MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	CCCGTT	2	12	2922	2933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157149386
2	NC_009786	GCTATA	2	12	8820	8831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157149383
3	NC_009786	ATCGCT	2	12	12360	12371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157149340
4	NC_009786	GGCGCT	2	12	21254	21265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157149342
5	NC_009786	CAGGTG	2	12	21285	21296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149342
6	NC_009786	GTGGCG	2	12	21375	21386	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157149342
7	NC_009786	GCCGGA	2	12	21626	21637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149342
8	NC_009786	CACTGG	2	12	23026	23037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157149354
9	NC_009786	TGGCAG	2	12	23702	23713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149352
10	NC_009786	AACACG	2	12	25633	25644	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	157149337
11	NC_009786	TGGGGA	2	12	25900	25911	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	157149337
12	NC_009786	AAAATG	2	12	32806	32817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157149385
13	NC_009786	CGTAAA	2	12	54175	54186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157149380
14	NC_009786	TTTACG	2	12	59148	59159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157149397
15	NC_009786	AAAATA	2	12	62658	62669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157149392
16	NC_009786	GTTCGA	2	12	66851	66862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157149341
17	NC_009786	ATATCA	2	12	70607	70618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157149372
18	NC_009786	AGCCGC	2	12	74311	74322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157149382
19	NC_009786	GTTCGA	2	12	74426	74437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157149382

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.