MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	AGCAAA	2	12	1972	1983	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157151517
2	NC_009785	AGATTA	2	12	4540	4551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150786
3	NC_009785	AAAAAC	2	12	4977	4988	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157150786
4	NC_009785	CTTTTA	2	12	6233	6244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157150583
5	NC_009785	TCATGG	2	12	6352	6363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150583
6	NC_009785	TTTTGA	2	12	6999	7010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157150583
7	NC_009785	GGAAAC	2	12	15598	15609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157150301
8	NC_009785	ATTAAA	2	12	26989	27000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150426
9	NC_009785	ATGGAG	2	12	27527	27538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157150426
10	NC_009785	CACGTA	2	12	27683	27694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150426
11	NC_009785	TGTTAT	2	12	42016	42027	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157150257
12	NC_009785	ATATCG	2	12	42969	42980	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157151031
13	NC_009785	ATATGA	2	12	44695	44706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150570
14	NC_009785	GTCTAG	2	12	54854	54865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150658
15	NC_009785	ATTGCA	2	12	55027	55038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157150658
16	NC_009785	AGCTGT	2	12	55629	55640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150658
17	NC_009785	TAATGA	2	12	65101	65112	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150151
18	NC_009785	TCAAGC	2	12	65261	65272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150151
19	NC_009785	ACAGCT	2	12	66587	66598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150026
20	NC_009785	CAGGGA	2	12	68386	68397	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157150026
21	NC_009785	TAAAGT	2	12	69548	69559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150026
22	NC_009785	AACAAA	2	12	73104	73115	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157150370
23	NC_009785	TATGCA	2	12	73339	73350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157150168
24	NC_009785	ATTTGG	2	12	74629	74640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157151082
25	NC_009785	TTATCG	2	12	75009	75020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157151699
26	NC_009785	ACTGAT	2	12	78626	78637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157150326
27	NC_009785	TCCCAG	2	12	85849	85860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157150416
28	NC_009785	GCTTGA	2	12	87281	87292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150040
29	NC_009785	TCTTGC	2	12	93332	93343	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157151578
30	NC_009785	ATGGTA	2	12	96554	96565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150919
31	NC_009785	GGCTTG	2	12	96868	96879	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157150919
32	NC_009785	CAAGAC	2	12	99551	99562	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	157151248
33	NC_009785	AATCAT	2	12	102938	102949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157150471
34	NC_009785	CGATAA	2	12	104627	104638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157151677
35	NC_009785	TTGAAG	2	12	104797	104808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151677
36	NC_009785	ACATCT	2	12	111064	111075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149840
37	NC_009785	TCAAAG	2	12	111289	111300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157149840
38	NC_009785	AAATGG	2	12	112537	112548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157151122
39	NC_009785	TGAATT	2	12	114121	114132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157151122
40	NC_009785	AAAACC	2	12	114775	114786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157151122
41	NC_009785	GACTTT	2	12	117521	117532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157151514
42	NC_009785	CCTTTG	2	12	118724	118735	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157151084
43	NC_009785	AATTGG	2	12	119333	119344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151084
44	NC_009785	TTATGT	2	12	119358	119369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157151084
45	NC_009785	AGCGTA	2	12	125704	125715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157149778
46	NC_009785	CAAAAA	2	12	126118	126129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157150379
47	NC_009785	AGATAA	2	12	126824	126835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157150379
48	NC_009785	CAGTAG	2	12	127237	127248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150379
49	NC_009785	CTTAAT	2	12	128855	128866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157151332
50	NC_009785	GGCAGC	2	12	136142	136153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157151571
51	NC_009785	GCCAGG	2	12	141200	141211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149878
52	NC_009785	TACGCT	2	12	145532	145543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157151228
53	NC_009785	GCAACA	2	12	147213	147224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	157150772
54	NC_009785	TGGATG	2	12	148167	148178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157150620
55	NC_009785	TTAAAA	2	12	151030	151041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151074
56	NC_009785	ACATTT	2	12	151068	151079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157151074
57	NC_009785	GACAAG	2	12	153418	153429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157149813
58	NC_009785	AGAGCA	2	12	154017	154028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157149813
59	NC_009785	GCCAGA	2	12	158667	158678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150962
60	NC_009785	GTGGAG	2	12	162303	162314	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	157150388
61	NC_009785	ATCGGT	2	12	163241	163252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157149825
62	NC_009785	GAAGAT	2	12	165136	165147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157150983
63	NC_009785	ATGAAT	2	12	165466	165477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157151570
64	NC_009785	CTCTTT	2	12	168888	168899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151315
65	NC_009785	AAGGGG	2	12	169077	169088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157151315
66	NC_009785	GCGGTA	2	12	182576	182587	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157150256
67	NC_009785	TAGCTC	2	12	183205	183216	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157151611
68	NC_009785	GGAATT	2	12	189321	189332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149832
69	NC_009785	AGAAAA	2	12	189958	189969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	157149832
70	NC_009785	TCAATG	2	12	190726	190737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157150965
71	NC_009785	TTGATA	2	12	190933	190944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157150965
72	NC_009785	ACAAAA	2	12	199368	199379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157150398
73	NC_009785	TTCTTG	2	12	201137	201148	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157151409
74	NC_009785	AAGATA	2	12	201162	201173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157151409
75	NC_009785	AGGCCG	2	12	202924	202935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149972
76	NC_009785	TACCCA	2	12	203098	203109	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	157149972
77	NC_009785	GCTAAG	2	12	208006	208017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150411
78	NC_009785	ACAACT	2	12	209838	209849	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157151182
79	NC_009785	GCAAGA	2	12	209930	209941	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157151182
80	NC_009785	ATCACA	2	12	209949	209960	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157151182
81	NC_009785	AAACAG	2	12	210112	210123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157151182
82	NC_009785	TTGACG	2	12	212981	212992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157151535
83	NC_009785	AATAAA	2	12	217221	217232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157150004
84	NC_009785	CATATT	2	12	226546	226557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157150597
85	NC_009785	TTACAC	2	12	226682	226693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150597
86	NC_009785	CTACTT	2	12	229905	229916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157151503
87	NC_009785	CAACTT	2	12	234326	234337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151428
88	NC_009785	CCATTC	2	12	239466	239477	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	157150006
89	NC_009785	TATCTA	2	12	246245	246256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157151393
90	NC_009785	AAATGG	2	12	247850	247861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157150925
91	NC_009785	GAGCTT	2	12	249987	249998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157151296
92	NC_009785	ATTTTT	2	12	253400	253411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157150369
93	NC_009785	CTGGAT	2	12	256615	256626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150364
94	NC_009785	TCCAGC	2	12	257319	257330	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157150129
95	NC_009785	ATGGGC	2	12	260304	260315	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157150593
96	NC_009785	GCTCCC	2	12	261965	261976	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	157150507
97	NC_009785	CTGCAG	2	12	262257	262268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157150507
98	NC_009785	ATTCAA	2	12	264868	264879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157150336
99	NC_009785	ATAAAG	2	12	267604	267615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157149712
100	NC_009785	GATTTG	2	12	270957	270968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157150613
101	NC_009785	ATCGGA	2	12	277275	277286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150407
102	NC_009785	TGGATG	2	12	281432	281443	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157150444
103	NC_009785	GTTTGC	2	12	281869	281880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	157151113
104	NC_009785	TTTAGT	2	12	283224	283235	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157149829
105	NC_009785	GCCATG	2	12	284651	284662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157151224
106	NC_009785	GTAAAA	2	12	291366	291377	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157150709
107	NC_009785	GCTCAG	2	12	294017	294028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157151271
108	NC_009785	TCGACA	2	12	294436	294447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157149990
109	NC_009785	TTTTGA	2	12	294459	294470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157149990
110	NC_009785	TCAATG	2	12	295986	295997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157151606
111	NC_009785	GGATTT	2	12	305612	305623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157150630
112	NC_009785	GAAGTC	2	12	309202	309213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150000
113	NC_009785	GGTTCA	2	12	312666	312677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150311
114	NC_009785	ATGGCA	2	12	322038	322049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150404
115	NC_009785	TCAAAG	2	12	322737	322748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157150482
116	NC_009785	CACAAC	2	12	335369	335380	50 %	0 %	0 %	50 %	157150221
117	NC_009785	TGGATG	2	12	335868	335879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157149798
118	NC_009785	CAAGGA	2	12	340597	340608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157151510
119	NC_009785	GATTAA	2	12	340921	340932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157151510
120	NC_009785	AAGGTC	2	12	341594	341605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157151510
121	NC_009785	CATCTG	2	12	349565	349576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157149757
122	NC_009785	GATTAC	2	12	349734	349745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157149757
123	NC_009785	TTTTGG	2	12	351334	351345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149933
124	NC_009785	TTGATT	2	12	351672	351683	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157149933
125	NC_009785	GCTGAA	2	12	354564	354575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150323
126	NC_009785	TTCTTA	2	12	359483	359494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157150091
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128	NC_009785	CAGAAG	2	12	364356	364367	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157150509
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130	NC_009785	TTAGTT	2	12	368363	368374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157149859
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138	NC_009785	TCAACG	2	12	383788	383799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150645
139	NC_009785	TTGGTT	2	12	385444	385455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151008
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141	NC_009785	AGCCAG	2	12	387574	387585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149837
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144	NC_009785	TATGAT	2	12	398791	398802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157151369
145	NC_009785	AAGTCC	2	12	403500	403511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157151313
146	NC_009785	TCTATG	2	12	417217	417228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157150733
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149	NC_009785	GATTTC	2	12	422514	422525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157150576
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222	NC_009785	AAGTTC	2	12	652034	652045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157150793
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227	NC_009785	TGCAAG	2	12	656303	656314	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157150717
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229	NC_009785	ATGACA	2	12	657212	657223	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157150624
230	NC_009785	CTTTGC	2	12	670719	670730	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157149945
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339	NC_009785	TTGGTT	2	12	975391	975402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150816
340	NC_009785	TATGGA	2	12	978054	978065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151134
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342	NC_009785	CAGATA	2	12	982015	982026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157149710
343	NC_009785	GTCAAA	2	12	985134	985145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157149710
344	NC_009785	ATGGCA	2	12	987400	987411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157149710
345	NC_009785	ATCTGG	2	12	989633	989644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157150041
346	NC_009785	TTCATT	2	12	990658	990669	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157150781
347	NC_009785	ATTGAA	2	12	999166	999177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150693
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349	NC_009785	AAGAGT	2	12	1001129	1001140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157150234
350	NC_009785	CCTGAT	2	12	1002232	1002243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157150895
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354	NC_009785	TTTTCT	2	12	1008924	1008935	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157149845
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356	NC_009785	TATATC	2	12	1012146	1012157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157150914
357	NC_009785	ATCAGC	2	12	1012173	1012184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150914
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361	NC_009785	ATCGTT	2	12	1022871	1022882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157150413
362	NC_009785	AGTGGA	2	12	1022926	1022937	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157150584
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445	NC_009785	GCTTCT	2	12	1283671	1283682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157150712
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453	NC_009785	ACCAAA	2	12	1302782	1302793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150915
454	NC_009785	ATCCAG	2	12	1305118	1305129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157149754
455	NC_009785	TGACCG	2	12	1310236	1310247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157151496
456	NC_009785	TTTACG	2	12	1320659	1320670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157149903
457	NC_009785	CAGCCA	2	12	1328344	1328355	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157150908
458	NC_009785	GTTATT	2	12	1332362	1332373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157150125
459	NC_009785	AATTGA	2	12	1332929	1332940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150125
460	NC_009785	ACGCTG	2	12	1335663	1335674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157151494
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462	NC_009785	CGATAC	2	12	1338623	1338634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157151520
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482	NC_009785	AAGTAT	2	12	1391977	1391988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150530
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