MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3

Total Repeats: 2564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009782	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	156978332
2	NC_009782	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	156978333
3	NC_009782	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	156978333
4	NC_009782	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	156978333
5	NC_009782	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	156978336
6	NC_009782	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009782	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	156978337
8	NC_009782	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	156978338
9	NC_009782	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	156978339
10	NC_009782	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009782	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	156978342
12	NC_009782	GCAAG	2	10	16625	16634	40 %	0 %	40 %	20 %	156978343
13	NC_009782	TTTGA	2	10	16784	16793	20 %	60 %	20 %	0 %	156978343
14	NC_009782	TCAAT	2	10	18921	18930	40 %	40 %	0 %	20 %	156978345
15	NC_009782	AGTTA	2	10	22099	22108	40 %	40 %	20 %	0 %	156978347
16	NC_009782	ATGTA	2	10	23657	23666	40 %	40 %	20 %	0 %	156978348
17	NC_009782	TCGAT	2	10	23821	23830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009782	ATATT	2	10	24358	24367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009782	ACCAA	2	10	26267	26276	60 %	0 %	0 %	40 %	156978350
20	NC_009782	ATCAA	2	10	26979	26988	60 %	20 %	0 %	20 %	156978350
21	NC_009782	GAAAC	2	10	27600	27609	60 %	0 %	20 %	20 %	156978351
22	NC_009782	GAAGT	2	10	27750	27759	40 %	20 %	40 %	0 %	156978351
23	NC_009782	ATTAT	2	10	29393	29402	40 %	60 %	0 %	0 %	156978352
24	NC_009782	AACGA	2	10	29466	29475	60 %	0 %	20 %	20 %	156978352
25	NC_009782	AAACG	2	10	31312	31321	60 %	0 %	20 %	20 %	156978354
26	NC_009782	AAGGT	2	10	32484	32493	40 %	20 %	40 %	0 %	156978354
27	NC_009782	TATGA	2	10	32681	32690	40 %	40 %	20 %	0 %	156978354
28	NC_009782	CATTA	2	10	33911	33920	40 %	40 %	0 %	20 %	156978355
29	NC_009782	TTTCA	2	10	34314	34323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009782	AAATG	2	10	35555	35564	60 %	20 %	20 %	0 %	156978356
31	NC_009782	ATTTT	2	10	35636	35645	20 %	80 %	0 %	0 %	156978356
32	NC_009782	TAAAA	2	10	35767	35776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009782	AGATA	2	10	35925	35934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009782	TTCTT	2	10	37418	37427	0 %	80 %	0 %	20 %	156978360
35	NC_009782	TTTTC	2	10	38088	38097	0 %	80 %	0 %	20 %	156978360
36	NC_009782	TTGTC	2	10	38124	38133	0 %	60 %	20 %	20 %	156978360
37	NC_009782	TAAAA	2	10	38332	38341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009782	CAAAC	2	10	38948	38957	60 %	0 %	0 %	40 %	156978362
39	NC_009782	AAGTA	2	10	39759	39768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009782	TGACA	2	10	41407	41416	40 %	20 %	20 %	20 %	156978366
41	NC_009782	ATGAG	2	10	43525	43534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009782	TGAAT	2	10	43872	43881	40 %	40 %	20 %	0 %	156978369
43	NC_009782	TTGGT	2	10	43914	43923	0 %	60 %	40 %	0 %	156978369
44	NC_009782	AATAT	2	10	43982	43991	60 %	40 %	0 %	0 %	156978369
45	NC_009782	TTCGT	2	10	44193	44202	0 %	60 %	20 %	20 %	156978369
46	NC_009782	CAAAA	2	10	44553	44562	80 %	0 %	0 %	20 %	156978370
47	NC_009782	AAATT	2	10	46652	46661	60 %	40 %	0 %	0 %	156978371
48	NC_009782	TTTAA	2	10	49611	49620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009782	AAAAT	2	10	49703	49712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009782	TTATT	2	10	49931	49940	20 %	80 %	0 %	0 %	156978374
51	NC_009782	GAATT	2	10	50906	50915	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009782	TGGTG	2	10	51558	51567	0 %	40 %	60 %	0 %	156978376
53	NC_009782	CTTTT	2	10	52822	52831	0 %	80 %	0 %	20 %	156978377
54	NC_009782	ATAGC	2	10	54325	54334	40 %	20 %	20 %	20 %	156978379
55	NC_009782	ATATA	2	10	54458	54467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009782	ATTAC	2	10	57049	57058	40 %	40 %	0 %	20 %	156978383
57	NC_009782	GATTC	2	10	57928	57937	20 %	40 %	20 %	20 %	156978384
58	NC_009782	CATCC	2	10	60157	60166	20 %	20 %	0 %	60 %	156978386
59	NC_009782	TGCGT	2	10	60180	60189	0 %	40 %	40 %	20 %	156978386
60	NC_009782	ATAAA	2	10	63302	63311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009782	TTTGA	2	10	64882	64891	20 %	60 %	20 %	0 %	156978391
62	NC_009782	GTTTT	2	10	64965	64974	0 %	80 %	20 %	0 %	156978391
63	NC_009782	TTGCT	2	10	65923	65932	0 %	60 %	20 %	20 %	156978392
64	NC_009782	CTAGT	2	10	70044	70053	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009782	GATTT	2	10	70485	70494	20 %	60 %	20 %	0 %	156978396
66	NC_009782	GTTTT	2	10	70894	70903	0 %	80 %	20 %	0 %	156978397
67	NC_009782	TTTCA	2	10	71258	71267	20 %	60 %	0 %	20 %	156978398
68	NC_009782	TAATA	2	10	72839	72848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009782	TATAA	2	10	72968	72977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009782	ATTTT	2	10	74409	74418	20 %	80 %	0 %	0 %	156978401
71	NC_009782	ATTTT	2	10	77012	77021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009782	AAACT	2	10	77888	77897	60 %	20 %	0 %	20 %	156978402
73	NC_009782	TTGGT	2	10	79373	79382	0 %	60 %	40 %	0 %	156978403
74	NC_009782	GTGAG	2	10	81378	81387	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009782	AGGGT	2	10	84004	84013	20 %	20 %	60 %	0 %	156978408
76	NC_009782	TCAAT	2	10	84320	84329	40 %	40 %	0 %	20 %	156978408
77	NC_009782	AAAAT	2	10	86255	86264	80 %	20 %	0 %	0 %	156978411
78	NC_009782	TTTAG	2	10	86458	86467	20 %	60 %	20 %	0 %	156978411
79	NC_009782	AAATG	2	10	86580	86589	60 %	20 %	20 %	0 %	156978411
80	NC_009782	TAGTA	2	10	89173	89182	40 %	40 %	20 %	0 %	156978412
81	NC_009782	TTTTA	2	10	89389	89398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009782	TACTA	2	10	90534	90543	40 %	40 %	0 %	20 %	156978414
83	NC_009782	ATCAA	2	10	93284	93293	60 %	20 %	0 %	20 %	156978417
84	NC_009782	TAATA	2	10	95116	95125	60 %	40 %	0 %	0 %	156978418
85	NC_009782	GTGTT	2	10	95199	95208	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009782	ATTCA	2	10	97791	97800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009782	TATAT	2	10	98052	98061	40 %	60 %	0 %	0 %	156978422
88	NC_009782	CTAAA	2	10	99692	99701	60 %	20 %	0 %	20 %	156978423
89	NC_009782	CAAAA	2	10	99723	99732	80 %	0 %	0 %	20 %	156978423
90	NC_009782	GATAT	2	10	104415	104424	40 %	40 %	20 %	0 %	156978426
91	NC_009782	ATATA	2	10	105238	105247	60 %	40 %	0 %	0 %	156978427
92	NC_009782	GATAT	2	10	106072	106081	40 %	40 %	20 %	0 %	156978428
93	NC_009782	AATAA	2	10	106702	106711	80 %	20 %	0 %	0 %	156978429
94	NC_009782	ATTGC	2	10	108682	108691	20 %	40 %	20 %	20 %	156978431
95	NC_009782	TCATT	2	10	108870	108879	20 %	60 %	0 %	20 %	156978431
96	NC_009782	CATGG	2	10	110086	110095	20 %	20 %	40 %	20 %	156978431
97	NC_009782	TGAAA	2	10	110754	110763	60 %	20 %	20 %	0 %	156978432
98	NC_009782	TCAAT	2	10	111126	111135	40 %	40 %	0 %	20 %	156978432
99	NC_009782	GTATT	2	10	111615	111624	20 %	60 %	20 %	0 %	156978433
100	NC_009782	ATTAA	2	10	114357	114366	60 %	40 %	0 %	0 %	156978434
101	NC_009782	AGATA	2	10	117476	117485	60 %	20 %	20 %	0 %	156978437
102	NC_009782	TAAAA	2	10	118036	118045	80 %	20 %	0 %	0 %	156978437
103	NC_009782	ATACA	2	10	118466	118475	60 %	20 %	0 %	20 %	156978438
104	NC_009782	AAAGA	2	10	119669	119678	80 %	0 %	20 %	0 %	156978438
105	NC_009782	GTAAT	2	10	119888	119897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009782	ATGTT	2	10	121154	121163	20 %	60 %	20 %	0 %	156978440
107	NC_009782	TTGCG	2	10	121725	121734	0 %	40 %	40 %	20 %	156978440
108	NC_009782	AGATG	2	10	126460	126469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009782	GGTGA	2	10	127056	127065	20 %	20 %	60 %	0 %	156978444
110	NC_009782	GAAAA	2	10	130493	130502	80 %	0 %	20 %	0 %	156978447
111	NC_009782	TTATT	2	10	130660	130669	20 %	80 %	0 %	0 %	156978447
112	NC_009782	AATCA	2	10	133682	133691	60 %	20 %	0 %	20 %	156978449
113	NC_009782	ATTTT	2	10	134380	134389	20 %	80 %	0 %	0 %	156978450
114	NC_009782	ATCAA	2	10	134407	134416	60 %	20 %	0 %	20 %	156978450
115	NC_009782	ATCAC	2	10	135640	135649	40 %	20 %	0 %	40 %	156978451
116	NC_009782	AACGA	2	10	136317	136326	60 %	0 %	20 %	20 %	156978451
117	NC_009782	ACACA	2	10	138373	138382	60 %	0 %	0 %	40 %	156978453
118	NC_009782	GACAA	2	10	139524	139533	60 %	0 %	20 %	20 %	156978454
119	NC_009782	ATTAC	2	10	141708	141717	40 %	40 %	0 %	20 %	156978456
120	NC_009782	ATTTT	2	10	142012	142021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009782	TATCT	2	10	142367	142376	20 %	60 %	0 %	20 %	156978458
122	NC_009782	ATACG	2	10	144800	144809	40 %	20 %	20 %	20 %	156978460
123	NC_009782	TTATA	2	10	145458	145467	40 %	60 %	0 %	0 %	156978461
124	NC_009782	TTTTA	2	10	146256	146265	20 %	80 %	0 %	0 %	156978461
125	NC_009782	GTATT	2	10	146769	146778	20 %	60 %	20 %	0 %	156978462
126	NC_009782	AATAA	2	10	147362	147371	80 %	20 %	0 %	0 %	156978462
127	NC_009782	TACGC	2	10	147629	147638	20 %	20 %	20 %	40 %	156978462
128	NC_009782	TCCCT	2	10	150435	150444	0 %	40 %	0 %	60 %	156978465
129	NC_009782	GCTTT	2	10	152669	152678	0 %	60 %	20 %	20 %	156978467
130	NC_009782	TAATT	2	10	152754	152763	40 %	60 %	0 %	0 %	156978467
131	NC_009782	ATACT	2	10	153935	153944	40 %	40 %	0 %	20 %	156978469
132	NC_009782	TAATA	2	10	155099	155108	60 %	40 %	0 %	0 %	156978470
133	NC_009782	ATTTT	2	10	156090	156099	20 %	80 %	0 %	0 %	156978471
134	NC_009782	TTGTA	2	10	158295	158304	20 %	60 %	20 %	0 %	156978473
135	NC_009782	TGCAA	2	10	159300	159309	40 %	20 %	20 %	20 %	156978474
136	NC_009782	ATATG	2	10	161318	161327	40 %	40 %	20 %	0 %	156978475
137	NC_009782	TATGA	2	10	162998	163007	40 %	40 %	20 %	0 %	156978477
138	NC_009782	AATAT	2	10	164004	164013	60 %	40 %	0 %	0 %	156978477
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263	NC_009782	TGGCA	2	10	314875	314884	20 %	20 %	40 %	20 %	156978600
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