MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	CGCT	2	8	475	482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009787	CGGT	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009787	CGCA	2	8	882	889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009787	ACGT	2	8	929	936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009787	CCGC	2	8	1434	1441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009787	CGGT	2	8	1756	1763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009787	CAGC	2	8	2006	2013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009787	GCCT	2	8	2236	2243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009787	CGTG	2	8	2343	2350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009787	TTCA	2	8	3516	3523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009787	AGAA	2	8	6988	6995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009787	CAAC	2	8	8174	8181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009787	TAAA	2	8	8465	8472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009787	TACT	2	8	14023	14030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009787	CAGT	2	8	14473	14480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009787	GGCA	2	8	14542	14549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009787	CCGT	2	8	15681	15688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009787	ACGA	2	8	16278	16285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009787	GCCC	2	8	19059	19066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_009787	CCGG	2	8	20267	20274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009787	ATAA	2	8	21826	21833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009787	AACA	2	8	21972	21979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009787	TTAT	2	8	25284	25291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009787	TCCC	2	8	25341	25348	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009787	GTCT	2	8	26913	26920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009787	ACCC	2	8	28309	28316	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009787	CCAG	2	8	28465	28472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009787	GAGG	2	8	28569	28576	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009787	TCTG	2	8	28690	28697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009787	AATG	2	8	28733	28740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009787	AGAA	2	8	29947	29954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009787	GCCA	2	8	30138	30145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009787	AGTC	2	8	30382	30389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009787	TCTG	2	8	30447	30454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009787	CAGT	2	8	32138	32145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009787	CATT	2	8	32283	32290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009787	GAGG	2	8	32411	32418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.