MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	GTAG	2	8	4034	4041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009786	TTAT	2	8	4145	4152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009786	GAAA	2	8	5599	5606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009786	ATTG	2	8	7019	7026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009786	TTGT	2	8	8148	8155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009786	GAAA	2	8	8278	8285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009786	TTTC	2	8	11375	11382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009786	GACC	2	8	11923	11930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009786	TGCC	2	8	12138	12145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009786	AATC	2	8	12898	12905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009786	ACCG	2	8	13294	13301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009786	GCCA	2	8	15551	15558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009786	CCTG	2	8	15614	15621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009786	CTTG	2	8	15664	15671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009786	CTTT	2	8	16498	16505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009786	TTTA	2	8	17444	17451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009786	GGCA	2	8	17576	17583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009786	TAAG	2	8	20594	20601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009786	GGCG	2	8	24507	24514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009786	CTGT	2	8	24808	24815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009786	GGGC	2	8	24861	24868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009786	TGCC	2	8	25081	25088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009786	ACTG	2	8	25150	25157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009786	CCTC	2	8	27956	27963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009786	GAAA	2	8	28015	28022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009786	AATG	2	8	28079	28086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009786	ACCG	2	8	28502	28509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009786	TCAC	2	8	28567	28574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009786	CAGA	2	8	30315	30322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009786	TGGC	2	8	30631	30638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009786	CATT	2	8	32034	32041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009786	GACA	2	8	32075	32082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009786	GGGT	2	8	32460	32467	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009786	TGAT	2	8	34408	34415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009786	CTGA	2	8	35324	35331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009786	ACTG	2	8	35455	35462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009786	AATC	2	8	35537	35544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009786	AGCA	2	8	35775	35782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009786	GCCC	2	8	35880	35887	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009786	TGAA	2	8	35918	35925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009786	CTCC	2	8	38978	38985	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_009786	AGTA	2	8	39013	39020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009786	AGTC	2	8	40270	40277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009786	AACA	2	8	42778	42785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009786	GATG	2	8	43134	43141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009786	GCTT	2	8	43729	43736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009786	CAGG	2	8	44059	44066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009786	TGAA	2	8	44358	44365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009786	GTCT	2	8	44519	44526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009786	CGGT	2	8	44987	44994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009786	TGAT	2	8	45382	45389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009786	TCTG	2	8	45628	45635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009786	GAAC	2	8	46330	46337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009786	GCCA	2	8	46361	46368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009786	CGTC	2	8	46539	46546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009786	TCAA	2	8	46990	46997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009786	CTGG	2	8	47308	47315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009786	GTCA	2	8	47355	47362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009786	ATAA	2	8	48290	48297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009786	CTTA	2	8	48323	48330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009786	ACGC	2	8	48951	48958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009786	GGAT	2	8	50464	50471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009786	TATG	2	8	51562	51569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009786	GAGG	2	8	51650	51657	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009786	ATGG	2	8	52013	52020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009786	CTGG	2	8	54569	54576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009786	GTCC	2	8	54597	54604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009786	TGTT	2	8	56355	56362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009786	TCTT	2	8	56733	56740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009786	TGAT	2	8	57907	57914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009786	GGAC	2	8	58730	58737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009786	CCAG	2	8	58758	58765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009786	CTGA	2	8	59591	59598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009786	TTAT	2	8	59725	59732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009786	GCTG	2	8	59831	59838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009786	GGCT	2	8	60029	60036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009786	ATGA	2	8	60560	60567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009786	AAAG	2	8	63676	63683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009786	GATA	2	8	63802	63809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009786	AAAT	2	8	63855	63862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009786	AAAC	2	8	63932	63939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009786	TCAG	2	8	64444	64451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009786	GCAG	2	8	64699	64706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009786	GCCT	2	8	65090	65097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009786	GGCT	2	8	65188	65195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009786	TCTG	2	8	65799	65806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009786	GTTT	2	8	67705	67712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009786	GAAA	2	8	67812	67819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009786	ATAC	2	8	67842	67849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009786	TCAG	2	8	68316	68323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009786	GCCT	2	8	68962	68969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009786	GGCT	2	8	69060	69067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009786	GGTT	2	8	69834	69841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009786	ACTA	2	8	69951	69958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009786	CAGC	2	8	71940	71947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009786	CAGG	2	8	72038	72045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009786	CTGA	2	8	72685	72692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009786	GCAC	2	8	72811	72818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009786	CTTC	2	8	73251	73258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009786	GCGG	2	8	73672	73679	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009786	TTAA	2	8	75070	75077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009786	AGCG	2	8	77745	77752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009786	CACC	2	8	78505	78512	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.