MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 28596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	AAT	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
2	NC_009785	AAT	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
3	NC_009785	AGA	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
4	NC_009785	AGA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
5	NC_009785	CAG	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149691
6	NC_009785	TCC	2	6	483	488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149691
7	NC_009785	TGG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149691
8	NC_009785	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149691
9	NC_009785	CTG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149691
10	NC_009785	TAT	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149691
11	NC_009785	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149691
12	NC_009785	AAG	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
13	NC_009785	ACT	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149691
14	NC_009785	GAA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
15	NC_009785	CTC	2	6	992	997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149691
16	NC_009785	GAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
17	NC_009785	ATA	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
18	NC_009785	ACA	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149691
19	NC_009785	AGA	3	9	1461	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
20	NC_009785	CTA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009785	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009785	TAA	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151517
23	NC_009785	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151517
24	NC_009785	CTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151517
25	NC_009785	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
26	NC_009785	GTC	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151517
27	NC_009785	ATT	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151517
28	NC_009785	GTT	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
29	NC_009785	ATC	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151517
30	NC_009785	GTT	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
31	NC_009785	TGC	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151517
32	NC_009785	TAT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151517
33	NC_009785	AAG	3	9	2764	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151517
34	NC_009785	TGT	2	6	2947	2952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151188
35	NC_009785	GAT	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151188
36	NC_009785	TGA	2	6	3001	3006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151188
37	NC_009785	TAT	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150252
38	NC_009785	TTC	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
39	NC_009785	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
40	NC_009785	TTC	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
41	NC_009785	AGC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150252
42	NC_009785	CTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
43	NC_009785	TCA	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
44	NC_009785	AGT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150252
45	NC_009785	TAG	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150252
46	NC_009785	TAA	2	6	3438	3443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150252
47	NC_009785	CTT	3	9	3448	3456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
48	NC_009785	CTA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
49	NC_009785	TAA	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150252
50	NC_009785	CAT	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
51	NC_009785	CCT	2	6	3547	3552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009785	AAG	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
53	NC_009785	GTA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150786
54	NC_009785	CTT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150786
55	NC_009785	ATT	2	6	4053	4058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
56	NC_009785	TGT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
57	NC_009785	CAA	2	6	4097	4102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150786
58	NC_009785	ATC	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150786
59	NC_009785	ATT	2	6	4203	4208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
60	NC_009785	ATT	2	6	4239	4244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
61	NC_009785	AAT	2	6	4248	4253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
62	NC_009785	ATT	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
63	NC_009785	TTA	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
64	NC_009785	AGA	2	6	4611	4616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
65	NC_009785	TAT	3	9	4700	4708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
66	NC_009785	GAA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
67	NC_009785	TGT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
68	NC_009785	TAA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
69	NC_009785	CTG	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150786
70	NC_009785	ATA	2	6	5465	5470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
71	NC_009785	TGT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
72	NC_009785	CAT	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150786
73	NC_009785	AAT	2	6	5676	5681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
74	NC_009785	AGC	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150786
75	NC_009785	GAA	2	6	5990	5995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
76	NC_009785	GTA	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150786
77	NC_009785	TGA	2	6	6028	6033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150786
78	NC_009785	CTT	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150583
79	NC_009785	TCA	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150583
80	NC_009785	TCA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150583
81	NC_009785	AAT	2	6	6321	6326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150583
82	NC_009785	ATA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150583
83	NC_009785	CAT	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150583
84	NC_009785	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150583
85	NC_009785	GGA	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157150583
86	NC_009785	TCT	3	9	6601	6609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150583
87	NC_009785	CAC	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157150583
88	NC_009785	GTT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150583
89	NC_009785	TGT	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150583
90	NC_009785	TCT	2	6	6952	6957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150583
91	NC_009785	CAA	2	6	7031	7036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150583
92	NC_009785	AGT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150583
93	NC_009785	ACA	2	6	7216	7221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150583
94	NC_009785	TAT	2	6	7229	7234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150583
95	NC_009785	TCT	2	6	7399	7404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150583
96	NC_009785	ATA	2	6	7579	7584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150583
97	NC_009785	ACA	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150583
98	NC_009785	GAA	2	6	7631	7636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150583
99	NC_009785	GTT	2	6	7675	7680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150583
100	NC_009785	TCA	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150583
101	NC_009785	AAT	2	6	7789	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150583
102	NC_009785	AAG	2	6	7906	7911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009785	GAG	2	6	8056	8061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009785	TAT	2	6	8079	8084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150103
105	NC_009785	CAA	2	6	8203	8208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150103
106	NC_009785	ATT	2	6	8242	8247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150103
107	NC_009785	ATT	2	6	8273	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150103
108	NC_009785	GCT	2	6	8281	8286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150103
109	NC_009785	TAT	2	6	8356	8361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150103
110	NC_009785	GGC	2	6	8478	8483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157150103
111	NC_009785	AGC	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150103
112	NC_009785	AAT	2	6	8689	8694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150103
113	NC_009785	TGA	2	6	8709	8714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150103
114	NC_009785	AGA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150103
115	NC_009785	TGC	2	6	8856	8861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150103
116	NC_009785	GGC	2	6	8884	8889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157150103
117	NC_009785	GAT	2	6	9093	9098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009785	TAT	2	6	9120	9125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009785	CTA	2	6	9157	9162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009785	TGA	2	6	9239	9244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150588
121	NC_009785	TTG	2	6	9249	9254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150588
122	NC_009785	ATT	2	6	9336	9341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150588
123	NC_009785	CAG	2	6	9343	9348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150588
124	NC_009785	GGT	2	6	9399	9404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157150588
125	NC_009785	CAA	2	6	9438	9443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150588
126	NC_009785	TTA	2	6	9484	9489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150588
127	NC_009785	GTG	2	6	9562	9567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157150588
128	NC_009785	GTT	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150588
129	NC_009785	CTG	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150588
130	NC_009785	TGA	2	6	9767	9772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150588
131	NC_009785	GTC	2	6	9778	9783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150588
132	NC_009785	TGC	2	6	9836	9841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150588
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