MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome II

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009784	TTGAG	2	10	2372	2381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009784	TGTAT	2	10	5368	5377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009784	TTTGA	2	10	12351	12360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009784	AAGTT	2	10	25315	25324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009784	TGAAT	2	10	26278	26287	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009784	TGAAT	2	10	26892	26901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009784	TGAAT	2	10	27218	27227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009784	TGAAT	2	10	27544	27553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009784	AGCTG	2	10	30269	30278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009784	ATAAA	2	10	31043	31052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009784	CTAAA	2	10	31707	31716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009784	AATTA	2	10	34377	34386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009784	CTGAA	2	10	62239	62248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009784	TGTCT	2	10	65607	65616	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009784	CATTA	2	10	82034	82043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009784	AAACC	2	10	82116	82125	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009784	AATTA	2	10	84249	84258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009784	GGGAA	2	10	84548	84557	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009784	ATTGA	2	10	95483	95492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009784	ATTTT	2	10	98556	98565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009784	GAAAG	2	10	98658	98667	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009784	TAAAT	2	10	130565	130574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009784	TGGAT	2	10	130692	130701	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009784	ATAAA	2	10	130774	130783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009784	TGTTC	2	10	130869	130878	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009784	TTTAT	2	10	151974	151983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009784	TAATA	2	10	156966	156975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009784	AAGCG	2	10	172321	172330	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009784	TTGTT	2	10	175076	175085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009784	ACTAA	2	10	188298	188307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009784	ATCGC	2	10	192080	192089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009784	CGAAA	2	10	194153	194162	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009784	GCGCT	2	10	202278	202287	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009784	TTAAA	2	10	203524	203533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009784	TGTGT	2	10	204246	204255	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009784	GTTTG	2	10	218070	218079	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009784	AAACT	2	10	225320	225329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009784	ATTCG	2	10	243373	243382	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009784	CAAAT	2	10	249375	249384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009784	TACAC	2	10	256283	256292	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009784	TTGTT	2	10	271142	271151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009784	AATTA	2	10	298479	298488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009784	TATAT	2	10	313304	313313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009784	TGGTG	2	10	318553	318562	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009784	AAAAC	2	10	328155	328164	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009784	ACAAA	2	10	337492	337501	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009784	AGAAA	2	10	340782	340791	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009784	TTTTG	2	10	341639	341648	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009784	ATTTT	2	10	357398	357407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009784	ATAGA	2	10	391912	391921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009784	CTCTA	2	10	393154	393163	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009784	AATTA	2	10	424241	424250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009784	ATCTT	2	10	424264	424273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009784	CGTGC	2	10	436397	436406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009784	AAACA	2	10	436441	436450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009784	AATCG	2	10	452396	452405	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009784	TATCC	2	10	456049	456058	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009784	GTGAA	2	10	474624	474633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009784	AAGAC	2	10	479689	479698	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009784	AAAAG	2	10	480784	480793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009784	CAAAA	2	10	486504	486513	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009784	TGAAT	2	10	487350	487359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009784	TATGT	2	10	490131	490140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009784	ATACA	2	10	490482	490491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009784	CTAAT	2	10	500533	500542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009784	GATTG	2	10	504687	504696	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009784	ACAAA	2	10	532748	532757	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009784	CAAAA	2	10	538059	538068	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009784	AAAAC	2	10	542346	542355	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009784	CGCCC	2	10	545951	545960	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_009784	AAAGA	2	10	548699	548708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009784	TTTAT	2	10	551646	551655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009784	GAAAA	2	10	558370	558379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009784	GACGA	2	10	569345	569354	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009784	GTTTT	2	10	589744	589753	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009784	TGATT	2	10	594564	594573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009784	AAAAG	2	10	617904	617913	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009784	TATCA	2	10	619587	619596	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009784	TTTTG	2	10	638888	638897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009784	CTAAA	2	10	640883	640892	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009784	TGAAG	2	10	643690	643699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009784	AACAA	2	10	659301	659310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009784	ACCGA	2	10	674035	674044	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009784	CTGAA	2	10	676084	676093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009784	TTCAG	2	10	683143	683152	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009784	GATCA	2	10	720147	720156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009784	TTTTA	2	10	722724	722733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009784	TGAAT	2	10	723385	723394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009784	TTTTA	2	10	728056	728065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009784	TCAAA	2	10	743503	743512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009784	ACTAA	2	10	753455	753464	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009784	AATTG	2	10	776723	776732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009784	CTCAA	2	10	777178	777187	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009784	GAAAA	2	10	777217	777226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009784	TAACA	2	10	803976	803985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009784	TGAAA	2	10	808119	808128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009784	CCTTT	2	10	809397	809406	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009784	TTTCG	2	10	809425	809434	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009784	GGTTA	2	10	814192	814201	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009784	TCGAA	2	10	827807	827816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009784	TAAAA	2	10	828935	828944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009784	AAACG	2	10	842448	842457	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009784	TAAGT	2	10	849771	849780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009784	TAAAA	2	10	851936	851945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009784	AAGGA	2	10	853419	853428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009784	CTCTT	2	10	853926	853935	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009784	GATCA	2	10	868864	868873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009784	TTAAA	2	10	875445	875454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009784	AGAAC	2	10	876595	876604	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009784	GTTGA	2	10	877187	877196	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009784	ATTTT	2	10	884743	884752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009784	AATCG	2	10	886733	886742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009784	AAGGA	2	10	889198	889207	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009784	GTTAA	2	10	895210	895219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009784	AAAAG	2	10	897118	897127	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009784	TTTTG	2	10	899481	899490	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009784	TAAGT	2	10	900671	900680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009784	AAATA	2	10	907176	907185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009784	TTTGG	2	10	908755	908764	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009784	ACAAT	2	10	908894	908903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009784	TTTTC	2	10	917037	917046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009784	GATCA	2	10	924943	924952	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009784	TAAGG	2	10	932218	932227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009784	TAGAG	2	10	934868	934877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009784	TAACT	2	10	947016	947025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009784	AATTA	2	10	947070	947079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009784	TGAAA	2	10	957871	957880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009784	TAAAA	2	10	986814	986823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009784	ACATT	2	10	1003642	1003651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009784	AACTA	2	10	1007506	1007515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009784	ACTCA	2	10	1014357	1014366	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009784	TGTCT	2	10	1023568	1023577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009784	AACAA	2	10	1024790	1024799	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009784	TCGTG	2	10	1028670	1028679	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009784	TTAAT	2	10	1040833	1040842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009784	TACAA	2	10	1062015	1062024	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009784	TGATG	2	10	1075035	1075044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009784	CTTTT	2	10	1076805	1076814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009784	TTCTG	2	10	1077238	1077247	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009784	CTTTT	2	10	1088651	1088660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009784	GAGCT	2	10	1094581	1094590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009784	TTTGT	2	10	1102060	1102069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009784	TCATT	2	10	1105683	1105692	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009784	TTTCT	2	10	1120974	1120983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009784	CAATT	2	10	1123049	1123058	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009784	ACAAA	2	10	1123087	1123096	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009784	TTTTG	2	10	1127223	1127232	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_009784	AGCCA	2	10	2193678	2193687	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.