MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	GTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
2	NC_009787	CCA	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
3	NC_009787	GGA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
4	NC_009787	TCC	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149405
5	NC_009787	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
6	NC_009787	AGG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
7	NC_009787	CAG	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
8	NC_009787	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
9	NC_009787	AGG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
10	NC_009787	ACG	2	6	5122	5127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
11	NC_009787	CAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149405
12	NC_009787	CAC	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
13	NC_009787	TTC	3	9	5366	5374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
14	NC_009787	TCC	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149405
15	NC_009787	GAA	3	9	5501	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149405
16	NC_009787	CAG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
17	NC_009787	GCC	3	9	5535	5543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149405
18	NC_009787	TTC	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
19	NC_009787	GCC	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149405
20	NC_009787	AAT	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
21	NC_009787	AAG	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149405
22	NC_009787	CAG	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
23	NC_009787	TGG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149405
24	NC_009787	TCG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
25	NC_009787	TAA	2	6	5794	5799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
26	NC_009787	TCT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
27	NC_009787	CAG	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
28	NC_009787	CAC	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
29	NC_009787	CAT	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
30	NC_009787	GAT	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149405
31	NC_009787	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
32	NC_009787	AGC	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
33	NC_009787	GCG	2	6	6594	6599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149405
34	NC_009787	AAT	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
35	NC_009787	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
36	NC_009787	TAA	2	6	6699	6704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
37	NC_009787	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
38	NC_009787	ATA	2	6	6774	6779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
39	NC_009787	CAG	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
40	NC_009787	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
41	NC_009787	ATT	2	6	6869	6874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149405
42	NC_009787	ATA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
43	NC_009787	CTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149414
44	NC_009787	TTA	2	6	7169	7174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149414
45	NC_009787	GCA	2	6	7382	7387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149414
46	NC_009787	CGC	2	6	7450	7455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149414
47	NC_009787	ATC	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
48	NC_009787	CTT	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149422
49	NC_009787	TTA	2	6	8707	8712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149422
50	NC_009787	TTC	2	6	8745	8750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149422
51	NC_009787	CAT	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
52	NC_009787	GAC	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
53	NC_009787	CAC	2	6	8834	8839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
54	NC_009787	TGT	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
55	NC_009787	CGC	2	6	8861	8866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149422
56	NC_009787	CCA	2	6	8929	8934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
57	NC_009787	GAG	2	6	8935	8940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149422
58	NC_009787	AAC	2	6	8998	9003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149422
59	NC_009787	AGC	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
60	NC_009787	AGT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149422
61	NC_009787	TGT	2	6	9167	9172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
62	NC_009787	CAT	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
63	NC_009787	GAC	2	6	9265	9270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
64	NC_009787	CCA	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
65	NC_009787	CAG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
66	NC_009787	CCA	2	6	9502	9507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
67	NC_009787	CCT	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149422
68	NC_009787	CTG	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
69	NC_009787	GGT	2	6	9711	9716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149422
70	NC_009787	GCT	2	6	9731	9736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
71	NC_009787	TGC	3	9	9829	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
72	NC_009787	GCT	2	6	9840	9845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
73	NC_009787	TTG	2	6	10033	10038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
74	NC_009787	GAC	2	6	10066	10071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
75	NC_009787	ACC	2	6	10126	10131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
76	NC_009787	CGG	2	6	10190	10195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149422
77	NC_009787	CTG	2	6	10250	10255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
78	NC_009787	TAA	2	6	10358	10363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
79	NC_009787	CAC	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
80	NC_009787	GAT	2	6	10614	10619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149422
81	NC_009787	TGG	2	6	10811	10816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149422
82	NC_009787	TCA	2	6	10913	10918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
83	NC_009787	TTG	2	6	10936	10941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
84	NC_009787	ATA	2	6	10948	10953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
85	NC_009787	CAC	2	6	10959	10964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
86	NC_009787	AAT	2	6	11217	11222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
87	NC_009787	ATA	2	6	11296	11301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
88	NC_009787	CGG	2	6	11345	11350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149422
89	NC_009787	CCG	2	6	11431	11436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149422
90	NC_009787	CTG	2	6	11477	11482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
91	NC_009787	GAG	2	6	11519	11524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149420
92	NC_009787	CTG	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
93	NC_009787	TGT	2	6	11552	11557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149420
94	NC_009787	ACC	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149420
95	NC_009787	TGA	2	6	11832	11837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149420
96	NC_009787	CCA	2	6	12008	12013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149420
97	NC_009787	TCA	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149420
98	NC_009787	TGC	2	6	12135	12140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
99	NC_009787	CCG	2	6	12242	12247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149420
100	NC_009787	GAG	2	6	12266	12271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149420
101	NC_009787	CTG	2	6	12322	12327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
102	NC_009787	GCC	2	6	12371	12376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149420
103	NC_009787	CAG	2	6	12408	12413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149420
104	NC_009787	TCT	2	6	12417	12422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149420
105	NC_009787	CGC	2	6	12490	12495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149420
106	NC_009787	TAA	2	6	12540	12545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149420
107	NC_009787	GCC	2	6	12674	12679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149420
108	NC_009787	AGC	2	6	12797	12802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149420
109	NC_009787	GTG	2	6	12957	12962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149420
110	NC_009787	ATG	2	6	12963	12968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149420
111	NC_009787	TCA	2	6	12969	12974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149420
112	NC_009787	CTG	2	6	13074	13079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149423
113	NC_009787	ACG	2	6	13193	13198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149423
114	NC_009787	ACG	2	6	13328	13333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149423
115	NC_009787	GCG	2	6	13337	13342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149423
116	NC_009787	ATC	2	6	13383	13388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149423
117	NC_009787	TCA	2	6	13407	13412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149423
118	NC_009787	CAT	2	6	13606	13611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149423
119	NC_009787	TGT	2	6	13666	13671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149423
120	NC_009787	GGC	2	6	13712	13717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149423
121	NC_009787	TGC	2	6	13739	13744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149423
122	NC_009787	TCC	2	6	14161	14166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149403
123	NC_009787	CTG	2	6	15045	15050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149402
124	NC_009787	CCG	2	6	15069	15074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149402
125	NC_009787	CTG	2	6	15086	15091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149402
126	NC_009787	CAC	2	6	15095	15100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149402
127	NC_009787	TCA	2	6	15114	15119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149402
128	NC_009787	GGT	2	6	15131	15136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.