MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome II

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009784	CCTAC	2	10	1221	1230	20 %	20 %	0 %	60 %	156975953
2	NC_009784	TTGAG	2	10	2372	2381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009784	CTTTG	2	10	3478	3487	0 %	60 %	20 %	20 %	156975956
4	NC_009784	GCTTT	2	10	3681	3690	0 %	60 %	20 %	20 %	156975956
5	NC_009784	TCGGT	2	10	3785	3794	0 %	40 %	40 %	20 %	156975956
6	NC_009784	TGTAT	2	10	5368	5377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009784	CGTAA	2	10	6928	6937	40 %	20 %	20 %	20 %	156975962
8	NC_009784	AGTTT	2	10	8098	8107	20 %	60 %	20 %	0 %	156975963
9	NC_009784	CCTTT	2	10	8548	8557	0 %	60 %	0 %	40 %	156975964
10	NC_009784	AAAAG	2	10	8869	8878	80 %	0 %	20 %	0 %	156975964
11	NC_009784	GAAAA	2	10	9959	9968	80 %	0 %	20 %	0 %	156975967
12	NC_009784	CCTTG	2	10	11127	11136	0 %	40 %	20 %	40 %	156975969
13	NC_009784	TTTGA	2	10	12351	12360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009784	TTCGT	2	10	15422	15431	0 %	60 %	20 %	20 %	156975975
15	NC_009784	CAACC	2	10	21209	21218	40 %	0 %	0 %	60 %	156975981
16	NC_009784	GCAAT	2	10	22012	22021	40 %	20 %	20 %	20 %	156975982
17	NC_009784	CGTGG	2	10	24566	24575	0 %	20 %	60 %	20 %	156975984
18	NC_009784	CCAAC	2	10	25037	25046	40 %	0 %	0 %	60 %	156975985
19	NC_009784	AAGTT	2	10	25315	25324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009784	TGAAT	2	10	25952	25961	40 %	40 %	20 %	0 %	156975988
21	NC_009784	TGAAT	2	10	26278	26287	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009784	TGAAT	2	10	26892	26901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009784	TGAAT	2	10	27218	27227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009784	TGAAT	2	10	27544	27553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009784	GTGCC	2	10	29288	29297	0 %	20 %	40 %	40 %	156975991
26	NC_009784	TGCTT	2	10	29418	29427	0 %	60 %	20 %	20 %	156975991
27	NC_009784	TTTGA	2	10	30223	30232	20 %	60 %	20 %	0 %	156975992
28	NC_009784	AGCTG	2	10	30269	30278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009784	ATAAA	2	10	31043	31052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009784	GTAAA	2	10	31347	31356	60 %	20 %	20 %	0 %	156975994
31	NC_009784	CTAAA	2	10	31707	31716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009784	GCTGA	2	10	32688	32697	20 %	20 %	40 %	20 %	156975997
33	NC_009784	AATCC	2	10	33973	33982	40 %	20 %	0 %	40 %	156975998
34	NC_009784	CTTGT	2	10	34049	34058	0 %	60 %	20 %	20 %	156975998
35	NC_009784	AATTA	2	10	34377	34386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009784	GAGTA	2	10	37011	37020	40 %	20 %	40 %	0 %	156976000
37	NC_009784	GATTT	2	10	37479	37488	20 %	60 %	20 %	0 %	156976001
38	NC_009784	AGCTT	2	10	39537	39546	20 %	40 %	20 %	20 %	156976001
39	NC_009784	ACAAA	2	10	40562	40571	80 %	0 %	0 %	20 %	156976003
40	NC_009784	ATCAA	2	10	40851	40860	60 %	20 %	0 %	20 %	156976003
41	NC_009784	GTTCA	2	10	45365	45374	20 %	40 %	20 %	20 %	156976011
42	NC_009784	GTTGA	2	10	45440	45449	20 %	40 %	40 %	0 %	156976011
43	NC_009784	GTTCA	2	10	47696	47705	20 %	40 %	20 %	20 %	156976014
44	NC_009784	TCAAA	2	10	52857	52866	60 %	20 %	0 %	20 %	156976017
45	NC_009784	AGCAC	2	10	53031	53040	40 %	0 %	20 %	40 %	156976017
46	NC_009784	TTGGT	2	10	54349	54358	0 %	60 %	40 %	0 %	156976020
47	NC_009784	CTTTT	2	10	55965	55974	0 %	80 %	0 %	20 %	156976023
48	NC_009784	TTTAC	2	10	56022	56031	20 %	60 %	0 %	20 %	156976023
49	NC_009784	CTTTC	2	10	56551	56560	0 %	60 %	0 %	40 %	156976024
50	NC_009784	TTGGC	2	10	58574	58583	0 %	40 %	40 %	20 %	156976024
51	NC_009784	TCCGT	2	10	58952	58961	0 %	40 %	20 %	40 %	156976024
52	NC_009784	CTGGC	2	10	60036	60045	0 %	20 %	40 %	40 %	156976026
53	NC_009784	CTGAA	2	10	62239	62248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009784	TTCTT	2	10	63803	63812	0 %	80 %	0 %	20 %	156976031
55	NC_009784	TCTTT	2	10	63912	63921	0 %	80 %	0 %	20 %	156976031
56	NC_009784	AGCTC	2	10	64956	64965	20 %	20 %	20 %	40 %	156976033
57	NC_009784	TTTGC	2	10	65335	65344	0 %	60 %	20 %	20 %	156976033
58	NC_009784	TGTCT	2	10	65607	65616	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009784	TTGAA	2	10	66755	66764	40 %	40 %	20 %	0 %	156976035
60	NC_009784	AACAG	2	10	68208	68217	60 %	0 %	20 %	20 %	156976037
61	NC_009784	GAGCA	2	10	70604	70613	40 %	0 %	40 %	20 %	156976039
62	NC_009784	AAATG	2	10	70726	70735	60 %	20 %	20 %	0 %	156976039
63	NC_009784	TGGCA	2	10	70774	70783	20 %	20 %	40 %	20 %	156976039
64	NC_009784	AACCA	2	10	71305	71314	60 %	0 %	0 %	40 %	156976039
65	NC_009784	GGTTT	2	10	71872	71881	0 %	60 %	40 %	0 %	156976040
66	NC_009784	TCACT	2	10	80259	80268	20 %	40 %	0 %	40 %	156976047
67	NC_009784	TGGAT	2	10	80957	80966	20 %	40 %	40 %	0 %	156976047
68	NC_009784	CATTA	2	10	82034	82043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009784	AAACC	2	10	82116	82125	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009784	TTGGT	2	10	82343	82352	0 %	60 %	40 %	0 %	156976050
71	NC_009784	TAAGT	2	10	83285	83294	40 %	40 %	20 %	0 %	156976050
72	NC_009784	AATTA	2	10	84249	84258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009784	GGGAA	2	10	84548	84557	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009784	TTACG	2	10	85261	85270	20 %	40 %	20 %	20 %	156976051
75	NC_009784	AGCAA	2	10	87904	87913	60 %	0 %	20 %	20 %	156976054
76	NC_009784	CCAAG	2	10	89399	89408	40 %	0 %	20 %	40 %	156976055
77	NC_009784	AATGG	2	10	89805	89814	40 %	20 %	40 %	0 %	156976057
78	NC_009784	CCAAA	2	10	90200	90209	60 %	0 %	0 %	40 %	156976057
79	NC_009784	AGTTT	2	10	93015	93024	20 %	60 %	20 %	0 %	156976058
80	NC_009784	ATTGA	2	10	95483	95492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009784	ATTTT	2	10	98556	98565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009784	GAAAG	2	10	98658	98667	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009784	AAGGG	2	10	102577	102586	40 %	0 %	60 %	0 %	156976065
84	NC_009784	TCATC	2	10	103910	103919	20 %	40 %	0 %	40 %	156976067
85	NC_009784	GGTTA	2	10	103926	103935	20 %	40 %	40 %	0 %	156976067
86	NC_009784	GCTTT	2	10	107970	107979	0 %	60 %	20 %	20 %	156976071
87	NC_009784	GAGCT	2	10	109213	109222	20 %	20 %	40 %	20 %	156976073
88	NC_009784	GATGT	2	10	109959	109968	20 %	40 %	40 %	0 %	156976074
89	NC_009784	ATCGC	2	10	110415	110424	20 %	20 %	20 %	40 %	156976074
90	NC_009784	CAATC	2	10	111689	111698	40 %	20 %	0 %	40 %	156976077
91	NC_009784	TCACT	2	10	117660	117669	20 %	40 %	0 %	40 %	156976079
92	NC_009784	CATCG	2	10	118150	118159	20 %	20 %	20 %	40 %	156976079
93	NC_009784	TACAA	2	10	120550	120559	60 %	20 %	0 %	20 %	156976080
94	NC_009784	ACGCA	2	10	120767	120776	40 %	0 %	20 %	40 %	156976080
95	NC_009784	TACCT	2	10	120820	120829	20 %	40 %	0 %	40 %	156976080
96	NC_009784	ATTGG	2	10	121001	121010	20 %	40 %	40 %	0 %	156976080
97	NC_009784	ACGCT	2	10	123192	123201	20 %	20 %	20 %	40 %	156976082
98	NC_009784	TGACC	2	10	123971	123980	20 %	20 %	20 %	40 %	156976084
99	NC_009784	ACCAA	2	10	127688	127697	60 %	0 %	0 %	40 %	156976088
100	NC_009784	CTTCT	2	10	129975	129984	0 %	60 %	0 %	40 %	156976090
101	NC_009784	TCGGT	2	10	130202	130211	0 %	40 %	40 %	20 %	156976091
102	NC_009784	TAAAT	2	10	130565	130574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009784	TGGAT	2	10	130692	130701	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009784	ATAAA	2	10	130774	130783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009784	TGTTC	2	10	130869	130878	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009784	GCGGT	2	10	131882	131891	0 %	20 %	60 %	20 %	156976093
107	NC_009784	TGGAT	2	10	132554	132563	20 %	40 %	40 %	0 %	156976094
108	NC_009784	CAATG	2	10	132756	132765	40 %	20 %	20 %	20 %	156976094
109	NC_009784	GCCGT	2	10	134305	134314	0 %	20 %	40 %	40 %	156976096
110	NC_009784	TCAGA	2	10	134684	134693	40 %	20 %	20 %	20 %	156976096
111	NC_009784	TAAAT	2	10	139842	139851	60 %	40 %	0 %	0 %	156976101
112	NC_009784	CCAAA	2	10	140446	140455	60 %	0 %	0 %	40 %	156976101
113	NC_009784	TCCTT	2	10	141144	141153	0 %	60 %	0 %	40 %	156976101
114	NC_009784	TGCTT	2	10	143748	143757	0 %	60 %	20 %	20 %	156976104
115	NC_009784	TGCCA	2	10	144501	144510	20 %	20 %	20 %	40 %	156976104
116	NC_009784	CATGG	2	10	145747	145756	20 %	20 %	40 %	20 %	156976105
117	NC_009784	ATCGT	2	10	148998	149007	20 %	40 %	20 %	20 %	156976109
118	NC_009784	GCTTG	2	10	150738	150747	0 %	40 %	40 %	20 %	156976110
119	NC_009784	TTTAT	2	10	151974	151983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009784	ATTTG	2	10	152144	152153	20 %	60 %	20 %	0 %	156976112
121	NC_009784	GGCTT	2	10	155529	155538	0 %	40 %	40 %	20 %	156976117
122	NC_009784	TTCAT	2	10	156248	156257	20 %	60 %	0 %	20 %	156976117
123	NC_009784	TAATA	2	10	156966	156975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009784	CTAAC	2	10	164336	164345	40 %	20 %	0 %	40 %	156976125
125	NC_009784	CAGGT	2	10	165617	165626	20 %	20 %	40 %	20 %	156976126
126	NC_009784	AATCC	2	10	168440	168449	40 %	20 %	0 %	40 %	156976128
127	NC_009784	TAAGC	2	10	169423	169432	40 %	20 %	20 %	20 %	156976129
128	NC_009784	CATTT	2	10	170450	170459	20 %	60 %	0 %	20 %	156976130
129	NC_009784	AAGCG	2	10	172321	172330	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009784	GATGC	2	10	173782	173791	20 %	20 %	40 %	20 %	156976135
131	NC_009784	ATTTC	2	10	173951	173960	20 %	60 %	0 %	20 %	156976136
132	NC_009784	TTGTT	2	10	175076	175085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009784	TTCAA	2	10	177313	177322	40 %	40 %	0 %	20 %	156976141
134	NC_009784	CGAGT	2	10	177880	177889	20 %	20 %	40 %	20 %	156976142
135	NC_009784	TGCCA	2	10	185702	185711	20 %	20 %	20 %	40 %	156976150
136	NC_009784	TAAGA	2	10	185783	185792	60 %	20 %	20 %	0 %	156976150
137	NC_009784	ACTAA	2	10	188298	188307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009784	GCGGT	2	10	189263	189272	0 %	20 %	60 %	20 %	156976151
139	NC_009784	AAAAC	2	10	189860	189869	80 %	0 %	0 %	20 %	156976151
140	NC_009784	AATTC	2	10	190083	190092	40 %	40 %	0 %	20 %	156976151
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142	NC_009784	ATCGC	2	10	192080	192089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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149	NC_009784	TGTGT	2	10	204246	204255	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_009784	TTTTG	2	10	341639	341648	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009784	CGGCA	2	10	343108	343117	20 %	0 %	40 %	40 %	156976333
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250	NC_009784	AGCAA	2	10	354008	354017	60 %	0 %	20 %	20 %	156976343
251	NC_009784	CGAAA	2	10	355547	355556	60 %	0 %	20 %	20 %	156976344
252	NC_009784	AGTTG	2	10	356251	356260	20 %	40 %	40 %	0 %	156976344
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254	NC_009784	CTCGC	2	10	358886	358895	0 %	20 %	20 %	60 %	156976348
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261	NC_009784	GTGCA	2	10	368439	368448	20 %	20 %	40 %	20 %	156976356
262	NC_009784	TGGTT	2	10	375106	375115	0 %	60 %	40 %	0 %	156976363
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265	NC_009784	ATGCA	2	10	380493	380502	40 %	20 %	20 %	20 %	156976368
266	NC_009784	GAACC	2	10	381637	381646	40 %	0 %	20 %	40 %	156976368
267	NC_009784	AGTAC	2	10	387083	387092	40 %	20 %	20 %	20 %	156976372
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