MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	GCAG	2	8	1386	1393	25 %	0 %	50 %	25 %	157149386
2	NC_009786	GCTG	2	8	1664	1671	0 %	25 %	50 %	25 %	157149386
3	NC_009786	GATT	2	8	1971	1978	25 %	50 %	25 %	0 %	157149386
4	NC_009786	GACG	2	8	2277	2284	25 %	0 %	50 %	25 %	157149386
5	NC_009786	TGAG	2	8	2360	2367	25 %	25 %	50 %	0 %	157149386
6	NC_009786	CCGT	2	8	2392	2399	0 %	25 %	25 %	50 %	157149386
7	NC_009786	CTGT	2	8	2687	2694	0 %	50 %	25 %	25 %	157149386
8	NC_009786	CGGC	2	8	3436	3443	0 %	0 %	50 %	50 %	157149388
9	NC_009786	TTTA	2	8	3477	3484	25 %	75 %	0 %	0 %	157149388
10	NC_009786	GCAT	2	8	3595	3602	25 %	25 %	25 %	25 %	157149388
11	NC_009786	GCCA	2	8	4421	4428	25 %	0 %	25 %	50 %	157149373
12	NC_009786	GCCA	2	8	4916	4923	25 %	0 %	25 %	50 %	157149373
13	NC_009786	TTCT	2	8	4936	4943	0 %	75 %	0 %	25 %	157149373
14	NC_009786	ATCC	2	8	5212	5219	25 %	25 %	0 %	50 %	157149373
15	NC_009786	ACTG	2	8	5448	5455	25 %	25 %	25 %	25 %	157149373
16	NC_009786	CTTT	2	8	5739	5746	0 %	75 %	0 %	25 %	157149387
17	NC_009786	CCAG	2	8	5911	5918	25 %	0 %	25 %	50 %	157149387
18	NC_009786	CAAT	2	8	6529	6536	50 %	25 %	0 %	25 %	157149387
19	NC_009786	AACC	2	8	7455	7462	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
20	NC_009786	ATTA	2	8	7619	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	157149363
21	NC_009786	AATG	2	8	7874	7881	50 %	25 %	25 %	0 %	157149363
22	NC_009786	GTAT	2	8	8062	8069	25 %	50 %	25 %	0 %	157149363
23	NC_009786	TAAT	2	8	8078	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	157149363
24	NC_009786	TTCA	2	8	9766	9773	25 %	50 %	0 %	25 %	157149359
25	NC_009786	GCAA	2	8	9943	9950	50 %	0 %	25 %	25 %	157149359
26	NC_009786	GATT	2	8	10083	10090	25 %	50 %	25 %	0 %	157149357
27	NC_009786	TGTC	2	8	10182	10189	0 %	50 %	25 %	25 %	157149357
28	NC_009786	TTAT	2	8	12192	12199	25 %	75 %	0 %	0 %	157149340
29	NC_009786	CCAC	2	8	13464	13471	25 %	0 %	0 %	75 %	157149335
30	NC_009786	ATAC	2	8	13644	13651	50 %	25 %	0 %	25 %	157149335
31	NC_009786	GCCA	2	8	14182	14189	25 %	0 %	25 %	50 %	157149350
32	NC_009786	CAGC	2	8	15335	15342	25 %	0 %	25 %	50 %	157149350
33	NC_009786	CAGA	2	8	16044	16051	50 %	0 %	25 %	25 %	157149347
34	NC_009786	GCCC	2	8	16076	16083	0 %	0 %	25 %	75 %	157149347
35	NC_009786	GTAA	2	8	16101	16108	50 %	25 %	25 %	0 %	157149347
36	NC_009786	CCAC	2	8	16115	16122	25 %	0 %	0 %	75 %	157149347
37	NC_009786	TGAT	2	8	17102	17109	25 %	50 %	25 %	0 %	157149353
38	NC_009786	ATCA	2	8	17342	17349	50 %	25 %	0 %	25 %	157149353
39	NC_009786	TCAG	2	8	17379	17386	25 %	25 %	25 %	25 %	157149353
40	NC_009786	TCTG	2	8	18866	18873	0 %	50 %	25 %	25 %	157149384
41	NC_009786	CCTG	2	8	20900	20907	0 %	25 %	25 %	50 %	157149342
42	NC_009786	GAAC	2	8	21671	21678	50 %	0 %	25 %	25 %	157149342
43	NC_009786	ACGC	2	8	21968	21975	25 %	0 %	25 %	50 %	157149342
44	NC_009786	TCAG	2	8	22237	22244	25 %	25 %	25 %	25 %	157149342
45	NC_009786	CTGG	2	8	22546	22553	0 %	25 %	50 %	25 %	157149342
46	NC_009786	CAGA	2	8	23555	23562	50 %	0 %	25 %	25 %	157149352
47	NC_009786	CCGT	2	8	23775	23782	0 %	25 %	25 %	50 %	157149352
48	NC_009786	GTCT	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	157149356
49	NC_009786	AGTG	2	8	24124	24131	25 %	25 %	50 %	0 %	157149356
50	NC_009786	GTGG	2	8	26021	26028	0 %	25 %	75 %	0 %	157149337
51	NC_009786	GCCT	2	8	26170	26177	0 %	25 %	25 %	50 %	157149337
52	NC_009786	CAGC	2	8	26806	26813	25 %	0 %	25 %	50 %	157149366
53	NC_009786	TGAA	2	8	26853	26860	50 %	25 %	25 %	0 %	157149366
54	NC_009786	CAGC	2	8	27075	27082	25 %	0 %	25 %	50 %	157149366
55	NC_009786	ATGC	2	8	27201	27208	25 %	25 %	25 %	25 %	157149366
56	NC_009786	TGCC	2	8	27808	27815	0 %	25 %	25 %	50 %	229220657
57	NC_009786	TGGA	2	8	28173	28180	25 %	25 %	50 %	0 %	157149362
58	NC_009786	GGAA	2	8	28279	28286	50 %	0 %	50 %	0 %	157149362
59	NC_009786	TAAA	2	8	28287	28294	75 %	25 %	0 %	0 %	157149362
60	NC_009786	CAGA	2	8	28880	28887	50 %	0 %	25 %	25 %	157149379
61	NC_009786	TGTC	2	8	29525	29532	0 %	50 %	25 %	25 %	157149391
62	NC_009786	GCCA	2	8	29896	29903	25 %	0 %	25 %	50 %	157149391
63	NC_009786	AGGC	2	8	29953	29960	25 %	0 %	50 %	25 %	157149391
64	NC_009786	TACC	2	8	31256	31263	25 %	25 %	0 %	50 %	157149394
65	NC_009786	CCGA	2	8	31299	31306	25 %	0 %	25 %	50 %	157149394
66	NC_009786	ACAG	2	8	31396	31403	50 %	0 %	25 %	25 %	157149394
67	NC_009786	CAGA	2	8	31491	31498	50 %	0 %	25 %	25 %	157149394
68	NC_009786	GCAG	2	8	31542	31549	25 %	0 %	50 %	25 %	157149394
69	NC_009786	CGAA	2	8	33164	33171	50 %	0 %	25 %	25 %	157149336
70	NC_009786	AATC	2	8	33888	33895	50 %	25 %	0 %	25 %	157149370
71	NC_009786	GCTG	2	8	34820	34827	0 %	25 %	50 %	25 %	157149355
72	NC_009786	ACTG	2	8	36385	36392	25 %	25 %	25 %	25 %	157149376
73	NC_009786	CAAC	2	8	37490	37497	50 %	0 %	0 %	50 %	157149369
74	NC_009786	CATT	2	8	37510	37517	25 %	50 %	0 %	25 %	157149369
75	NC_009786	GCCA	2	8	37611	37618	25 %	0 %	25 %	50 %	157149369
76	NC_009786	TCCT	2	8	37712	37719	0 %	50 %	0 %	50 %	157149369
77	NC_009786	CATT	2	8	38304	38311	25 %	50 %	0 %	25 %	157149338
78	NC_009786	ATAA	2	8	38328	38335	75 %	25 %	0 %	0 %	157149338
79	NC_009786	TTTA	2	8	39233	39240	25 %	75 %	0 %	0 %	157149364
80	NC_009786	GCGG	2	8	39473	39480	0 %	0 %	75 %	25 %	157149364
81	NC_009786	CAGC	2	8	39723	39730	25 %	0 %	25 %	50 %	157149364
82	NC_009786	CATT	2	8	39857	39864	25 %	50 %	0 %	25 %	157149349
83	NC_009786	CATC	2	8	40031	40038	25 %	25 %	0 %	50 %	157149349
84	NC_009786	AGTG	2	8	41252	41259	25 %	25 %	50 %	0 %	157149395
85	NC_009786	GCCA	2	8	41450	41457	25 %	0 %	25 %	50 %	157149395
86	NC_009786	CAGC	2	8	41504	41511	25 %	0 %	25 %	50 %	157149395
87	NC_009786	CAGG	2	8	41566	41573	25 %	0 %	50 %	25 %	157149395
88	NC_009786	CTGA	2	8	42387	42394	25 %	25 %	25 %	25 %	157149346
89	NC_009786	ATCA	2	8	42681	42688	50 %	25 %	0 %	25 %	157149346
90	NC_009786	GGCA	2	8	47546	47553	25 %	0 %	50 %	25 %	157149348
91	NC_009786	ATCG	2	8	47642	47649	25 %	25 %	25 %	25 %	157149348
92	NC_009786	AGCC	2	8	47932	47939	25 %	0 %	25 %	50 %	157149348
93	NC_009786	CAAA	2	8	47994	48001	75 %	0 %	0 %	25 %	157149348
94	NC_009786	CGGA	2	8	54494	54501	25 %	0 %	50 %	25 %	157149380
95	NC_009786	GCTG	2	8	55988	55995	0 %	25 %	50 %	25 %	157149375
96	NC_009786	TGGC	2	8	56121	56128	0 %	25 %	50 %	25 %	157149375
97	NC_009786	TCCG	2	8	58833	58840	0 %	25 %	25 %	50 %	157149397
98	NC_009786	GAAA	2	8	60981	60988	75 %	0 %	25 %	0 %	157149332
99	NC_009786	AAAG	2	8	61029	61036	75 %	0 %	25 %	0 %	157149332
100	NC_009786	GATA	2	8	61194	61201	50 %	25 %	25 %	0 %	157149332
101	NC_009786	TCTG	2	8	61630	61637	0 %	50 %	25 %	25 %	157149332
102	NC_009786	AAAG	2	8	61717	61724	75 %	0 %	25 %	0 %	157149332
103	NC_009786	TATC	2	8	61983	61990	25 %	50 %	0 %	25 %	157149392
104	NC_009786	ATTA	2	8	62085	62092	50 %	50 %	0 %	0 %	157149392
105	NC_009786	AGAA	2	8	62419	62426	75 %	0 %	25 %	0 %	157149392
106	NC_009786	TAAA	2	8	62713	62720	75 %	25 %	0 %	0 %	157149392
107	NC_009786	AGAA	2	8	62864	62871	75 %	0 %	25 %	0 %	157149392
108	NC_009786	CATT	2	8	62959	62966	25 %	50 %	0 %	25 %	157149396
109	NC_009786	ATAA	2	8	63136	63143	75 %	25 %	0 %	0 %	157149396
110	NC_009786	TGTC	2	8	63348	63355	0 %	50 %	25 %	25 %	157149396
111	NC_009786	AGAT	2	8	63423	63430	50 %	25 %	25 %	0 %	157149396
112	NC_009786	CAGC	2	8	66254	66261	25 %	0 %	25 %	50 %	157149339
113	NC_009786	GCAA	2	8	66278	66285	50 %	0 %	25 %	25 %	157149339
114	NC_009786	GAAA	2	8	66818	66825	75 %	0 %	25 %	0 %	157149341
115	NC_009786	TCGC	2	8	67292	67299	0 %	25 %	25 %	50 %	157149341
116	NC_009786	TCAG	2	8	68090	68097	25 %	25 %	25 %	25 %	157149345
117	NC_009786	ATCT	2	8	70051	70058	25 %	50 %	0 %	25 %	157149372
118	NC_009786	TTGA	2	8	70206	70213	25 %	50 %	25 %	0 %	157149372
119	NC_009786	TATT	2	8	70284	70291	25 %	75 %	0 %	0 %	157149372
120	NC_009786	TTAT	2	8	70457	70464	25 %	75 %	0 %	0 %	157149372
121	NC_009786	AAAT	2	8	70791	70798	75 %	25 %	0 %	0 %	157149372
122	NC_009786	AAAT	2	8	70882	70889	75 %	25 %	0 %	0 %	157149372
123	NC_009786	GAAT	2	8	70970	70977	50 %	25 %	25 %	0 %	157149372
124	NC_009786	CAAA	2	8	71103	71110	75 %	0 %	0 %	25 %	157149372
125	NC_009786	GAAA	2	8	74393	74400	75 %	0 %	25 %	0 %	157149382
126	NC_009786	TCGC	2	8	74867	74874	0 %	25 %	25 %	50 %	157149382
127	NC_009786	CTGC	2	8	75255	75262	0 %	25 %	25 %	50 %	157149351
128	NC_009786	CGGA	2	8	75927	75934	25 %	0 %	50 %	25 %	157149351
129	NC_009786	TCGG	2	8	76219	76226	0 %	25 %	50 %	25 %	157149351
130	NC_009786	TCCT	2	8	76231	76238	0 %	50 %	0 %	50 %	157149351
131	NC_009786	GAGC	2	8	76358	76365	25 %	0 %	50 %	25 %	157149351
132	NC_009786	GCCG	2	8	76671	76678	0 %	0 %	50 %	50 %	157149351
133	NC_009786	TCGG	2	8	76708	76715	0 %	25 %	50 %	25 %	157149351

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.