MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	GCCGCA	2	12	4124	4135	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156936550
2	NC_009780	ATGCAT	2	12	5183	5194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156936551
3	NC_009780	GTAGCG	2	12	5765	5776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009780	CTGGCG	2	12	7104	7115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009780	GTTATC	2	12	12170	12181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936561
6	NC_009780	GTGCTG	2	12	12383	12394	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	156936561
7	NC_009780	CAGACG	2	12	16223	16234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936563
8	NC_009780	AGCCTG	2	12	17954	17965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009780	TGGCAG	2	12	19986	19997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156936568
10	NC_009780	TGCTGA	2	12	21790	21801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156936569
11	NC_009780	CCAGAT	2	12	24224	24235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156936572
12	NC_009780	GCGTGC	2	12	32030	32041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009780	GGCGCA	2	12	38571	38582	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156936592
14	NC_009780	CGGCAC	2	12	41218	41229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156936597
15	NC_009780	CGATGG	2	12	41505	41516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156936597
16	NC_009780	GCGAAA	2	12	44680	44691	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936601
17	NC_009780	ACCAGC	2	12	48198	48209	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156936605
18	NC_009780	AACCAG	2	12	48848	48859	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156936605
19	NC_009780	GTAAAG	2	12	49868	49879	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156936607
20	NC_009780	GAGCTG	2	12	55160	55171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156936611
21	NC_009780	CCATTG	2	12	58274	58285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156936614
22	NC_009780	AGGGCG	2	12	59892	59903	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	156936616
23	NC_009780	GAAGAG	2	12	61220	61231	50 %	0 %	50 %	0 %	156936616
24	NC_009780	TGGACG	2	12	61398	61409	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156936616
25	NC_009780	CGCGCT	2	12	61654	61665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	156936616
26	NC_009780	GTCACC	2	12	65839	65850	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156936619
27	NC_009780	CAGCAC	2	12	70942	70953	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156936627
28	NC_009780	TGCCGA	2	12	76360	76371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156936636
29	NC_009780	TCGGCA	2	12	81687	81698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156936640
30	NC_009780	CGGCTT	2	12	85328	85339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936642
31	NC_009780	CCCGCT	2	12	86437	86448	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	156936642
32	NC_009780	GCCATT	2	12	91914	91925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156936647
33	NC_009780	AGCCAC	2	12	95312	95323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009780	CAGCGC	2	12	99969	99980	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156936654
35	NC_009780	ATTGTC	2	12	100468	100479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009780	CAGCGC	2	12	103128	103139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156936655
37	NC_009780	TGACGC	2	12	106078	106089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156936658
38	NC_009780	TGCCGG	2	12	109650	109661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156936659
39	NC_009780	TCTCCC	2	12	110606	110617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936659
40	NC_009780	CAGCCC	2	12	112953	112964	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	156936660
41	NC_009780	CGTGGG	2	12	114415	114426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	156936661
42	NC_009780	CAGCGA	2	12	116470	116481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936662
43	NC_009780	ACGGTT	2	12	121019	121030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156936667
44	NC_009780	CGCAGG	2	12	121211	121222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156936667
45	NC_009780	GTGGCA	2	12	122606	122617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156936668
46	NC_009780	GCTGGA	2	12	124714	124725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156936669
47	NC_009780	CATTAA	2	12	126713	126724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156936670
48	NC_009780	GATCGA	2	12	129463	129474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156936673

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.