MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3

Total Repeats: 1904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009782	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009782	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009782	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009782	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009782	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009782	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009782	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009782	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009782	TTTG	2	8	23805	23812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009782	ATCT	2	8	24140	24147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009782	GCCT	2	8	24268	24275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009782	ATTT	2	8	24600	24607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009782	ATCA	2	8	30941	30948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009782	TTCT	2	8	34393	34400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009782	ATAA	2	8	34431	34438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009782	TAAA	2	8	35808	35815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009782	ACAT	2	8	38295	38302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009782	AAGA	2	8	38370	38377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009782	TAAT	2	8	40667	40674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009782	TCTT	2	8	41925	41932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009782	AAAT	2	8	42931	42938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009782	TTAA	2	8	43643	43650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009782	AAGA	2	8	44501	44508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009782	CAAA	2	8	49422	49429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009782	TTAT	2	8	54695	54702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009782	TTAC	2	8	55467	55474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009782	TTAC	2	8	57653	57660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009782	TTTA	2	8	61167	61174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009782	TTTC	2	8	62425	62432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009782	TTAT	3	12	63077	63088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009782	TCAT	2	8	66449	66456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009782	TTGA	2	8	66457	66464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009782	TAAA	2	8	68863	68870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009782	AATT	2	8	71689	71696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009782	TCAA	2	8	71759	71766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009782	TTAA	2	8	71767	71774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009782	AATA	2	8	72585	72592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009782	ATCA	2	8	73222	73229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009782	GAAT	2	8	73370	73377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009782	AAAT	2	8	73412	73419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009782	GTTA	2	8	73461	73468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009782	TTAA	2	8	81454	81461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009782	AGCT	2	8	81667	81674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009782	AAAG	2	8	81763	81770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009782	TATT	2	8	81817	81824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009782	ACGT	2	8	85499	85506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009782	TTCA	2	8	87167	87174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009782	ATAA	2	8	87373	87380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009782	ATAA	2	8	87383	87390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009782	ATCA	2	8	87508	87515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009782	AACA	2	8	89435	89442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009782	ATTG	2	8	89554	89561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009782	CATA	2	8	90261	90268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009782	TAAT	2	8	95401	95408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009782	TGAC	2	8	95436	95443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009782	AATA	2	8	98597	98604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009782	AGCT	2	8	102425	102432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009782	TAAT	2	8	102499	102506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009782	TAAT	2	8	102571	102578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009782	AGAA	2	8	102590	102597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009782	TTGT	2	8	103709	103716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009782	AATC	2	8	107099	107106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009782	ATAA	2	8	110348	110355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009782	TTAT	2	8	113133	113140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009782	ATAA	2	8	113428	113435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009782	AGGG	2	8	118354	118361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009782	AAAG	2	8	119936	119943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009782	ATAA	2	8	120477	120484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009782	TATT	2	8	120515	120522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009782	AGTA	2	8	122457	122464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009782	TTGT	2	8	122600	122607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009782	TGTA	2	8	123975	123982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009782	AAAT	2	8	124075	124082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009782	ATTG	2	8	125321	125328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009782	GTTA	2	8	125443	125450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009782	TAAA	2	8	140088	140095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009782	TAAA	2	8	140126	140133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009782	GAAA	2	8	140959	140966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009782	ATAA	2	8	141777	141784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009782	TAAA	2	8	142024	142031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009782	AAAT	2	8	147935	147942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009782	ATTA	2	8	147969	147976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009782	ATTA	2	8	148808	148815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009782	TAAA	2	8	148832	148839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009782	GAGC	2	8	149745	149752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009782	TGAA	2	8	149808	149815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009782	ATAG	2	8	150719	150726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009782	TAAA	2	8	152996	153003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009782	CTTT	2	8	157427	157434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009782	CTTT	2	8	158684	158691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009782	ATTT	2	8	158771	158778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009782	AAGA	2	8	160357	160364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009782	GAGT	2	8	160380	160387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009782	ACTT	2	8	161942	161949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009782	ATTT	2	8	164280	164287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009782	TATT	2	8	167124	167131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009782	TAAT	2	8	167284	167291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_009782	AATA	2	8	186633	186640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009782	GTTT	2	8	186913	186920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009782	TAAC	2	8	187013	187020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009782	ATTA	2	8	187134	187141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009782	ATTT	2	8	187256	187263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009782	GTTT	2	8	188521	188528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009782	TTTA	2	8	188760	188767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009782	GAGT	2	8	190511	190518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009782	TCAT	2	8	195259	195266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009782	TTTG	2	8	195342	195349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009782	ATTT	2	8	196708	196715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009782	ATTT	2	8	196720	196727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009782	ATGT	2	8	196951	196958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009782	TTAA	2	8	197072	197079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009782	AGTA	2	8	197114	197121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009782	ATCA	2	8	205258	205265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009782	TAAA	2	8	205983	205990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009782	ATGT	2	8	210520	210527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009782	TTAA	2	8	212000	212007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009782	AATA	2	8	212080	212087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009782	TGTA	2	8	216837	216844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009782	CTTA	2	8	216926	216933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009782	TAAT	2	8	216952	216959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009782	TTTG	2	8	217042	217049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009782	AAAG	2	8	217223	217230	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009782	AGTT	2	8	221722	221729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009782	CTTT	2	8	229468	229475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009782	CTAT	2	8	232630	232637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009782	ACAA	2	8	232677	232684	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009782	ATTT	2	8	232966	232973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009782	GAAA	2	8	232989	232996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009782	ATAA	2	8	233072	233079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009782	TAGT	2	8	233210	233217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009782	TAGT	2	8	241514	241521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009782	ATGA	2	8	241557	241564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009782	ATCA	2	8	243305	243312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009782	GGAT	2	8	243432	243439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009782	TGAA	2	8	252193	252200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_009782	AATT	2	8	278772	278779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009782	AAAT	2	8	278800	278807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009782	AAAT	2	8	279282	279289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009782	AATT	2	8	280774	280781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009782	ATAA	2	8	280795	280802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009782	ATTT	2	8	280902	280909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009782	AAAT	2	8	281068	281075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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