MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 5535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	GATT	2	8	260	267	25 %	50 %	25 %	0 %	157149691
2	NC_009785	ATTT	2	8	436	443	25 %	75 %	0 %	0 %	157149691
3	NC_009785	ATTT	2	8	1699	1706	25 %	75 %	0 %	0 %	157151517
4	NC_009785	CTTT	2	8	1912	1919	0 %	75 %	0 %	25 %	157151517
5	NC_009785	TAAT	2	8	2107	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	157151517
6	NC_009785	TGAA	2	8	2605	2612	50 %	25 %	25 %	0 %	157151517
7	NC_009785	AATT	2	8	2782	2789	50 %	50 %	0 %	0 %	157151517
8	NC_009785	CCTT	2	8	3670	3677	0 %	50 %	0 %	50 %	157150786
9	NC_009785	GAAT	2	8	3898	3905	50 %	25 %	25 %	0 %	157150786
10	NC_009785	TGAT	2	8	3928	3935	25 %	50 %	25 %	0 %	157150786
11	NC_009785	TGTT	2	8	4008	4015	0 %	75 %	25 %	0 %	157150786
12	NC_009785	TTTG	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	157150786
13	NC_009785	CAAA	2	8	4834	4841	75 %	0 %	0 %	25 %	157150786
14	NC_009785	AAAT	2	8	4991	4998	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
15	NC_009785	AATA	2	8	5184	5191	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
16	NC_009785	TAGC	2	8	5258	5265	25 %	25 %	25 %	25 %	157150786
17	NC_009785	AATA	2	8	6071	6078	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
18	NC_009785	GATT	2	8	6639	6646	25 %	50 %	25 %	0 %	157150583
19	NC_009785	TTTA	2	8	7188	7195	25 %	75 %	0 %	0 %	157150583
20	NC_009785	CCAA	2	8	7256	7263	50 %	0 %	0 %	50 %	157150583
21	NC_009785	CTCA	2	8	7374	7381	25 %	25 %	0 %	50 %	157150583
22	NC_009785	ATTT	2	8	8180	8187	25 %	75 %	0 %	0 %	157150103
23	NC_009785	AGCT	2	8	8336	8343	25 %	25 %	25 %	25 %	157150103
24	NC_009785	GAAA	2	8	8389	8396	75 %	0 %	25 %	0 %	157150103
25	NC_009785	GTTC	2	8	8563	8570	0 %	50 %	25 %	25 %	157150103
26	NC_009785	ATTT	2	8	8698	8705	25 %	75 %	0 %	0 %	157150103
27	NC_009785	ATTA	2	8	9076	9083	50 %	50 %	0 %	0 %	157150103
28	NC_009785	GTTG	2	8	9599	9606	0 %	50 %	50 %	0 %	157150588
29	NC_009785	TCAA	2	8	9646	9653	50 %	25 %	0 %	25 %	157150588
30	NC_009785	ATCT	2	8	10115	10122	25 %	50 %	0 %	25 %	157150588
31	NC_009785	TCAA	2	8	10976	10983	50 %	25 %	0 %	25 %	157149944
32	NC_009785	TAAA	2	8	11112	11119	75 %	25 %	0 %	0 %	157149944
33	NC_009785	GATA	2	8	11195	11202	50 %	25 %	25 %	0 %	157149944
34	NC_009785	AGTG	2	8	11845	11852	25 %	25 %	50 %	0 %	157149944
35	NC_009785	GAAG	2	8	12986	12993	50 %	0 %	50 %	0 %	157150999
36	NC_009785	AATC	2	8	13152	13159	50 %	25 %	0 %	25 %	157150999
37	NC_009785	AATG	2	8	13226	13233	50 %	25 %	25 %	0 %	157150999
38	NC_009785	TAAT	2	8	13390	13397	50 %	50 %	0 %	0 %	157150999
39	NC_009785	CAAG	2	8	13840	13847	50 %	0 %	25 %	25 %	157150891
40	NC_009785	GTTT	2	8	14136	14143	0 %	75 %	25 %	0 %	157150891
41	NC_009785	CAAT	2	8	15987	15994	50 %	25 %	0 %	25 %	157150301
42	NC_009785	CAAT	2	8	16020	16027	50 %	25 %	0 %	25 %	157150301
43	NC_009785	TGGA	2	8	16190	16197	25 %	25 %	50 %	0 %	157150093
44	NC_009785	CCTG	2	8	16312	16319	0 %	25 %	25 %	50 %	157150093
45	NC_009785	TCTG	2	8	16490	16497	0 %	50 %	25 %	25 %	157150093
46	NC_009785	TAAA	2	8	16575	16582	75 %	25 %	0 %	0 %	157150093
47	NC_009785	TGAT	2	8	16739	16746	25 %	50 %	25 %	0 %	157150917
48	NC_009785	CAAT	2	8	16857	16864	50 %	25 %	0 %	25 %	157150917
49	NC_009785	TGAA	2	8	17333	17340	50 %	25 %	25 %	0 %	157150917
50	NC_009785	GTTA	2	8	17415	17422	25 %	50 %	25 %	0 %	157150162
51	NC_009785	GATG	2	8	18005	18012	25 %	25 %	50 %	0 %	157150162
52	NC_009785	TTGT	2	8	18313	18320	0 %	75 %	25 %	0 %	157150603
53	NC_009785	TTTC	2	8	18391	18398	0 %	75 %	0 %	25 %	157150603
54	NC_009785	TTAA	2	8	19363	19370	50 %	50 %	0 %	0 %	157151203
55	NC_009785	CAGT	2	8	20509	20516	25 %	25 %	25 %	25 %	157150581
56	NC_009785	CATT	2	8	20919	20926	25 %	50 %	0 %	25 %	157151322
57	NC_009785	AGCT	2	8	21963	21970	25 %	25 %	25 %	25 %	157150750
58	NC_009785	CCTT	2	8	22896	22903	0 %	50 %	0 %	50 %	157150902
59	NC_009785	ACTT	2	8	23021	23028	25 %	50 %	0 %	25 %	157150902
60	NC_009785	TTTC	2	8	23917	23924	0 %	75 %	0 %	25 %	157150287
61	NC_009785	GCTG	2	8	24538	24545	0 %	25 %	50 %	25 %	157149984
62	NC_009785	TGAT	2	8	25713	25720	25 %	50 %	25 %	0 %	157149984
63	NC_009785	AAAC	2	8	25944	25951	75 %	0 %	0 %	25 %	157149984
64	NC_009785	AATC	2	8	26251	26258	50 %	25 %	0 %	25 %	157149984
65	NC_009785	GGAA	2	8	26332	26339	50 %	0 %	50 %	0 %	157149984
66	NC_009785	TGCT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	25 %	25 %	157150426
67	NC_009785	TCAG	2	8	27311	27318	25 %	25 %	25 %	25 %	157150426
68	NC_009785	TAAG	2	8	28175	28182	50 %	25 %	25 %	0 %	157150426
69	NC_009785	TGCT	2	8	28460	28467	0 %	50 %	25 %	25 %	157150426
70	NC_009785	GTAA	2	8	28495	28502	50 %	25 %	25 %	0 %	157150426
71	NC_009785	GCAA	2	8	28826	28833	50 %	0 %	25 %	25 %	157150251
72	NC_009785	AAGG	2	8	29145	29152	50 %	0 %	50 %	0 %	157150251
73	NC_009785	TAAG	2	8	29154	29161	50 %	25 %	25 %	0 %	157150251
74	NC_009785	TCGT	2	8	29280	29287	0 %	50 %	25 %	25 %	157149685
75	NC_009785	TGAT	2	8	29346	29353	25 %	50 %	25 %	0 %	157149685
76	NC_009785	ATCA	2	8	29558	29565	50 %	25 %	0 %	25 %	157149685
77	NC_009785	GTTC	2	8	29705	29712	0 %	50 %	25 %	25 %	157149685
78	NC_009785	TCGC	2	8	30085	30092	0 %	25 %	25 %	50 %	157149685
79	NC_009785	TTGA	2	8	30137	30144	25 %	50 %	25 %	0 %	157149685
80	NC_009785	TTGA	2	8	30669	30676	25 %	50 %	25 %	0 %	157151155
81	NC_009785	TACT	2	8	30761	30768	25 %	50 %	0 %	25 %	157151155
82	NC_009785	AAAG	2	8	30829	30836	75 %	0 %	25 %	0 %	157151155
83	NC_009785	GCTT	2	8	31157	31164	0 %	50 %	25 %	25 %	157150580
84	NC_009785	CAGC	2	8	31178	31185	25 %	0 %	25 %	50 %	157150580
85	NC_009785	TACC	2	8	31624	31631	25 %	25 %	0 %	50 %	157150580
86	NC_009785	AAGC	2	8	31633	31640	50 %	0 %	25 %	25 %	157150580
87	NC_009785	CTGG	2	8	31679	31686	0 %	25 %	50 %	25 %	157150580
88	NC_009785	CCAA	2	8	33100	33107	50 %	0 %	0 %	50 %	157150072
89	NC_009785	TTCT	2	8	33182	33189	0 %	75 %	0 %	25 %	157150072
90	NC_009785	TGGT	2	8	33854	33861	0 %	50 %	50 %	0 %	157150072
91	NC_009785	TATC	2	8	33928	33935	25 %	50 %	0 %	25 %	157151465
92	NC_009785	AAAT	2	8	34294	34301	75 %	25 %	0 %	0 %	157151026
93	NC_009785	AAGA	2	8	34400	34407	75 %	0 %	25 %	0 %	157151026
94	NC_009785	ATTG	2	8	34801	34808	25 %	50 %	25 %	0 %	157151026
95	NC_009785	TAAG	2	8	34990	34997	50 %	25 %	25 %	0 %	157151026
96	NC_009785	AGAT	2	8	35209	35216	50 %	25 %	25 %	0 %	157151635
97	NC_009785	TACT	2	8	35671	35678	25 %	50 %	0 %	25 %	157151635
98	NC_009785	AATC	2	8	36589	36596	50 %	25 %	0 %	25 %	157151635
99	NC_009785	ACAA	2	8	37756	37763	75 %	0 %	0 %	25 %	157151635
100	NC_009785	TGGC	2	8	38405	38412	0 %	25 %	50 %	25 %	157151635
101	NC_009785	CAAG	2	8	38607	38614	50 %	0 %	25 %	25 %	157151635
102	NC_009785	CGTT	2	8	38716	38723	0 %	50 %	25 %	25 %	157151635
103	NC_009785	GGCT	2	8	39167	39174	0 %	25 %	50 %	25 %	157150020
104	NC_009785	CTAA	2	8	39187	39194	50 %	25 %	0 %	25 %	157150020
105	NC_009785	AAGA	2	8	39208	39215	75 %	0 %	25 %	0 %	157150020
106	NC_009785	TGAT	2	8	39905	39912	25 %	50 %	25 %	0 %	157150020
107	NC_009785	CAGG	2	8	40717	40724	25 %	0 %	50 %	25 %	157150745
108	NC_009785	GTAT	2	8	40763	40770	25 %	50 %	25 %	0 %	157150745
109	NC_009785	GCTT	2	8	40872	40879	0 %	50 %	25 %	25 %	157150745
110	NC_009785	ACTC	2	8	40904	40911	25 %	25 %	0 %	50 %	157150745
111	NC_009785	AAGA	2	8	41317	41324	75 %	0 %	25 %	0 %	157150745
112	NC_009785	ATCC	2	8	41646	41653	25 %	25 %	0 %	50 %	157149802
113	NC_009785	TAGT	2	8	42274	42281	25 %	50 %	25 %	0 %	157150257
114	NC_009785	TAAA	2	8	42388	42395	75 %	25 %	0 %	0 %	157150257
115	NC_009785	TATT	2	8	42472	42479	25 %	75 %	0 %	0 %	157150257
116	NC_009785	ATTG	2	8	42883	42890	25 %	50 %	25 %	0 %	157151031
117	NC_009785	CAAG	2	8	43228	43235	50 %	0 %	25 %	25 %	157151031
118	NC_009785	GCTA	2	8	43618	43625	25 %	25 %	25 %	25 %	157151031
119	NC_009785	GCCA	2	8	43791	43798	25 %	0 %	25 %	50 %	157151031
120	NC_009785	TTAG	2	8	44218	44225	25 %	50 %	25 %	0 %	157150111
121	NC_009785	TTTG	3	12	44234	44245	0 %	75 %	25 %	0 %	157150111
122	NC_009785	GATA	2	8	44798	44805	50 %	25 %	25 %	0 %	157150570
123	NC_009785	AGGC	2	8	45920	45927	25 %	0 %	50 %	25 %	157149977
124	NC_009785	TGAT	2	8	45932	45939	25 %	50 %	25 %	0 %	157149977
125	NC_009785	GGAA	2	8	46076	46083	50 %	0 %	50 %	0 %	157149977
126	NC_009785	CAAG	2	8	46137	46144	50 %	0 %	25 %	25 %	157149977
127	NC_009785	GTTT	2	8	46403	46410	0 %	75 %	25 %	0 %	157149977
128	NC_009785	AGGA	2	8	47021	47028	50 %	0 %	50 %	0 %	157149977
129	NC_009785	AACC	2	8	47089	47096	50 %	0 %	0 %	50 %	157149977
130	NC_009785	GACG	2	8	47151	47158	25 %	0 %	50 %	25 %	157150435
131	NC_009785	TCAG	2	8	47450	47457	25 %	25 %	25 %	25 %	157150435
132	NC_009785	ACTT	2	8	47948	47955	25 %	50 %	0 %	25 %	157149804
133	NC_009785	ACTT	2	8	47981	47988	25 %	50 %	0 %	25 %	157149804
134	NC_009785	CTTA	2	8	48104	48111	25 %	50 %	0 %	25 %	157149804
135	NC_009785	AGCA	2	8	48499	48506	50 %	0 %	25 %	25 %	157149804
136	NC_009785	CAAA	2	8	48572	48579	75 %	0 %	0 %	25 %	157150193
137	NC_009785	GAAA	2	8	48704	48711	75 %	0 %	25 %	0 %	157150193
138	NC_009785	CTTA	2	8	49286	49293	25 %	50 %	0 %	25 %	157150193
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