MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	CGCT	2	8	475	482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009787	CGGT	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009787	CGCA	2	8	882	889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009787	ACGT	2	8	929	936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009787	CCGC	2	8	1434	1441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009787	CGGT	2	8	1756	1763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009787	CAGC	2	8	2006	2013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009787	GCCT	2	8	2236	2243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009787	CGTG	2	8	2343	2350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009787	TTCA	2	8	3516	3523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009787	TGAT	2	8	4767	4774	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
12	NC_009787	TCTG	2	8	5004	5011	0 %	50 %	25 %	25 %	157149405
13	NC_009787	AGCC	2	8	5802	5809	25 %	0 %	25 %	50 %	157149405
14	NC_009787	TAGT	2	8	5910	5917	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
15	NC_009787	AGAA	2	8	6988	6995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009787	CAAC	2	8	8174	8181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009787	TAAA	2	8	8465	8472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009787	GCTG	2	8	9110	9117	0 %	25 %	50 %	25 %	157149422
19	NC_009787	GCTG	2	8	9272	9279	0 %	25 %	50 %	25 %	157149422
20	NC_009787	CCTG	2	8	10114	10121	0 %	25 %	25 %	50 %	157149422
21	NC_009787	GCCA	2	8	10180	10187	25 %	0 %	25 %	50 %	157149422
22	NC_009787	CAGC	2	8	11036	11043	25 %	0 %	25 %	50 %	157149422
23	NC_009787	GGGC	2	8	11089	11096	0 %	0 %	75 %	25 %	157149422
24	NC_009787	GGCG	2	8	11151	11158	0 %	0 %	75 %	25 %	157149422
25	NC_009787	TTCA	2	8	11644	11651	25 %	50 %	0 %	25 %	157149420
26	NC_009787	AGGG	2	8	11954	11961	25 %	0 %	75 %	0 %	157149420
27	NC_009787	GACA	2	8	11963	11970	50 %	0 %	25 %	25 %	157149420
28	NC_009787	GAAC	2	8	12649	12656	50 %	0 %	25 %	25 %	157149420
29	NC_009787	TAAA	2	8	12849	12856	75 %	25 %	0 %	0 %	157149420
30	NC_009787	AAAT	2	8	12872	12879	75 %	25 %	0 %	0 %	157149420
31	NC_009787	CGAT	2	8	12992	12999	25 %	25 %	25 %	25 %	157149423
32	NC_009787	CGGG	2	8	13375	13382	0 %	0 %	75 %	25 %	157149423
33	NC_009787	TACT	2	8	14023	14030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009787	TGAC	2	8	14202	14209	25 %	25 %	25 %	25 %	157149403
35	NC_009787	AAAT	2	8	14215	14222	75 %	25 %	0 %	0 %	157149403
36	NC_009787	AAAT	2	8	14241	14248	75 %	25 %	0 %	0 %	157149403
37	NC_009787	CAGT	2	8	14473	14480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009787	GGCA	2	8	14542	14549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009787	CTGC	2	8	15347	15354	0 %	25 %	25 %	50 %	157149421
40	NC_009787	CCGT	2	8	15681	15688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009787	AGTC	2	8	15779	15786	25 %	25 %	25 %	25 %	157149412
42	NC_009787	ACGA	2	8	16278	16285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009787	ACTG	2	8	17041	17048	25 %	25 %	25 %	25 %	157149409
44	NC_009787	TCAT	2	8	17292	17299	25 %	50 %	0 %	25 %	157149409
45	NC_009787	CTGC	2	8	18177	18184	0 %	25 %	25 %	50 %	157149426
46	NC_009787	ACGC	2	8	18665	18672	25 %	0 %	25 %	50 %	157149426
47	NC_009787	CTGG	2	8	18887	18894	0 %	25 %	50 %	25 %	157149428
48	NC_009787	GCCC	2	8	19059	19066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_009787	GCCA	2	8	19218	19225	25 %	0 %	25 %	50 %	157149410
50	NC_009787	TGAA	2	8	19340	19347	50 %	25 %	25 %	0 %	157149410
51	NC_009787	CAGC	2	8	19753	19760	25 %	0 %	25 %	50 %	157149410
52	NC_009787	CCGG	2	8	20267	20274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009787	GCAG	2	8	20505	20512	25 %	0 %	50 %	25 %	157149427
54	NC_009787	ACGA	2	8	20561	20568	50 %	0 %	25 %	25 %	157149427
55	NC_009787	CTGT	2	8	20634	20641	0 %	50 %	25 %	25 %	157149427
56	NC_009787	TTCT	2	8	20732	20739	0 %	75 %	0 %	25 %	157149427
57	NC_009787	GGCA	2	8	21343	21350	25 %	0 %	50 %	25 %	157149418
58	NC_009787	TCAG	2	8	21683	21690	25 %	25 %	25 %	25 %	157149418
59	NC_009787	ATAA	2	8	21826	21833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009787	AACA	2	8	21972	21979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009787	AATC	2	8	22757	22764	50 %	25 %	0 %	25 %	157149417
62	NC_009787	AGCA	2	8	23003	23010	50 %	0 %	25 %	25 %	157149417
63	NC_009787	CTGG	2	8	23273	23280	0 %	25 %	50 %	25 %	157149417
64	NC_009787	TTTA	2	8	24407	24414	25 %	75 %	0 %	0 %	157149413
65	NC_009787	ATAA	2	8	24476	24483	75 %	25 %	0 %	0 %	157149413
66	NC_009787	AGTA	2	8	24766	24773	50 %	25 %	25 %	0 %	157149413
67	NC_009787	AAAT	2	8	24886	24893	75 %	25 %	0 %	0 %	157149413
68	NC_009787	CTTT	2	8	25125	25132	0 %	75 %	0 %	25 %	157149413
69	NC_009787	TTAT	2	8	25284	25291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009787	TCCC	2	8	25341	25348	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_009787	GTCT	2	8	26913	26920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009787	ATTT	2	8	27419	27426	25 %	75 %	0 %	0 %	157149408
73	NC_009787	GAAA	2	8	27435	27442	75 %	0 %	25 %	0 %	157149408
74	NC_009787	CTAT	2	8	27568	27575	25 %	50 %	0 %	25 %	157149408
75	NC_009787	GCAG	2	8	27716	27723	25 %	0 %	50 %	25 %	157149408
76	NC_009787	ACCC	2	8	28309	28316	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009787	CCAG	2	8	28465	28472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009787	GAGG	2	8	28569	28576	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009787	TCTG	2	8	28690	28697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009787	AATG	2	8	28733	28740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009787	CTGT	2	8	29372	29379	0 %	50 %	25 %	25 %	157149419
82	NC_009787	GTCG	2	8	29468	29475	0 %	25 %	50 %	25 %	157149419
83	NC_009787	GGTA	2	8	29512	29519	25 %	25 %	50 %	0 %	157149419
84	NC_009787	AGAA	2	8	29947	29954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009787	GCCA	2	8	30138	30145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009787	AGTC	2	8	30382	30389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009787	TCTG	2	8	30447	30454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009787	CGGG	2	8	30649	30656	0 %	0 %	75 %	25 %	157149415
89	NC_009787	CAGC	2	8	31107	31114	25 %	0 %	25 %	50 %	157149401
90	NC_009787	CATC	2	8	31317	31324	25 %	25 %	0 %	50 %	157149401
91	NC_009787	AACC	2	8	31470	31477	50 %	0 %	0 %	50 %	157149401
92	NC_009787	ACTG	2	8	31614	31621	25 %	25 %	25 %	25 %	157149401
93	NC_009787	CAGT	2	8	32138	32145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009787	CATT	2	8	32283	32290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009787	GAGG	2	8	32411	32418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009787	CCTG	2	8	32546	32553	0 %	25 %	25 %	50 %	157149406
97	NC_009787	GCCA	2	8	32924	32931	25 %	0 %	25 %	50 %	157149406
98	NC_009787	GCCC	2	8	33048	33055	0 %	0 %	25 %	75 %	157149406
99	NC_009787	CCGG	2	8	33600	33607	0 %	0 %	50 %	50 %	157149407

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.