MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	GA	3	6	749	754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009787	GC	3	6	2080	2085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009787	CA	3	6	2773	2778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009787	GC	3	6	3356	3361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009787	GC	3	6	3492	3497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009787	CG	3	6	3833	3838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009787	GC	4	8	4356	4363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009787	GA	3	6	4528	4533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009787	CT	3	6	5157	5162	0 %	50 %	0 %	50 %	157149405
10	NC_009787	TC	3	6	8573	8578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009787	AC	3	6	8945	8950	50 %	0 %	0 %	50 %	157149422
12	NC_009787	TC	3	6	9592	9597	0 %	50 %	0 %	50 %	157149422
13	NC_009787	GT	3	6	10457	10462	0 %	50 %	50 %	0 %	157149422
14	NC_009787	GC	3	6	11617	11622	0 %	0 %	50 %	50 %	157149420
15	NC_009787	TC	5	10	11844	11853	0 %	50 %	0 %	50 %	157149420
16	NC_009787	GT	3	6	11862	11867	0 %	50 %	50 %	0 %	157149420
17	NC_009787	GA	3	6	12803	12808	50 %	0 %	50 %	0 %	157149420
18	NC_009787	TC	3	6	13513	13518	0 %	50 %	0 %	50 %	157149423
19	NC_009787	GA	3	6	13527	13532	50 %	0 %	50 %	0 %	157149423
20	NC_009787	CG	3	6	13688	13693	0 %	0 %	50 %	50 %	157149423
21	NC_009787	GT	3	6	14529	14534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009787	CG	3	6	14996	15001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009787	GC	3	6	16006	16011	0 %	0 %	50 %	50 %	157149412
24	NC_009787	GT	4	8	17356	17363	0 %	50 %	50 %	0 %	157149424
25	NC_009787	GC	3	6	17617	17622	0 %	0 %	50 %	50 %	157149424
26	NC_009787	GT	3	6	17718	17723	0 %	50 %	50 %	0 %	157149424
27	NC_009787	CA	3	6	17950	17955	50 %	0 %	0 %	50 %	157149400
28	NC_009787	TG	3	6	18213	18218	0 %	50 %	50 %	0 %	157149426
29	NC_009787	CA	3	6	19542	19547	50 %	0 %	0 %	50 %	157149410
30	NC_009787	GT	3	6	19747	19752	0 %	50 %	50 %	0 %	157149410
31	NC_009787	AG	3	6	20037	20042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009787	CA	3	6	20698	20703	50 %	0 %	0 %	50 %	157149427
33	NC_009787	CA	3	6	22195	22200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009787	TA	3	6	22538	22543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009787	AT	3	6	22583	22588	50 %	50 %	0 %	0 %	157149417
36	NC_009787	AC	3	6	23300	23305	50 %	0 %	0 %	50 %	157149417
37	NC_009787	AT	4	8	24569	24576	50 %	50 %	0 %	0 %	157149413
38	NC_009787	TA	3	6	26769	26774	50 %	50 %	0 %	0 %	157149425
39	NC_009787	TA	3	6	27588	27593	50 %	50 %	0 %	0 %	157149408
40	NC_009787	AT	3	6	27823	27828	50 %	50 %	0 %	0 %	157149408
41	NC_009787	AT	3	6	27877	27882	50 %	50 %	0 %	0 %	157149408
42	NC_009787	GA	3	6	28351	28356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009787	CT	4	8	30272	30279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009787	TG	3	6	30337	30342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009787	TA	3	6	30672	30677	50 %	50 %	0 %	0 %	157149415
46	NC_009787	GT	3	6	31583	31588	0 %	50 %	50 %	0 %	157149401
47	NC_009787	AT	4	8	31876	31883	50 %	50 %	0 %	0 %	157149401
48	NC_009787	CT	3	6	32115	32120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009787	AC	3	6	32234	32239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009787	CT	3	6	32292	32297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009787	CG	3	6	34224	34229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.