MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	CG	3	6	2128	2133	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
2	NC_009786	GC	3	6	2226	2231	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
3	NC_009786	GC	3	6	3226	3231	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
4	NC_009786	AC	3	6	3526	3531	50 %	0 %	0 %	50 %	157149388
5	NC_009786	CA	3	6	4831	4836	50 %	0 %	0 %	50 %	157149373
6	NC_009786	GT	3	6	5389	5394	0 %	50 %	50 %	0 %	157149373
7	NC_009786	TC	3	6	5661	5666	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
8	NC_009786	TC	3	6	6248	6253	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
9	NC_009786	CT	3	6	6464	6469	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
10	NC_009786	AC	3	6	7264	7269	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
11	NC_009786	TC	3	6	7717	7722	0 %	50 %	0 %	50 %	157149363
12	NC_009786	CA	4	8	7998	8005	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
13	NC_009786	TA	4	8	9088	9095	50 %	50 %	0 %	0 %	157149383
14	NC_009786	TG	3	6	13628	13633	0 %	50 %	50 %	0 %	157149335
15	NC_009786	TG	3	6	16323	16328	0 %	50 %	50 %	0 %	157149360
16	NC_009786	AT	3	6	16630	16635	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
17	NC_009786	TA	4	8	16951	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
18	NC_009786	AT	3	6	17071	17076	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
19	NC_009786	GA	3	6	17223	17228	50 %	0 %	50 %	0 %	157149353
20	NC_009786	AT	3	6	17326	17331	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
21	NC_009786	AT	3	6	17395	17400	50 %	50 %	0 %	0 %	157149353
22	NC_009786	TG	3	6	18567	18572	0 %	50 %	50 %	0 %	157149384
23	NC_009786	AG	3	6	19479	19484	50 %	0 %	50 %	0 %	157149334
24	NC_009786	CG	3	6	21278	21283	0 %	0 %	50 %	50 %	157149342
25	NC_009786	GT	4	8	21834	21841	0 %	50 %	50 %	0 %	157149342
26	NC_009786	AC	3	6	22776	22781	50 %	0 %	0 %	50 %	157149354
27	NC_009786	TC	3	6	22927	22932	0 %	50 %	0 %	50 %	157149354
28	NC_009786	GA	3	6	26847	26852	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
29	NC_009786	GA	3	6	26864	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
30	NC_009786	AG	3	6	27067	27072	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
31	NC_009786	GA	3	6	27438	27443	50 %	0 %	50 %	0 %	229220657
32	NC_009786	AC	3	6	27660	27665	50 %	0 %	0 %	50 %	229220657
33	NC_009786	TG	3	6	27789	27794	0 %	50 %	50 %	0 %	229220657
34	NC_009786	AT	3	6	28774	28779	50 %	50 %	0 %	0 %	157149379
35	NC_009786	AG	3	6	29671	29676	50 %	0 %	50 %	0 %	157149391
36	NC_009786	GC	3	6	31368	31373	0 %	0 %	50 %	50 %	157149394
37	NC_009786	GA	3	6	33128	33133	50 %	0 %	50 %	0 %	157149336
38	NC_009786	TC	3	6	36675	36680	0 %	50 %	0 %	50 %	157149376
39	NC_009786	AT	3	6	36782	36787	50 %	50 %	0 %	0 %	157149376
40	NC_009786	GC	3	6	36803	36808	0 %	0 %	50 %	50 %	157149376
41	NC_009786	TC	3	6	38438	38443	0 %	50 %	0 %	50 %	157149338
42	NC_009786	GC	3	6	39623	39628	0 %	0 %	50 %	50 %	157149364
43	NC_009786	AG	4	8	40806	40813	50 %	0 %	50 %	0 %	157149344
44	NC_009786	GC	3	6	41325	41330	0 %	0 %	50 %	50 %	157149395
45	NC_009786	AT	3	6	43051	43056	50 %	50 %	0 %	0 %	157149361
46	NC_009786	AG	3	6	43070	43075	50 %	0 %	50 %	0 %	157149361
47	NC_009786	AG	3	6	47924	47929	50 %	0 %	50 %	0 %	157149348
48	NC_009786	GA	3	6	48099	48104	50 %	0 %	50 %	0 %	157149348
49	NC_009786	TG	3	6	49396	49401	0 %	50 %	50 %	0 %	157149381
50	NC_009786	AT	4	8	56914	56921	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
51	NC_009786	AT	3	6	56983	56988	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
52	NC_009786	AT	3	6	57087	57092	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
53	NC_009786	AT	3	6	57228	57233	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
54	NC_009786	TA	3	6	57279	57284	50 %	50 %	0 %	0 %	157149368
55	NC_009786	AT	3	6	60797	60802	50 %	50 %	0 %	0 %	157149332
56	NC_009786	AG	3	6	60811	60816	50 %	0 %	50 %	0 %	157149332
57	NC_009786	GA	3	6	60890	60895	50 %	0 %	50 %	0 %	157149332
58	NC_009786	AT	3	6	61660	61665	50 %	50 %	0 %	0 %	157149332
59	NC_009786	AT	4	8	61807	61814	50 %	50 %	0 %	0 %	157149392
60	NC_009786	AG	3	6	62148	62153	50 %	0 %	50 %	0 %	157149392
61	NC_009786	TC	4	8	62490	62497	0 %	50 %	0 %	50 %	157149392
62	NC_009786	AT	3	6	62901	62906	50 %	50 %	0 %	0 %	157149392
63	NC_009786	GA	3	6	63252	63257	50 %	0 %	50 %	0 %	157149396
64	NC_009786	AT	3	6	63330	63335	50 %	50 %	0 %	0 %	157149396
65	NC_009786	AG	3	6	67157	67162	50 %	0 %	50 %	0 %	157149341
66	NC_009786	AC	3	6	68152	68157	50 %	0 %	0 %	50 %	157149345
67	NC_009786	TA	3	6	70105	70110	50 %	50 %	0 %	0 %	157149372
68	NC_009786	AT	3	6	70271	70276	50 %	50 %	0 %	0 %	157149372
69	NC_009786	AT	3	6	71131	71136	50 %	50 %	0 %	0 %	157149372
70	NC_009786	AG	3	6	74732	74737	50 %	0 %	50 %	0 %	157149382
71	NC_009786	CT	3	6	75517	75522	0 %	50 %	0 %	50 %	157149351
72	NC_009786	CG	3	6	76873	76878	0 %	0 %	50 %	50 %	157149351

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.