MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 1191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009783	TACGTC	2	12	3817	3828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972384
2	NC_009783	CTTCAC	2	12	5957	5968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156972385
3	NC_009783	TTTGAT	2	12	10105	10116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156972391
4	NC_009783	CTTGCT	2	12	13120	13131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156972395
5	NC_009783	GCTTTT	2	12	26830	26841	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156972409
6	NC_009783	GTCTTT	2	12	27410	27421	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156972409
7	NC_009783	TGCTCT	2	12	29031	29042	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156972412
8	NC_009783	GGTTCT	2	12	31963	31974	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156972414
9	NC_009783	GCTTTT	2	12	40589	40600	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156972421
10	NC_009783	CGGCAA	2	12	41121	41132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972422
11	NC_009783	ACTCTG	2	12	45841	45852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972425
12	NC_009783	ACCAAG	2	12	54339	54350	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156972431
13	NC_009783	TACGAA	2	12	57741	57752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156972435
14	NC_009783	GACCGC	2	12	57803	57814	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156972435
15	NC_009783	TGCTCC	2	12	59164	59175	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	156972435
16	NC_009783	AACCGC	2	12	65785	65796	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156972446
17	NC_009783	TACCGT	2	12	79468	79479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972459
18	NC_009783	CATCAG	2	12	81325	81336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972461
19	NC_009783	AGTCGT	2	12	82963	82974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156972461
20	NC_009783	CCAATA	2	12	87138	87149	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156972464
21	NC_009783	TTTCGC	2	12	90218	90229	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156972466
22	NC_009783	TACCTT	2	12	94086	94097	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156972469
23	NC_009783	TCGATT	2	12	95696	95707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156972472
24	NC_009783	ACCGCC	2	12	96591	96602	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	156972472
25	NC_009783	ATATCA	2	12	101470	101481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156972476
26	NC_009783	ACAGAA	2	12	101962	101973	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156972477
27	NC_009783	GGTTAA	2	12	102665	102676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972477
28	NC_009783	AATTCT	2	12	103539	103550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156972478
29	NC_009783	TTACCA	2	12	104640	104651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972479
30	NC_009783	CCTGGA	2	12	113556	113567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156972485
31	NC_009783	GATTGC	2	12	115814	115825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156972487
32	NC_009783	GTAACC	2	12	120297	120308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972489
33	NC_009783	CTAGAC	2	12	121600	121611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972491
34	NC_009783	AGCTTA	2	12	125635	125646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972495
35	NC_009783	AACCGT	2	12	125819	125830	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972495
36	NC_009783	AAACCA	2	12	127378	127389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972497
37	NC_009783	TGGGAA	2	12	127545	127556	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156972498
38	NC_009783	CCAATT	2	12	129998	130009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972499
39	NC_009783	GTACTC	2	12	132045	132056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972502
40	NC_009783	CCGCTA	2	12	133652	133663	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156972504
41	NC_009783	CTCTTT	2	12	133665	133676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972504
42	NC_009783	ATCTGT	2	12	135154	135165	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156972505
43	NC_009783	TTTTCA	2	12	137871	137882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156972508
44	NC_009783	ACTTCC	2	12	144670	144681	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156972513
45	NC_009783	ATACCA	2	12	145546	145557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156972514
46	NC_009783	AGGCTT	2	12	150242	150253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156972518
47	NC_009783	AGAGAA	2	12	151392	151403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156972520
48	NC_009783	TGAACA	2	12	153018	153029	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156972522
49	NC_009783	ATGGGT	2	12	156897	156908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156972524
50	NC_009783	TGCTAT	2	12	158803	158814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156972526
51	NC_009783	AGAACA	2	12	158849	158860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156972526
52	NC_009783	AGGCGT	2	12	160078	160089	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156972528
53	NC_009783	GTATCA	2	12	161139	161150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972528
54	NC_009783	ATCAGA	2	12	166616	166627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156972532
55	NC_009783	ATCGCC	2	12	166958	166969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156972532
56	NC_009783	GCACCA	2	12	175734	175745	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156972540
57	NC_009783	AGCATG	2	12	178374	178385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972542
58	NC_009783	TTACCT	2	12	181581	181592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156972547
59	NC_009783	GAACAG	2	12	182918	182929	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156972548
60	NC_009783	GCTTAC	2	12	183814	183825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972550
61	NC_009783	CAAAGC	2	12	184239	184250	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156972550
62	NC_009783	TGAAGT	2	12	203507	203518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972565
63	NC_009783	GATAAG	2	12	205700	205711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156972566
64	NC_009783	ACATCG	2	12	209703	209714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972570
65	NC_009783	GACCAT	2	12	214303	214314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972574
66	NC_009783	CGATGA	2	12	214723	214734	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972574
67	NC_009783	AGTCAT	2	12	219700	219711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972581
68	NC_009783	ACGTAG	2	12	222542	222553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972584
69	NC_009783	CACGAC	2	12	225268	225279	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156972584
70	NC_009783	CATGTA	2	12	226653	226664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972585
71	NC_009783	GAAACC	2	12	236872	236883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156972594
72	NC_009783	ATAAGT	2	12	237712	237723	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156972596
73	NC_009783	TCGCCC	2	12	237758	237769	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	156972596
74	NC_009783	GGTAAC	2	12	254591	254602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972610
75	NC_009783	ACGTTC	2	12	255500	255511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972612
76	NC_009783	ATCTAA	2	12	255593	255604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156972612
77	NC_009783	AAAAGC	2	12	261744	261755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156972617
78	NC_009783	AAAGAG	2	12	262621	262632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156972617
79	NC_009783	ATCACA	2	12	265721	265732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156972620
80	NC_009783	CACAAA	2	12	266041	266052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972620
81	NC_009783	AGTTTC	2	12	269350	269361	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156972625
82	NC_009783	TTCTTG	2	12	272949	272960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156972628
83	NC_009783	CTTCTG	8	48	272990	273037	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156972628
84	NC_009783	GAATAA	2	12	279374	279385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156972639
85	NC_009783	CACTGC	2	12	279833	279844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156972639
86	NC_009783	TGCACG	2	12	284509	284520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156972644
87	NC_009783	AGAAAA	2	12	287640	287651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156972648
88	NC_009783	AAGTTA	2	12	300166	300177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156972661
89	NC_009783	ATCCCA	2	12	301503	301514	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156972661
90	NC_009783	CAAGGT	2	12	306186	306197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972665
91	NC_009783	AGTTCA	2	12	317840	317851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972674
92	NC_009783	TACACA	2	12	318170	318181	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156972675
93	NC_009783	TTCCAA	2	12	332566	332577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972688
94	NC_009783	TGCCAA	2	12	335156	335167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972690
95	NC_009783	GTTGGA	2	12	341395	341406	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156972694
96	NC_009783	CTTCCA	2	12	341701	341712	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156972694
97	NC_009783	ATGTTT	2	12	341900	341911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156972694
98	NC_009783	GCCATC	2	12	344389	344400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156972699
99	NC_009783	GATATC	2	12	345631	345642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972698
100	NC_009783	TACGAT	2	12	347697	347708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972701
101	NC_009783	CGTCAT	2	12	351056	351067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972705
102	NC_009783	CAACCA	2	12	351068	351079	50 %	0 %	0 %	50 %	156972705
103	NC_009783	GCCACC	2	12	367940	367951	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	156972718
104	NC_009783	TTGACG	2	12	370113	370124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156972721
105	NC_009783	CGATGC	2	12	371427	371438	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156972723
106	NC_009783	AAGCTC	2	12	371696	371707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972724
107	NC_009783	AAGCGT	2	12	374418	374429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972726
108	NC_009783	AGTACG	2	12	381298	381309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156972733
109	NC_009783	CATTGA	2	12	400591	400602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156972751
110	NC_009783	GGCTCA	2	12	406740	406751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156972757
111	NC_009783	CTGCTT	2	12	407659	407670	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156972758
112	NC_009783	AGCCAT	2	12	410738	410749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972763
113	NC_009783	GCGCTT	2	12	412230	412241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972765
114	NC_009783	ATCGCT	2	12	412289	412300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972765
115	NC_009783	CTTTCT	2	12	418885	418896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972771
116	NC_009783	CGCAAA	2	12	424819	424830	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156972777
117	NC_009783	TCGCTC	2	12	424981	424992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	156972777
118	NC_009783	CTCGTC	2	12	424998	425009	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	156972777
119	NC_009783	CCGTAA	2	12	428765	428776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972780
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121	NC_009783	TTCGCT	2	12	434411	434422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156972784
122	NC_009783	TCAAGC	2	12	436161	436172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156972785
123	NC_009783	TTTACC	2	12	442464	442475	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156972793
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126	NC_009783	CAGCGT	2	12	471610	471621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156972815
127	NC_009783	GTTCGC	2	12	472921	472932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972816
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132	NC_009783	CTGTTT	2	12	480604	480615	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156972822
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221	NC_009783	CGTCAA	2	12	758762	758773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156973100
222	NC_009783	CGGGTG	2	12	760078	760089	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	156973100
223	NC_009783	ACTTTG	2	12	762495	762506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156973101
224	NC_009783	ACATCA	2	12	763380	763391	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156973101
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226	NC_009783	AAGTGG	2	12	771431	771442	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156973109
227	NC_009783	TCAGCG	2	12	773686	773697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156973111
228	NC_009783	GCGGCA	2	12	775245	775256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156973113
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327	NC_009783	CTGAGT	2	12	1091369	1091380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156973394
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330	NC_009783	GCAATA	2	12	1096026	1096037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156973397
331	NC_009783	CTGTTC	2	12	1111041	1111052	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156973413
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333	NC_009783	AATACC	2	12	1115721	1115732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156973416
334	NC_009783	CCAGCA	2	12	1117548	1117559	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156973417
335	NC_009783	TGAGCT	2	12	1122951	1122962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156973422
336	NC_009783	GATATC	2	12	1124383	1124394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156973422
337	NC_009783	TGAGAT	2	12	1128420	1128431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156973426
338	NC_009783	CTAGCC	2	12	1129795	1129806	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156973426
339	NC_009783	TTGGTG	2	12	1131117	1131128	0 %	50 %	50 %	0 %	156973427
340	NC_009783	GGTTAA	2	12	1131433	1131444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156973427
341	NC_009783	GACTTC	2	12	1134996	1135007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156973430
342	NC_009783	AAAGCG	2	12	1136073	1136084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156973430
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440	NC_009783	ATCACC	2	12	1461205	1461216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156973736
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443	NC_009783	GCTTTT	2	12	1468650	1468661	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156973743
444	NC_009783	CTGTTC	2	12	1474751	1474762	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156973750
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449	NC_009783	GAAGTT	2	12	1490303	1490314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156973771
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