MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	CAGCA	2	10	2191	2200	40 %	0 %	20 %	40 %	157149386
2	NC_009786	ACGCC	2	10	3112	3121	20 %	0 %	20 %	60 %	157149386
3	NC_009786	TCAGT	2	10	4869	4878	20 %	40 %	20 %	20 %	157149373
4	NC_009786	CCCGT	2	10	6846	6855	0 %	20 %	20 %	60 %	157149358
5	NC_009786	GCCGC	2	10	6896	6905	0 %	0 %	40 %	60 %	157149358
6	NC_009786	ATAAA	2	10	8521	8530	80 %	20 %	0 %	0 %	157149383
7	NC_009786	TCCCC	2	10	8744	8753	0 %	20 %	0 %	80 %	157149383
8	NC_009786	TATAA	2	10	9353	9362	60 %	40 %	0 %	0 %	157149383
9	NC_009786	ACACG	2	10	14207	14216	40 %	0 %	20 %	40 %	157149350
10	NC_009786	TTGTT	2	10	15266	15275	0 %	80 %	20 %	0 %	157149350
11	NC_009786	GGTGG	2	10	21801	21810	0 %	20 %	80 %	0 %	157149342
12	NC_009786	ACTGA	2	10	22686	22695	40 %	20 %	20 %	20 %	157149354
13	NC_009786	GCAGA	2	10	23516	23525	40 %	0 %	40 %	20 %	157149352
14	NC_009786	TCTGG	2	10	25695	25704	0 %	40 %	40 %	20 %	157149337
15	NC_009786	AGCTG	2	10	27538	27547	20 %	20 %	40 %	20 %	229220657
16	NC_009786	GATTT	2	10	28797	28806	20 %	60 %	20 %	0 %	157149379
17	NC_009786	ACCAA	2	10	37860	37869	60 %	0 %	0 %	40 %	157149369
18	NC_009786	GTGAA	2	10	38487	38496	40 %	20 %	40 %	0 %	157149338
19	NC_009786	CATTT	2	10	38870	38879	20 %	60 %	0 %	20 %	157149338
20	NC_009786	CGGCC	2	10	39576	39585	0 %	0 %	40 %	60 %	157149364
21	NC_009786	TGGGA	2	10	42605	42614	20 %	20 %	60 %	0 %	157149346
22	NC_009786	ATTAA	2	10	49492	49501	60 %	40 %	0 %	0 %	157149381
23	NC_009786	CGCCC	2	10	54504	54513	0 %	0 %	20 %	80 %	157149380
24	NC_009786	GAAAG	2	10	56148	56157	60 %	0 %	40 %	0 %	157149375
25	NC_009786	TTATT	2	10	57539	57548	20 %	80 %	0 %	0 %	157149368
26	NC_009786	GGGCG	2	10	58821	58830	0 %	0 %	80 %	20 %	157149397
27	NC_009786	CTAAG	2	10	61670	61679	40 %	20 %	20 %	20 %	157149332
28	NC_009786	AAAAT	2	10	61861	61870	80 %	20 %	0 %	0 %	157149392
29	NC_009786	GAAAT	2	10	62125	62134	60 %	20 %	20 %	0 %	157149392
30	NC_009786	ATATC	2	10	62333	62342	40 %	40 %	0 %	20 %	157149392
31	NC_009786	ATGGT	2	10	62970	62979	20 %	40 %	40 %	0 %	157149396
32	NC_009786	GCACT	2	10	66927	66936	20 %	20 %	20 %	40 %	157149341
33	NC_009786	AAGAA	2	10	71016	71025	80 %	0 %	20 %	0 %	157149372
34	NC_009786	AATAA	2	10	71116	71125	80 %	20 %	0 %	0 %	157149372
35	NC_009786	GCACT	2	10	74502	74511	20 %	20 %	20 %	40 %	157149382
36	NC_009786	GCTGA	2	10	75547	75556	20 %	20 %	40 %	20 %	157149351
37	NC_009786	CGGCA	2	10	76191	76200	20 %	0 %	40 %	40 %	157149351
38	NC_009786	GGGTG	2	10	76344	76353	0 %	20 %	80 %	0 %	157149351

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.