MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 453

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009783	TCCGA	2	10	67	76	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009783	ACTAC	2	10	912	921	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009783	CTTTG	2	10	1733	1742	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009783	TCCAA	2	10	8976	8985	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009783	CTTTT	2	10	10322	10331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009783	TCTTA	2	10	39517	39526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009783	TTCTT	2	10	90585	90594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009783	AAAGA	2	10	105508	105517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009783	GAAGT	2	10	120636	120645	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009783	AATTG	2	10	120656	120665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009783	CTAAC	2	10	143875	143884	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009783	TTTTG	2	10	176394	176403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009783	AAGAG	2	10	178480	178489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009783	TCGGT	2	10	193222	193231	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009783	TTCGC	2	10	193769	193778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009783	GGGAA	2	10	194354	194363	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009783	ACTAC	2	10	195624	195633	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009783	TCGGT	2	10	198843	198852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009783	TTCGC	2	10	199390	199399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009783	GGGAA	2	10	199975	199984	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009783	ACTAC	2	10	201245	201254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009783	CTGAT	2	10	202278	202287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009783	CAAGA	2	10	206493	206502	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009783	TTAAA	2	10	208638	208647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009783	CTTTG	2	10	220933	220942	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009783	GATCA	2	10	220967	220976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009783	AAGCG	2	10	221908	221917	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009783	CTTTT	2	10	221985	221994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009783	TTCTT	2	10	242804	242813	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009783	GCGGA	2	10	243161	243170	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009783	TCGGT	2	10	245671	245680	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009783	TTCGC	2	10	246218	246227	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009783	CTTTA	2	10	247008	247017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009783	CGTAT	2	10	247093	247102	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009783	ACTAC	2	10	248182	248191	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009783	GAAAA	2	10	260086	260095	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009783	TTTCC	2	10	261210	261219	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009783	AGGTT	2	10	261251	261260	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009783	TTAGA	2	10	269313	269322	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009783	AATCT	2	10	273357	273366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009783	TAAAA	2	10	276706	276715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009783	AAGTT	2	10	276800	276809	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009783	TAAAA	2	10	276998	277007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009783	GATCA	2	10	282006	282015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009783	CCACA	2	10	294846	294855	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_009783	AAAGC	2	10	307363	307372	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009783	TCGGT	2	10	314006	314015	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009783	TTCGC	2	10	314553	314562	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009783	GGGAA	2	10	315137	315146	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009783	ACTAC	2	10	316370	316379	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009783	AAAAC	2	10	322792	322801	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009783	GTTTG	2	10	328898	328907	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009783	TAAAG	2	10	340987	340996	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009783	GCGGA	2	10	359455	359464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009783	TCGGT	2	10	361967	361976	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009783	TTCGC	2	10	362514	362523	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009783	ACTAC	2	10	364442	364451	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009783	CTTTA	2	10	375528	375537	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009783	CAAAA	2	10	382010	382019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009783	GAAAA	2	10	422518	422527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009783	ACCTT	2	10	432256	432265	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009783	ATTTA	2	10	442730	442739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009783	GTAGT	2	10	450068	450077	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009783	TAAAG	2	10	451242	451251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009783	ACAAA	2	10	451715	451724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009783	AGCGA	2	10	452066	452075	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009783	TCCGC	2	10	455096	455105	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_009783	TTGAG	2	10	468811	468820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009783	GATCA	2	10	478307	478316	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009783	TTATC	2	10	489337	489346	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009783	AAAAG	2	10	490314	490323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009783	AAAAG	2	10	491849	491858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009783	CACAA	2	10	494461	494470	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009783	ATTAT	2	10	497401	497410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009783	AATAA	2	10	497696	497705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009783	GATAA	2	10	497717	497726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009783	TTAGC	2	10	498674	498683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009783	TTCAG	2	10	498760	498769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009783	TGGGT	2	10	509752	509761	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009783	GAGCT	2	10	532319	532328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009783	CTTTT	2	10	557509	557518	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009783	TCAGT	2	10	557754	557763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009783	GCGAG	2	10	571981	571990	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009783	ATTTG	2	10	578633	578642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009783	ATAAG	2	10	600217	600226	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009783	AATAG	2	10	613052	613061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009783	CGCTT	2	10	615325	615334	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_009783	GAATC	2	10	615426	615435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009783	AAGTT	2	10	627825	627834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009783	CTAAT	2	10	635127	635136	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009783	ACTTT	2	10	659173	659182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009783	AATTA	2	10	676748	676757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009783	ATTTG	2	10	688198	688207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009783	TTTTG	2	10	700309	700318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009783	GGGTA	2	10	701247	701256	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009783	TTTTA	2	10	703763	703772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009783	CAATG	2	10	712933	712942	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009783	TGAGT	2	10	714509	714518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009783	TGAAG	2	10	714686	714695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009783	CTAGT	2	10	721169	721178	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009783	GTGTG	2	10	721256	721265	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009783	CCCGA	2	10	727062	727071	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_009783	CTGAA	2	10	738335	738344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009783	TATAA	2	10	756533	756542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009783	TTTAG	2	10	757676	757685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009783	TCCAA	2	10	778488	778497	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009783	AGCTC	2	10	780912	780921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009783	AGCTC	2	10	782351	782360	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009783	AGGTG	2	10	801701	801710	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009783	GACGG	2	10	825836	825845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009783	CTTGT	2	10	829791	829800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009783	AAATT	2	10	837840	837849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009783	AACCA	2	10	840514	840523	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009783	AACCA	2	10	849245	849254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009783	CTTGG	2	10	860756	860765	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009783	AAGCA	2	10	870649	870658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009783	CGCTT	2	10	884016	884025	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009783	ACTTT	2	10	884276	884285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009783	CGAAA	2	10	906027	906036	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009783	AAATG	2	10	906949	906958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009783	TGAGA	2	10	915053	915062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009783	TGGTT	2	10	941849	941858	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009783	CAGGG	2	10	949661	949670	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009783	TAGGA	2	10	949846	949855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009783	AAGTT	2	10	954709	954718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009783	GATCA	2	10	956189	956198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009783	ATTCT	2	10	965267	965276	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009783	GTCTA	2	10	972631	972640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009783	AGCGT	2	10	980293	980302	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009783	TGATT	2	10	981719	981728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009783	TTTTG	2	10	981733	981742	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009783	ATATT	2	10	981805	981814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009783	AACCT	2	10	994075	994084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009783	GTTGG	2	10	1005519	1005528	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009783	AAAAC	2	10	1014372	1014381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009783	GTAGT	2	10	1020711	1020720	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009783	ACAAA	2	10	1022210	1022219	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009783	AGCGA	2	10	1022561	1022570	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009783	TCCGC	2	10	1025624	1025633	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_009783	AATTG	2	10	1032106	1032115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009783	TAATT	2	10	1049593	1049602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009783	CGAAG	2	10	1049791	1049800	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009783	GATTG	2	10	1084584	1084593	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009783	TATTG	2	10	1091066	1091075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009783	AAAAG	2	10	1093590	1093599	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009783	CTGAA	2	10	1094012	1094021	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.