MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	TGAT	2	8	4767	4774	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
2	NC_009787	TCTG	2	8	5004	5011	0 %	50 %	25 %	25 %	157149405
3	NC_009787	AGCC	2	8	5802	5809	25 %	0 %	25 %	50 %	157149405
4	NC_009787	TAGT	2	8	5910	5917	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
5	NC_009787	GCTG	2	8	9110	9117	0 %	25 %	50 %	25 %	157149422
6	NC_009787	GCTG	2	8	9272	9279	0 %	25 %	50 %	25 %	157149422
7	NC_009787	CCTG	2	8	10114	10121	0 %	25 %	25 %	50 %	157149422
8	NC_009787	GCCA	2	8	10180	10187	25 %	0 %	25 %	50 %	157149422
9	NC_009787	CAGC	2	8	11036	11043	25 %	0 %	25 %	50 %	157149422
10	NC_009787	GGGC	2	8	11089	11096	0 %	0 %	75 %	25 %	157149422
11	NC_009787	GGCG	2	8	11151	11158	0 %	0 %	75 %	25 %	157149422
12	NC_009787	TTCA	2	8	11644	11651	25 %	50 %	0 %	25 %	157149420
13	NC_009787	AGGG	2	8	11954	11961	25 %	0 %	75 %	0 %	157149420
14	NC_009787	GACA	2	8	11963	11970	50 %	0 %	25 %	25 %	157149420
15	NC_009787	GAAC	2	8	12649	12656	50 %	0 %	25 %	25 %	157149420
16	NC_009787	TAAA	2	8	12849	12856	75 %	25 %	0 %	0 %	157149420
17	NC_009787	AAAT	2	8	12872	12879	75 %	25 %	0 %	0 %	157149420
18	NC_009787	CGAT	2	8	12992	12999	25 %	25 %	25 %	25 %	157149423
19	NC_009787	CGGG	2	8	13375	13382	0 %	0 %	75 %	25 %	157149423
20	NC_009787	TGAC	2	8	14202	14209	25 %	25 %	25 %	25 %	157149403
21	NC_009787	AAAT	2	8	14215	14222	75 %	25 %	0 %	0 %	157149403
22	NC_009787	AAAT	2	8	14241	14248	75 %	25 %	0 %	0 %	157149403
23	NC_009787	CTGC	2	8	15347	15354	0 %	25 %	25 %	50 %	157149421
24	NC_009787	AGTC	2	8	15779	15786	25 %	25 %	25 %	25 %	157149412
25	NC_009787	ACTG	2	8	17041	17048	25 %	25 %	25 %	25 %	157149409
26	NC_009787	TCAT	2	8	17292	17299	25 %	50 %	0 %	25 %	157149409
27	NC_009787	CTGC	2	8	18177	18184	0 %	25 %	25 %	50 %	157149426
28	NC_009787	ACGC	2	8	18665	18672	25 %	0 %	25 %	50 %	157149426
29	NC_009787	CTGG	2	8	18887	18894	0 %	25 %	50 %	25 %	157149428
30	NC_009787	GCCA	2	8	19218	19225	25 %	0 %	25 %	50 %	157149410
31	NC_009787	TGAA	2	8	19340	19347	50 %	25 %	25 %	0 %	157149410
32	NC_009787	CAGC	2	8	19753	19760	25 %	0 %	25 %	50 %	157149410
33	NC_009787	GCAG	2	8	20505	20512	25 %	0 %	50 %	25 %	157149427
34	NC_009787	ACGA	2	8	20561	20568	50 %	0 %	25 %	25 %	157149427
35	NC_009787	CTGT	2	8	20634	20641	0 %	50 %	25 %	25 %	157149427
36	NC_009787	TTCT	2	8	20732	20739	0 %	75 %	0 %	25 %	157149427
37	NC_009787	GGCA	2	8	21343	21350	25 %	0 %	50 %	25 %	157149418
38	NC_009787	TCAG	2	8	21683	21690	25 %	25 %	25 %	25 %	157149418
39	NC_009787	AATC	2	8	22757	22764	50 %	25 %	0 %	25 %	157149417
40	NC_009787	AGCA	2	8	23003	23010	50 %	0 %	25 %	25 %	157149417
41	NC_009787	CTGG	2	8	23273	23280	0 %	25 %	50 %	25 %	157149417
42	NC_009787	TTTA	2	8	24407	24414	25 %	75 %	0 %	0 %	157149413
43	NC_009787	ATAA	2	8	24476	24483	75 %	25 %	0 %	0 %	157149413
44	NC_009787	AGTA	2	8	24766	24773	50 %	25 %	25 %	0 %	157149413
45	NC_009787	AAAT	2	8	24886	24893	75 %	25 %	0 %	0 %	157149413
46	NC_009787	CTTT	2	8	25125	25132	0 %	75 %	0 %	25 %	157149413
47	NC_009787	ATTT	2	8	27419	27426	25 %	75 %	0 %	0 %	157149408
48	NC_009787	GAAA	2	8	27435	27442	75 %	0 %	25 %	0 %	157149408
49	NC_009787	CTAT	2	8	27568	27575	25 %	50 %	0 %	25 %	157149408
50	NC_009787	GCAG	2	8	27716	27723	25 %	0 %	50 %	25 %	157149408
51	NC_009787	CTGT	2	8	29372	29379	0 %	50 %	25 %	25 %	157149419
52	NC_009787	GTCG	2	8	29468	29475	0 %	25 %	50 %	25 %	157149419
53	NC_009787	GGTA	2	8	29512	29519	25 %	25 %	50 %	0 %	157149419
54	NC_009787	CGGG	2	8	30649	30656	0 %	0 %	75 %	25 %	157149415
55	NC_009787	CAGC	2	8	31107	31114	25 %	0 %	25 %	50 %	157149401
56	NC_009787	CATC	2	8	31317	31324	25 %	25 %	0 %	50 %	157149401
57	NC_009787	AACC	2	8	31470	31477	50 %	0 %	0 %	50 %	157149401
58	NC_009787	ACTG	2	8	31614	31621	25 %	25 %	25 %	25 %	157149401
59	NC_009787	CCTG	2	8	32546	32553	0 %	25 %	25 %	50 %	157149406
60	NC_009787	GCCA	2	8	32924	32931	25 %	0 %	25 %	50 %	157149406
61	NC_009787	GCCC	2	8	33048	33055	0 %	0 %	25 %	75 %	157149406
62	NC_009787	CCGG	2	8	33600	33607	0 %	0 %	50 %	50 %	157149407

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.