MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	CAGCA	2	10	2191	2200	40 %	0 %	20 %	40 %	157149386
2	NC_009786	ACGCC	2	10	3112	3121	20 %	0 %	20 %	60 %	157149386
3	NC_009786	TCAGT	2	10	4869	4878	20 %	40 %	20 %	20 %	157149373
4	NC_009786	CCCGT	2	10	6846	6855	0 %	20 %	20 %	60 %	157149358
5	NC_009786	GCCGC	2	10	6896	6905	0 %	0 %	40 %	60 %	157149358
6	NC_009786	CCTTT	2	10	8252	8261	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009786	ATAAA	2	10	8521	8530	80 %	20 %	0 %	0 %	157149383
8	NC_009786	TCCCC	2	10	8744	8753	0 %	20 %	0 %	80 %	157149383
9	NC_009786	TATAA	2	10	9353	9362	60 %	40 %	0 %	0 %	157149383
10	NC_009786	AGTAT	2	10	11253	11262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009786	GAGCA	2	10	11682	11691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009786	CTGAC	2	10	12737	12746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009786	GAGTA	2	10	13828	13837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009786	ACACG	2	10	14207	14216	40 %	0 %	20 %	40 %	157149350
15	NC_009786	TTGTT	2	10	15266	15275	0 %	80 %	20 %	0 %	157149350
16	NC_009786	AAACA	2	10	16583	16592	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009786	CAATT	2	10	17762	17771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009786	GGTGG	2	10	21801	21810	0 %	20 %	80 %	0 %	157149342
19	NC_009786	CCGCC	2	10	22638	22647	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_009786	ACTGA	2	10	22686	22695	40 %	20 %	20 %	20 %	157149354
21	NC_009786	GCAGA	2	10	23516	23525	40 %	0 %	40 %	20 %	157149352
22	NC_009786	ATCAC	2	10	24734	24743	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009786	TCTGG	2	10	25695	25704	0 %	40 %	40 %	20 %	157149337
24	NC_009786	AGCTG	2	10	27538	27547	20 %	20 %	40 %	20 %	229220657
25	NC_009786	GATTT	2	10	28797	28806	20 %	60 %	20 %	0 %	157149379
26	NC_009786	TAGAA	2	10	33619	33628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009786	ACCAA	2	10	37860	37869	60 %	0 %	0 %	40 %	157149369
28	NC_009786	GTGAA	2	10	38487	38496	40 %	20 %	40 %	0 %	157149338
29	NC_009786	CATTT	2	10	38870	38879	20 %	60 %	0 %	20 %	157149338
30	NC_009786	AAAAG	2	10	39026	39035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009786	CAGTG	2	10	39223	39232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009786	CGGCC	2	10	39576	39585	0 %	0 %	40 %	60 %	157149364
33	NC_009786	TCGCT	2	10	40295	40304	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009786	TGGGA	2	10	42605	42614	20 %	20 %	60 %	0 %	157149346
35	NC_009786	CTTTC	2	10	43230	43239	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009786	GTCCC	2	10	43683	43692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009786	CGTCC	2	10	43693	43702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_009786	GTCAG	2	10	45542	45551	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009786	AAGGT	2	10	46909	46918	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009786	ATTAA	2	10	49492	49501	60 %	40 %	0 %	0 %	157149381
41	NC_009786	AACCA	2	10	51257	51266	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009786	CGCCC	2	10	54504	54513	0 %	0 %	20 %	80 %	157149380
43	NC_009786	GAAAG	2	10	56148	56157	60 %	0 %	40 %	0 %	157149375
44	NC_009786	GATAA	2	10	56685	56694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009786	TTATT	2	10	57539	57548	20 %	80 %	0 %	0 %	157149368
46	NC_009786	TGCGA	2	10	57682	57691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009786	GGGCG	2	10	58821	58830	0 %	0 %	80 %	20 %	157149397
48	NC_009786	TGCAC	2	10	59664	59673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009786	CTAAG	2	10	61670	61679	40 %	20 %	20 %	20 %	157149332
50	NC_009786	AAAAT	2	10	61861	61870	80 %	20 %	0 %	0 %	157149392
51	NC_009786	GAAAT	2	10	62125	62134	60 %	20 %	20 %	0 %	157149392
52	NC_009786	ATATC	2	10	62333	62342	40 %	40 %	0 %	20 %	157149392
53	NC_009786	ATGGT	2	10	62970	62979	20 %	40 %	40 %	0 %	157149396
54	NC_009786	ACATA	2	10	64030	64039	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009786	GCACT	2	10	66927	66936	20 %	20 %	20 %	40 %	157149341
56	NC_009786	AAGAA	2	10	71016	71025	80 %	0 %	20 %	0 %	157149372
57	NC_009786	AATAA	2	10	71116	71125	80 %	20 %	0 %	0 %	157149372
58	NC_009786	GCACT	2	10	74502	74511	20 %	20 %	20 %	40 %	157149382
59	NC_009786	GCTGA	2	10	75547	75556	20 %	20 %	40 %	20 %	157149351
60	NC_009786	CGGCA	2	10	76191	76200	20 %	0 %	40 %	40 %	157149351
61	NC_009786	GGGTG	2	10	76344	76353	0 %	20 %	80 %	0 %	157149351

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.