MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome II

Total Repeats: 561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009784	ATGGTG	2	12	944	955	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156975953
2	NC_009784	CATTCA	2	12	7259	7270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156975962
3	NC_009784	GTTTTA	2	12	13137	13148	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156975970
4	NC_009784	TTGGTT	2	12	19733	19744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156975980
5	NC_009784	TGCATT	2	12	22029	22040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156975982
6	NC_009784	CTTATC	2	12	24018	24029	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156975984
7	NC_009784	ACTCTT	2	12	28560	28571	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156975991
8	NC_009784	GACCTT	2	12	29901	29912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156975992
9	NC_009784	AATACG	2	12	35726	35737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156975999
10	NC_009784	TTTTTG	2	12	44066	44077	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	156976011
11	NC_009784	ACGAGT	2	12	44341	44352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156976011
12	NC_009784	TCAGCT	2	12	53213	53224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976018
13	NC_009784	CGTGGC	2	12	67102	67113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156976035
14	NC_009784	TCGCTG	2	12	69013	69024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156976037
15	NC_009784	GAGCAA	2	12	70025	70036	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156976039
16	NC_009784	TTTGAC	2	12	71282	71293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156976039
17	NC_009784	TCACCA	2	12	72604	72615	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156976041
18	NC_009784	TGTAGT	2	12	74866	74877	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156976043
19	NC_009784	CTAGTG	2	12	76393	76404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976044
20	NC_009784	TTTGCT	2	12	80974	80985	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156976047
21	NC_009784	TGGTGT	2	12	84684	84695	0 %	50 %	50 %	0 %	156976051
22	NC_009784	TGCCAG	2	12	93268	93279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976058
23	NC_009784	AAAAAT	2	12	97543	97554	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	156976060
24	NC_009784	TAGTGA	2	12	104806	104817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156976068
25	NC_009784	GTCTAG	2	12	104879	104890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976068
26	NC_009784	ATGGGT	2	12	104986	104997	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156976068
27	NC_009784	AGACCC	2	12	105249	105260	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156976068
28	NC_009784	TTGCAT	2	12	105716	105727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156976068
29	NC_009784	GTCACT	2	12	107995	108006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976071
30	NC_009784	CATTTC	2	12	109144	109155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156976073
31	NC_009784	CTCAAA	2	12	109970	109981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156976074
32	NC_009784	ATTGGA	2	12	110490	110501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156976074
33	NC_009784	ACATCT	2	12	117045	117056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156976078
34	NC_009784	GGCTTT	2	12	121428	121439	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156976080
35	NC_009784	TGCTTT	2	12	122387	122398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156976081
36	NC_009784	ACCTTG	2	12	123952	123963	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976084
37	NC_009784	CTTTTG	2	12	125190	125201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156976087
38	NC_009784	GACTTT	2	12	143871	143882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156976104
39	NC_009784	ACAACT	2	12	150536	150547	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156976110
40	NC_009784	TAAACC	2	12	159274	159285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156976120
41	NC_009784	TTTGAT	2	12	162877	162888	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156976123
42	NC_009784	GCACCA	2	12	173109	173120	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156976134
43	NC_009784	CAAAAT	2	12	174240	174251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	156976137
44	NC_009784	ACAGGC	2	12	176832	176843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156976141
45	NC_009784	GAAGTG	2	12	178302	178313	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156976142
46	NC_009784	TAGGTT	2	12	188423	188434	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156976151
47	NC_009784	ACATGA	2	12	190475	190486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156976153
48	NC_009784	CTCTTT	2	12	193663	193674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156976156
49	NC_009784	TGATTG	2	12	202011	202022	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156976165
50	NC_009784	CATTCA	2	12	205610	205621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156976172
51	NC_009784	GTTGAG	2	12	208148	208159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156976177
52	NC_009784	CTTGAG	2	12	211933	211944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976182
53	NC_009784	TTGGAT	2	12	211963	211974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156976182
54	NC_009784	TATATC	2	12	216991	217002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156976189
55	NC_009784	GCTTGT	2	12	219271	219282	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156976192
56	NC_009784	GAAGTG	2	12	224954	224965	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156976198
57	NC_009784	CGGGTA	2	12	227202	227213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156976200
58	NC_009784	AGCTTG	2	12	229711	229722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976202
59	NC_009784	GCGTCA	2	12	233398	233409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976206
60	NC_009784	GGTATC	2	12	235405	235416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976207
61	NC_009784	CTTTAA	2	12	235923	235934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156976207
62	NC_009784	ACTTTG	2	12	240253	240264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156976212
63	NC_009784	ACCATC	2	12	246113	246124	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156976218
64	NC_009784	TTGTCT	2	12	247638	247649	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156976220
65	NC_009784	TTGATG	2	12	251561	251572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156976225
66	NC_009784	ATCAGC	2	12	264861	264872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156976236
67	NC_009784	TAAATT	2	12	266013	266024	50 %	50 %	0 %	0 %	156976236
68	NC_009784	TTTCGT	2	12	266879	266890	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156976237
69	NC_009784	ATTCAT	2	12	267995	268006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156976241
70	NC_009784	GTGAAG	2	12	268325	268336	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156976242
71	NC_009784	CAATTC	2	12	270026	270037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156976244
72	NC_009784	GGGAGC	2	12	270350	270361	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	156976244
73	NC_009784	ACTACA	2	12	270976	270987	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156976246
74	NC_009784	TCATCT	2	12	274522	274533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156976252
75	NC_009784	GCAAAC	2	12	277779	277790	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156976254
76	NC_009784	CAAAAG	2	12	281060	281071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156976259
77	NC_009784	CATGGC	2	12	288400	288411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976270
78	NC_009784	AAGCCA	2	12	290182	290193	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156976273
79	NC_009784	GAACGG	2	12	290934	290945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156976274
80	NC_009784	GCTTTG	2	12	297669	297680	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156976286
81	NC_009784	CTGTTC	2	12	301412	301423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156976295
82	NC_009784	AAGGTA	2	12	302735	302746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156976296
83	NC_009784	CTGTTC	2	12	308041	308052	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156976302
84	NC_009784	AAGGTA	2	12	309377	309388	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156976303
85	NC_009784	AAATGA	2	12	319776	319787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156976314
86	NC_009784	AAATGG	2	12	323536	323547	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156976317
87	NC_009784	ATCAGA	2	12	325355	325366	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156976318
88	NC_009784	GAACTG	2	12	325559	325570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156976318
89	NC_009784	CTTTAC	2	12	331408	331419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156976321
90	NC_009784	TTCATC	2	12	332686	332697	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156976322
91	NC_009784	TTACGC	2	12	337824	337835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976326
92	NC_009784	CCATTG	2	12	339234	339245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976327
93	NC_009784	AATGAA	2	12	340068	340079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156976329
94	NC_009784	CGGTTA	2	12	341999	342010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976331
95	NC_009784	TACCAC	2	12	346641	346652	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156976335
96	NC_009784	TAGGTA	2	12	347642	347653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156976338
97	NC_009784	AAAGCA	2	12	361531	361542	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156976350
98	NC_009784	GGCAAG	2	12	366995	367006	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156976355
99	NC_009784	TGGAAT	2	12	370195	370206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156976358
100	NC_009784	TGAGCC	2	12	371377	371388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976359
101	NC_009784	GAAGCG	2	12	372748	372759	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156976360
102	NC_009784	CCTATG	2	12	375789	375800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976363
103	NC_009784	TAACGG	2	12	376762	376773	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156976364
104	NC_009784	TGTTGC	17	102	384257	384358	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156976370
105	NC_009784	TATTGA	2	12	390120	390131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156976377
106	NC_009784	CAGTGC	2	12	392146	392157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976378
107	NC_009784	TGAACG	2	12	397030	397041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156976384
108	NC_009784	CGATGG	2	12	403831	403842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156976389
109	NC_009784	TACGGC	2	12	403939	403950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976389
110	NC_009784	ACGATT	2	12	405959	405970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156976389
111	NC_009784	TCGATA	2	12	406260	406271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156976389
112	NC_009784	GCAACG	2	12	410309	410320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156976389
113	NC_009784	TCGATA	2	12	413855	413866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156976390
114	NC_009784	TTTGGT	2	12	415981	415992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156976390
115	NC_009784	CGACAT	2	12	416007	416018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156976390
116	NC_009784	ATTTCG	2	12	417011	417022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156976391
117	NC_009784	GGCAGT	2	12	419063	419074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156976393
118	NC_009784	CGGATG	2	12	425811	425822	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156976397
119	NC_009784	ATATCG	2	12	426537	426548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156976397
120	NC_009784	GCGATT	2	12	430981	430992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976399
121	NC_009784	CGCAGT	2	12	444765	444776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156976415
122	NC_009784	TGCTTC	2	12	448671	448682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156976419
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138	NC_009784	CAGTAC	2	12	508452	508463	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156976486
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148	NC_009784	GACTTC	2	12	540683	540694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156976531
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182	NC_009784	AGCGTT	2	12	690463	690474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976703
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184	NC_009784	ATTGCG	2	12	695918	695929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156976708
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209	NC_009784	GTCAAT	2	12	780503	780514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156976802
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219	NC_009784	CATAAT	2	12	827348	827359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156976846
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221	NC_009784	ATACTT	2	12	830924	830935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156976848
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223	NC_009784	TGATGG	5	30	832296	832325	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156976848
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225	NC_009784	GAAAAA	2	12	835600	835611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156976848
226	NC_009784	TTTACT	2	12	836506	836517	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156976848
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228	NC_009784	ACGGTG	2	12	837844	837855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156976848
229	NC_009784	TTACCT	2	12	839268	839279	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156976850
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232	NC_009784	AAAGAT	2	12	853166	853177	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156976867
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324	NC_009784	CTTCGA	2	12	1294601	1294612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156977342
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330	NC_009784	CCAATA	2	12	1313917	1313928	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156977347
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332	NC_009784	CTTCCG	2	12	1320588	1320599	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	156977356
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335	NC_009784	CTTTTG	2	12	1332999	1333010	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156977367
336	NC_009784	GAACTG	2	12	1338069	1338080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156977375
337	NC_009784	CTCTGG	2	12	1343059	1343070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156977380
338	NC_009784	TTCCTC	2	12	1351193	1351204	0 %	50 %	0 %	50 %	156977384
339	NC_009784	CCAGAA	2	12	1351250	1351261	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156977384
340	NC_009784	CACACT	2	12	1367140	1367151	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156977399
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445	NC_009784	GTTGCC	2	12	1761346	1761357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156977826
446	NC_009784	ATCGAT	2	12	1763521	1763532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156977828
447	NC_009784	GAAGTC	2	12	1771866	1771877	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156977842
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