MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 1731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	GAAAA	2	10	469	478	80 %	0 %	20 %	0 %	157149691
2	NC_009785	TAAAA	2	10	1506	1515	80 %	20 %	0 %	0 %	157149691
3	NC_009785	TGAAA	2	10	2833	2842	60 %	20 %	20 %	0 %	157151188
4	NC_009785	GAAAT	2	10	3342	3351	60 %	20 %	20 %	0 %	157150252
5	NC_009785	TTGAT	2	10	3413	3422	20 %	60 %	20 %	0 %	157150252
6	NC_009785	GTTTC	2	10	4075	4084	0 %	60 %	20 %	20 %	157150786
7	NC_009785	TTTTG	2	10	4406	4415	0 %	80 %	20 %	0 %	157150786
8	NC_009785	AATTT	2	10	5038	5047	40 %	60 %	0 %	0 %	157150786
9	NC_009785	AAAAC	2	10	8902	8911	80 %	0 %	0 %	20 %	157150103
10	NC_009785	AATAA	2	10	10672	10681	80 %	20 %	0 %	0 %	157150588
11	NC_009785	TTTTA	2	10	10702	10711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009785	AAATA	2	10	12470	12479	80 %	20 %	0 %	0 %	157150999
13	NC_009785	GAAAA	2	10	12804	12813	80 %	0 %	20 %	0 %	157150999
14	NC_009785	GACTT	2	10	12925	12934	20 %	40 %	20 %	20 %	157150999
15	NC_009785	TGAAA	2	10	16296	16305	60 %	20 %	20 %	0 %	157150093
16	NC_009785	TTTGG	2	10	16897	16906	0 %	60 %	40 %	0 %	157150917
17	NC_009785	TCAAG	2	10	17316	17325	40 %	20 %	20 %	20 %	157150917
18	NC_009785	TATAT	2	10	18996	19005	40 %	60 %	0 %	0 %	157150603
19	NC_009785	GCTGA	2	10	19630	19639	20 %	20 %	40 %	20 %	157151203
20	NC_009785	GATTC	2	10	20055	20064	20 %	40 %	20 %	20 %	157150581
21	NC_009785	CAAAC	2	10	20454	20463	60 %	0 %	0 %	40 %	157150581
22	NC_009785	ATAGA	2	10	21353	21362	60 %	20 %	20 %	0 %	157151322
23	NC_009785	AAAAT	2	10	21587	21596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009785	AGCAC	2	10	22515	22524	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009785	CCAGC	2	10	23210	23219	20 %	0 %	20 %	60 %	157150902
26	NC_009785	GATTT	2	10	24337	24346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009785	GGTAA	2	10	24869	24878	40 %	20 %	40 %	0 %	157149984
28	NC_009785	GCTAT	2	10	25494	25503	20 %	40 %	20 %	20 %	157149984
29	NC_009785	AATGA	2	10	25898	25907	60 %	20 %	20 %	0 %	157149984
30	NC_009785	AGTTC	2	10	26044	26053	20 %	40 %	20 %	20 %	157149984
31	NC_009785	AAAAC	2	10	26368	26377	80 %	0 %	0 %	20 %	157149984
32	NC_009785	AGCTT	2	10	27989	27998	20 %	40 %	20 %	20 %	157150426
33	NC_009785	AGAGA	2	10	31594	31603	60 %	0 %	40 %	0 %	157150580
34	NC_009785	CTAGA	2	10	33716	33725	40 %	20 %	20 %	20 %	157150072
35	NC_009785	TCAAC	2	10	34519	34528	40 %	20 %	0 %	40 %	157151026
36	NC_009785	ATCTG	2	10	36943	36952	20 %	40 %	20 %	20 %	157151635
37	NC_009785	GTCCT	2	10	41478	41487	0 %	40 %	20 %	40 %	157149802
38	NC_009785	TCAAA	2	10	43851	43860	60 %	20 %	0 %	20 %	157151031
39	NC_009785	ATATA	2	10	44406	44415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009785	GAAGG	2	10	45519	45528	40 %	0 %	60 %	0 %	157149977
41	NC_009785	GAATC	2	10	47141	47150	40 %	20 %	20 %	20 %	157150435
42	NC_009785	TCCTC	2	10	49853	49862	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_009785	GAGAT	2	10	50839	50848	40 %	20 %	40 %	0 %	157150602
44	NC_009785	TTTGC	2	10	50976	50985	0 %	60 %	20 %	20 %	157150602
45	NC_009785	TCAGA	2	10	52865	52874	40 %	20 %	20 %	20 %	157150899
46	NC_009785	CCTTG	2	10	53204	53213	0 %	40 %	20 %	40 %	157150899
47	NC_009785	TTTGG	2	10	56973	56982	0 %	60 %	40 %	0 %	157150049
48	NC_009785	TAATG	2	10	59067	59076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009785	TATCT	2	10	59526	59535	20 %	60 %	0 %	20 %	157150009
50	NC_009785	ACAAA	2	10	59911	59920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009785	ATTAA	2	10	59946	59955	60 %	40 %	0 %	0 %	157150474
52	NC_009785	CAAAA	3	15	60416	60430	80 %	0 %	0 %	20 %	157150930
53	NC_009785	GGAAT	2	10	68258	68267	40 %	20 %	40 %	0 %	157150026
54	NC_009785	ATTCT	2	10	69310	69319	20 %	60 %	0 %	20 %	157150026
55	NC_009785	TATTT	2	10	69925	69934	20 %	80 %	0 %	0 %	157151627
56	NC_009785	AAAGA	2	10	70496	70505	80 %	0 %	20 %	0 %	157151627
57	NC_009785	TATAT	2	10	73201	73210	40 %	60 %	0 %	0 %	157150168
58	NC_009785	AATAA	2	10	74050	74059	80 %	20 %	0 %	0 %	157151288
59	NC_009785	TTGGT	2	10	74784	74793	0 %	60 %	40 %	0 %	157151699
60	NC_009785	AATTT	2	10	75059	75068	40 %	60 %	0 %	0 %	157151699
61	NC_009785	CAATG	2	10	76467	76476	40 %	20 %	20 %	20 %	157151242
62	NC_009785	ATACA	2	10	77595	77604	60 %	20 %	0 %	20 %	157149865
63	NC_009785	GTTAA	2	10	79680	79689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009785	GGGAA	2	10	80979	80988	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009785	AAGAA	2	10	84034	84043	80 %	0 %	20 %	0 %	157149698
66	NC_009785	ATGGA	2	10	84329	84338	40 %	20 %	40 %	0 %	157149698
67	NC_009785	CAAAT	2	10	84671	84680	60 %	20 %	0 %	20 %	157150309
68	NC_009785	CAATC	2	10	85674	85683	40 %	20 %	0 %	40 %	157150416
69	NC_009785	GGGCT	2	10	86116	86125	0 %	20 %	60 %	20 %	157151541
70	NC_009785	TAAGG	2	10	87928	87937	40 %	20 %	40 %	0 %	157149696
71	NC_009785	CTTTT	2	10	89626	89635	0 %	80 %	0 %	20 %	157150909
72	NC_009785	AGTCT	2	10	93561	93570	20 %	40 %	20 %	20 %	157151578
73	NC_009785	TTCTT	2	10	93608	93617	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009785	TGTTT	2	10	93651	93660	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009785	TGACT	2	10	95723	95732	20 %	40 %	20 %	20 %	157150727
76	NC_009785	TTTGA	2	10	98610	98619	20 %	60 %	20 %	0 %	157150052
77	NC_009785	CTGTT	2	10	99536	99545	0 %	60 %	20 %	20 %	157151248
78	NC_009785	AAAGC	2	10	100599	100608	60 %	0 %	20 %	20 %	157151248
79	NC_009785	AGATA	2	10	103922	103931	60 %	20 %	20 %	0 %	157150429
80	NC_009785	ACTTT	2	10	109678	109687	20 %	60 %	0 %	20 %	157149840
81	NC_009785	AGAAA	2	10	109730	109739	80 %	0 %	20 %	0 %	157149840
82	NC_009785	TCGTA	2	10	112264	112273	20 %	40 %	20 %	20 %	157151122
83	NC_009785	CTTCA	2	10	114571	114580	20 %	40 %	0 %	40 %	157151122
84	NC_009785	GAAAA	2	10	116580	116589	80 %	0 %	20 %	0 %	157151528
85	NC_009785	CTTTT	2	10	116725	116734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009785	TTAAT	2	10	119532	119541	40 %	60 %	0 %	0 %	157151084
87	NC_009785	AAATT	2	10	119646	119655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009785	ATGGT	2	10	120608	120617	20 %	40 %	40 %	0 %	157150332
89	NC_009785	TCAAT	2	10	121294	121303	40 %	40 %	0 %	20 %	157150332
90	NC_009785	TTTAT	2	10	122708	122717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009785	TAAGA	2	10	122720	122729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009785	GTTTT	2	10	123052	123061	0 %	80 %	20 %	0 %	157149834
93	NC_009785	CAATC	2	10	123605	123614	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009785	ACAAA	2	10	124659	124668	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009785	GGAAG	2	10	125269	125278	40 %	0 %	60 %	0 %	157151607
96	NC_009785	AAAAT	2	10	129001	129010	80 %	20 %	0 %	0 %	157151332
97	NC_009785	TTTGC	2	10	129755	129764	0 %	60 %	20 %	20 %	157151603
98	NC_009785	TAAAA	2	10	130182	130191	80 %	20 %	0 %	0 %	157151603
99	NC_009785	TTTGC	2	10	132694	132703	0 %	60 %	20 %	20 %	157151330
100	NC_009785	CCTGA	2	10	134481	134490	20 %	20 %	20 %	40 %	157150392
101	NC_009785	AGCAA	2	10	135871	135880	60 %	0 %	20 %	20 %	157150392
102	NC_009785	GAAAT	2	10	139215	139224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009785	GTCTC	2	10	142125	142134	0 %	40 %	20 %	40 %	157149878
104	NC_009785	CTGGG	2	10	142366	142375	0 %	20 %	60 %	20 %	157149878
105	NC_009785	ATCAA	2	10	143665	143674	60 %	20 %	0 %	20 %	157150806
106	NC_009785	TCAAG	2	10	144114	144123	40 %	20 %	20 %	20 %	157150806
107	NC_009785	CTGGG	2	10	147590	147599	0 %	20 %	60 %	20 %	157150772
108	NC_009785	AATTA	2	10	156748	156757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009785	AAAGA	2	10	162979	162988	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009785	TGGAA	2	10	166361	166370	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009785	CAAAC	2	10	166408	166417	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009785	GGAGT	2	10	169458	169467	20 %	20 %	60 %	0 %	157151315
113	NC_009785	TTTCT	2	10	170277	170286	0 %	80 %	0 %	20 %	157150215
114	NC_009785	GAAAT	2	10	171465	171474	60 %	20 %	20 %	0 %	157150938
115	NC_009785	CTTTG	2	10	172133	172142	0 %	60 %	20 %	20 %	157150938
116	NC_009785	ATTTC	2	10	173481	173490	20 %	60 %	0 %	20 %	157150886
117	NC_009785	AATCA	2	10	176245	176254	60 %	20 %	0 %	20 %	157149807
118	NC_009785	GAAAG	2	10	177105	177114	60 %	0 %	40 %	0 %	157149807
119	NC_009785	GAATG	2	10	177895	177904	40 %	20 %	40 %	0 %	157150555
120	NC_009785	ATTCG	2	10	179500	179509	20 %	40 %	20 %	20 %	157151119
121	NC_009785	CTTTT	2	10	179866	179875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009785	GACTG	2	10	182440	182449	20 %	20 %	40 %	20 %	157150256
123	NC_009785	TAAGA	2	10	183730	183739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009785	GCTGG	2	10	185134	185143	0 %	20 %	60 %	20 %	157150913
125	NC_009785	TCAAA	2	10	185719	185728	60 %	20 %	0 %	20 %	157150913
126	NC_009785	TTTTA	2	10	185917	185926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009785	TAGCC	2	10	187399	187408	20 %	20 %	20 %	40 %	157149768
128	NC_009785	GCTTT	2	10	187833	187842	0 %	60 %	20 %	20 %	157149768
129	NC_009785	GTCTC	2	10	188035	188044	0 %	40 %	20 %	40 %	157149768
130	NC_009785	TCACA	2	10	189235	189244	40 %	20 %	0 %	40 %	157149832
131	NC_009785	AAGCT	2	10	189895	189904	40 %	20 %	20 %	20 %	157149832
132	NC_009785	TAGTA	2	10	193787	193796	40 %	40 %	20 %	0 %	157151540
133	NC_009785	CAAAC	2	10	194080	194089	60 %	0 %	0 %	40 %	157151540
134	NC_009785	AAAAC	2	10	196154	196163	80 %	0 %	0 %	20 %	157150837
135	NC_009785	GAGAA	2	10	196274	196283	60 %	0 %	40 %	0 %	157150837
136	NC_009785	ACGAG	2	10	196359	196368	40 %	0 %	40 %	20 %	157151421
137	NC_009785	CTGGT	2	10	196611	196620	0 %	40 %	40 %	20 %	157151421
138	NC_009785	TCAAG	2	10	197504	197513	40 %	20 %	20 %	20 %	157151278
139	NC_009785	AAAAG	2	10	197766	197775	80 %	0 %	20 %	0 %	157151700
140	NC_009785	GAATG	2	10	198994	199003	40 %	20 %	40 %	0 %	157151700
141	NC_009785	AAAAG	2	10	199482	199491	80 %	0 %	20 %	0 %	157150398
142	NC_009785	CGGAT	2	10	199968	199977	20 %	20 %	40 %	20 %	157149731
143	NC_009785	TAATA	2	10	201922	201931	60 %	40 %	0 %	0 %	157151409
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151	NC_009785	AAGAA	2	10	213309	213318	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009785	AAGTT	2	10	213733	213742	40 %	40 %	20 %	0 %	157150004
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155	NC_009785	TATCT	2	10	216574	216583	20 %	60 %	0 %	20 %	157150004
156	NC_009785	AAAGG	2	10	219772	219781	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009785	AAAAG	2	10	219794	219803	80 %	0 %	20 %	0 %	157151439
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161	NC_009785	ATTTC	2	10	224769	224778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_009785	AAAGT	2	10	224965	224974	60 %	20 %	20 %	0 %	157150597
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164	NC_009785	AAGCT	2	10	226105	226114	40 %	20 %	20 %	20 %	157150597
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166	NC_009785	TTGAA	2	10	227779	227788	40 %	40 %	20 %	0 %	157150597
167	NC_009785	GATAA	2	10	229610	229619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_009785	AATGG	2	10	301565	301574	40 %	20 %	40 %	0 %	157151407
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242	NC_009785	CCTAT	2	10	304547	304556	20 %	40 %	0 %	40 %	157151099
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246	NC_009785	CCCTT	2	10	309813	309822	0 %	40 %	0 %	60 %	157149893
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250	NC_009785	GGGGC	2	10	317826	317835	0 %	0 %	80 %	20 %	157151619
251	NC_009785	TTCTT	2	10	318885	318894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
252	NC_009785	GCTAA	2	10	320867	320876	40 %	20 %	20 %	20 %	157151645
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254	NC_009785	GACCC	2	10	326559	326568	20 %	0 %	20 %	60 %	157151609
255	NC_009785	TCTGG	2	10	327785	327794	0 %	40 %	40 %	20 %	157151394
256	NC_009785	GATAA	2	10	329501	329510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009785	AGAAA	2	10	329613	329622	80 %	0 %	20 %	0 %	157151395
258	NC_009785	TTTTA	2	10	331919	331928	20 %	80 %	0 %	0 %	157149732
259	NC_009785	GTTTT	2	10	339036	339045	0 %	80 %	20 %	0 %	157151510
260	NC_009785	CCAAA	2	10	339798	339807	60 %	0 %	0 %	40 %	157151510
261	NC_009785	GTTGA	2	10	342173	342182	20 %	40 %	40 %	0 %	157151510
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264	NC_009785	AGCTC	2	10	344110	344119	20 %	20 %	20 %	40 %	157150159
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268	NC_009785	TCCTT	2	10	351865	351874	0 %	60 %	0 %	40 %	157149933
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399	NC_009785	GAAAG	2	10	527430	527439	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_009785	TTGAT	2	10	528872	528881	20 %	60 %	20 %	0 %	157150140
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