %	20 %	157149420
8	NC_009787	ACAGT	2	10	15632	15641	40 %	20 %	20 %	20 %	157149421
9	NC_009787	ACGGT	2	10	15870	15879	20 %	20 %	40 %	20 %	157149412
10	NC_009787	GTGCC	2	10	16160	16169	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009787	GGCAC	2	10	16376	16385	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009787	TGGCG	2	10	17260	17269	0 %	20 %	60 %	20 %	157149409
13	NC_009787	CCAGC	2	10	18290	18299	20 %	0 %	20 %	60 %	157149426
14	NC_009787	CCCGT	2	10	18935	18944	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009787	GCCGC	2	10	18985	18994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009787	CCCGT	2	10	20255	20264	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009787	GCCGC	2	10	20306	20315	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009787	GAAAA	2	10	20362	20371	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009787	AGTTC	2	10	20398	20407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009787	TAAAT	2	10	24260	24269	60 %	40 %	0 %	0 %	157149413
21	NC_009787	TATTT	2	10	24725	24734	20 %	80 %	0 %	0 %	157149413
22	NC_009787	CCAAA	2	10	24988	24997	60 %	0 %	0 %	40 %	157149413
23	NC_009787	CTATC	2	10	26891	26900	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009787	AAAGT	2	10	30188	30197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009787	CTTTA	2	10	30198	30207	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009787	CCTCA	2	10	31294	31303	20 %	20 %	0 %	60 %	157149401
27	NC_009787	GTTGA	2	10	31435	31444	20 %	40 %	40 %	0 %	157149401

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.