MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	AAAGAT	2	12	30930	30941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009785	TAGCTA	2	12	74364	74375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009785	TTTATA	2	12	79602	79613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009785	TGTAAA	2	12	123477	123488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009785	AAAAAG	2	12	124678	124689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009785	GCCCTA	2	12	127290	127301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009785	CAAAGA	2	12	157470	157481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009785	TGAGAC	2	12	190997	191008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009785	TGTCTC	2	12	191014	191025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009785	AATGCT	2	12	283132	283143	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009785	AAATGT	2	12	308598	308609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009785	GAAGGA	2	12	319056	319067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009785	AGTTAA	2	12	332957	332968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009785	AAATGA	2	12	338027	338038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009785	ATATTA	2	12	338236	338247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009785	TCTTTT	2	12	375757	375768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009785	GAAAAC	2	12	390302	390313	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009785	TTTTGT	2	12	417420	417431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009785	CATTTT	2	12	470297	470308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009785	TTATAT	2	12	473453	473464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009785	TTTAAG	2	12	497455	497466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009785	TAAGAA	2	12	522707	522718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009785	ATAAAA	2	12	566446	566457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009785	AAATAA	2	12	591361	591372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009785	TAGAAT	2	12	616059	616070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009785	AATAGA	2	12	652292	652303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009785	ACTAAT	2	12	665825	665836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009785	AAAATT	2	12	700507	700518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009785	TTGCAT	2	12	727325	727336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009785	AAAGGA	2	12	736058	736069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009785	AAAATA	2	12	754099	754110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009785	AGGTTA	2	12	866292	866303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009785	CTTGAA	2	12	917024	917035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009785	GTTACT	2	12	925827	925838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009785	CCTGTC	2	12	926615	926626	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009785	TCTGGC	2	12	926930	926941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009785	CCTGCC	2	12	928068	928079	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009785	TTTTTC	2	12	963821	963832	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009785	TAAAAA	2	12	964559	964570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009785	GTCAGC	2	12	1019551	1019562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009785	CTTTTT	2	12	1038238	1038249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009785	TTTTTC	2	12	1092164	1092175	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009785	AATAAG	2	12	1093849	1093860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009785	ATTTGC	2	12	1151269	1151280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009785	CATAAT	2	12	1166538	1166549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009785	TGAATT	2	12	1166599	1166610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009785	TCAGAT	2	12	1168901	1168912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009785	AAAAAG	2	12	1212193	1212204	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009785	CAAAAA	2	12	1237760	1237771	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009785	CCCGAA	2	12	1281880	1281891	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009785	CTTTTT	2	12	1295264	1295275	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009785	TTTAAA	2	12	1307184	1307195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009785	CCATTC	2	12	1314652	1314663	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009785	GATTTT	2	12	1330551	1330562	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009785	AGAAAA	2	12	1340441	1340452	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009785	ATTCTA	2	12	1395806	1395817	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009785	TTGATT	2	12	1396430	1396441	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009785	GGTGAA	2	12	1424105	1424116	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009785	CTTAAA	2	12	1467569	1467580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009785	ATAAAA	2	12	1480632	1480643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009785	AAATAA	2	12	1485080	1485091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009785	TGAAAT	2	12	1497017	1497028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009785	ATTTTT	2	12	1515675	1515686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009785	CTCTTT	2	12	1517562	1517573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009785	ATTTCA	2	12	1526368	1526379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009785	ATTTCA	2	12	1528177	1528188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009785	AAACAA	2	12	1549712	1549723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009785	TGCTAG	2	12	1586367	1586378	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009785	ACATAA	2	12	1586423	1586434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009785	ATCAGT	2	12	1611312	1611323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009785	CATCCA	2	12	1617871	1617882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009785	GATTCA	2	12	1674356	1674367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009785	TTCCTT	2	12	1689363	1689374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009785	AAAGAT	2	12	1703002	1703013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009785	TTTCAT	2	12	1711704	1711715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009785	TTTTAT	2	12	1744406	1744417	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009785	TAAAAA	2	12	1749442	1749453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009785	TATTAG	2	12	1765429	1765440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009785	ATTTCA	2	12	1777581	1777592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009785	CATTAG	2	12	1808462	1808473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009785	GAAAAA	2	12	1814901	1814912	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009785	TTTATT	2	12	1833410	1833421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009785	AATTAA	2	12	1868735	1868746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009785	GGAAAA	2	12	1889339	1889350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009785	ATAGAA	2	12	1906192	1906203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009785	AATATT	2	12	1916333	1916344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009785	AAAAGA	2	12	1952781	1952792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009785	CAAAAA	2	12	1964962	1964973	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009785	AAAGTA	2	12	1965161	1965172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009785	ACTAAA	2	12	2015799	2015810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009785	CCCGAA	2	12	2016402	2016413	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009785	TATTAG	2	12	2017439	2017450	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009785	TTTCAA	2	12	2031058	2031069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009785	TAAAAA	2	12	2049303	2049314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009785	GTTTTG	2	12	2070974	2070985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009785	TTATTT	2	12	2121998	2122009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009785	AAAATT	2	12	2132894	2132905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009785	ACAGTT	2	12	2145265	2145276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009785	CTTTTT	2	12	2168008	2168019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009785	TAAAAA	2	12	2169298	2169309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009785	TATTAG	2	12	2173880	2173891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.