MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	GT	4	8	1140	1147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009786	CG	3	6	2128	2133	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
3	NC_009786	GC	3	6	2226	2231	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
4	NC_009786	GC	3	6	3226	3231	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
5	NC_009786	AC	3	6	3526	3531	50 %	0 %	0 %	50 %	157149388
6	NC_009786	AG	3	6	3799	3804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009786	CA	3	6	4831	4836	50 %	0 %	0 %	50 %	157149373
8	NC_009786	GT	3	6	5389	5394	0 %	50 %	50 %	0 %	157149373
9	NC_009786	TC	3	6	5661	5666	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
10	NC_009786	TC	3	6	6248	6253	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
11	NC_009786	CT	3	6	6464	6469	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
12	NC_009786	AC	4	8	7086	7093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009786	AC	3	6	7264	7269	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
14	NC_009786	TC	3	6	7717	7722	0 %	50 %	0 %	50 %	157149363
15	NC_009786	CA	4	8	7998	8005	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
16	NC_009786	AT	3	6	8307	8312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009786	TA	4	8	9088	9095	50 %	50 %	0 %	0 %	157149383
18	NC_009786	AT	3	6	9470	9475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009786	AT	3	6	11171	11176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009786	TA	3	6	12401	12406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009786	TA	3	6	13286	13291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009786	TG	3	6	13628	13633	0 %	50 %	50 %	0 %	157149335
23	NC_009786	TG	3	6	16323	16328	0 %	50 %	50 %	0 %	157149360
24	NC_009786	AT	3	6	16630	16635	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
25	NC_009786	TA	4	8	16951	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
26	NC_009786	AT	3	6	17071	17076	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
27	NC_009786	GA	3	6	17223	17228	50 %	0 %	50 %	0 %	157149353
28	NC_009786	AT	3	6	17326	17331	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
29	NC_009786	AT	3	6	17395	17400	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
30	NC_009786	CT	3	6	17465	17470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009786	AC	3	6	17524	17529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009786	AT	3	6	17532	17537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009786	TA	3	6	17829	17834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009786	CA	3	6	17954	17959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009786	TG	3	6	18567	18572	0 %	50 %	50 %	0 %	157149384
36	NC_009786	AG	3	6	19479	19484	50 %	0 %	50 %	0 %	157149334
37	NC_009786	AG	3	6	20600	20605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009786	CG	3	6	21278	21283	0 %	0 %	50 %	50 %	157149342
39	NC_009786	GT	4	8	21834	21841	0 %	50 %	50 %	0 %	157149342
40	NC_009786	AC	3	6	22776	22781	50 %	0 %	0 %	50 %	157149354
41	NC_009786	TC	3	6	22927	22932	0 %	50 %	0 %	50 %	157149354
42	NC_009786	TG	3	6	24218	24223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009786	CA	3	6	25095	25100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009786	GA	3	6	26847	26852	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
45	NC_009786	GA	3	6	26864	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
46	NC_009786	AG	3	6	27067	27072	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
47	NC_009786	GA	3	6	27438	27443	50 %	0 %	50 %	0 %	229220657
48	NC_009786	AC	3	6	27660	27665	50 %	0 %	0 %	50 %	229220657
49	NC_009786	TG	3	6	27789	27794	0 %	50 %	50 %	0 %	229220657
50	NC_009786	AG	3	6	27964	27969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009786	AT	3	6	28694	28699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009786	AT	3	6	28774	28779	50 %	50 %	0 %	0 %	157149379
53	NC_009786	AG	3	6	29671	29676	50 %	0 %	50 %	0 %	157149391
54	NC_009786	GC	3	6	31368	31373	0 %	0 %	50 %	50 %	157149394
55	NC_009786	AT	3	6	31987	31992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009786	CA	3	6	32139	32144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009786	GA	3	6	33128	33133	50 %	0 %	50 %	0 %	157149336
58	NC_009786	TC	4	8	33386	33393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009786	TC	3	6	36675	36680	0 %	50 %	0 %	50 %	157149376
60	NC_009786	AT	3	6	36782	36787	50 %	50 %	0 %	0 %	157149376
61	NC_009786	GC	3	6	36803	36808	0 %	0 %	50 %	50 %	157149376
62	NC_009786	TC	3	6	38438	38443	0 %	50 %	0 %	50 %	157149338
63	NC_009786	TA	3	6	39057	39062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009786	AT	3	6	39098	39103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009786	GC	3	6	39623	39628	0 %	0 %	50 %	50 %	157149364
66	NC_009786	AG	3	6	40533	40538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009786	TG	3	6	40541	40546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009786	AG	4	8	40806	40813	50 %	0 %	50 %	0 %	157149344
69	NC_009786	GC	3	6	41325	41330	0 %	0 %	50 %	50 %	157149395
70	NC_009786	AT	3	6	41930	41935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009786	AT	3	6	43051	43056	50 %	50 %	0 %	0 %	157149361
72	NC_009786	AG	3	6	43070	43075	50 %	0 %	50 %	0 %	157149361
73	NC_009786	AC	3	6	43930	43935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009786	AT	3	6	44996	45001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009786	TA	3	6	45962	45967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009786	AG	3	6	46249	46254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009786	TG	3	6	46761	46766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009786	TG	3	6	47206	47211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009786	AG	3	6	47924	47929	50 %	0 %	50 %	0 %	157149348
80	NC_009786	GA	3	6	48099	48104	50 %	0 %	50 %	0 %	157149348
81	NC_009786	TG	3	6	48401	48406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009786	TG	3	6	49396	49401	0 %	50 %	50 %	0 %	157149381
83	NC_009786	AT	4	8	49864	49871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009786	AT	3	6	49993	49998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009786	GA	3	6	50814	50819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009786	GA	3	6	51620	51625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009786	AT	3	6	51828	51833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009786	TA	3	6	52175	52180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009786	AC	3	6	52317	52322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009786	GA	3	6	52700	52705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009786	CA	3	6	52742	52747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009786	TA	3	6	53342	53347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009786	CA	3	6	54696	54701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009786	CA	3	6	54960	54965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009786	AT	3	6	55528	55533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009786	AT	4	8	56914	56921	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
97	NC_009786	AT	3	6	56983	56988	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
98	NC_009786	AT	3	6	57087	57092	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
99	NC_009786	AT	3	6	57228	57233	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
100	NC_009786	TA	3	6	57279	57284	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
101	NC_009786	AC	3	6	57719	57724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009786	TG	3	6	58369	58374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009786	CA	3	6	59477	59482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009786	CA	3	6	59628	59633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009786	AT	3	6	60797	60802	50 %	50 %	0 %	0 %	157149332
106	NC_009786	AG	3	6	60811	60816	50 %	0 %	50 %	0 %	157149332
107	NC_009786	GA	3	6	60890	60895	50 %	0 %	50 %	0 %	157149332
108	NC_009786	AT	3	6	61660	61665	50 %	50 %	0 %	0 %	157149332
109	NC_009786	AT	4	8	61807	61814	50 %	50 %	0 %	0 %	157149392
110	NC_009786	AG	3	6	62148	62153	50 %	0 %	50 %	0 %	157149392
111	NC_009786	TC	4	8	62490	62497	0 %	50 %	0 %	50 %	157149392
112	NC_009786	AT	3	6	62901	62906	50 %	50 %	0 %	0 %	157149392
113	NC_009786	GA	3	6	63252	63257	50 %	0 %	50 %	0 %	157149396
114	NC_009786	AT	3	6	63330	63335	50 %	50 %	0 %	0 %	157149396
115	NC_009786	AT	3	6	63826	63831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009786	TA	3	6	64325	64330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009786	CT	3	6	65849	65854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009786	AG	3	6	67157	67162	50 %	0 %	50 %	0 %	157149341
119	NC_009786	AC	3	6	68152	68157	50 %	0 %	0 %	50 %	157149345
120	NC_009786	AT	4	8	69962	69969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009786	TA	3	6	69989	69994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009786	TA	3	6	70105	70110	50 %	50 %	0 %	0 %	157149372
123	NC_009786	AT	3	6	70271	70276	50 %	50 %	0 %	0 %	157149372
124	NC_009786	AT	3	6	71131	71136	50 %	50 %	0 %	0 %	157149372
125	NC_009786	AC	3	6	71331	71336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009786	GC	3	6	71352	71357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009786	TG	3	6	73448	73453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009786	TG	3	6	73746	73751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009786	AG	3	6	74732	74737	50 %	0 %	50 %	0 %	157149382
130	NC_009786	CT	3	6	75187	75192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009786	CG	3	6	75195	75200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009786	CT	3	6	75517	75522	0 %	50 %	0 %	50 %	157149351
133	NC_009786	CG	3	6	76873	76878	0 %	0 %	50 %	50 %	157149351
134	NC_009786	GA	3	6	77032	77037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009786	TA	4	8	77051	77058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009786	GC	3	6	77177	77182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009786	CA	3	6	78591	78596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009786	AT	3	6	78859	78864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.