MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	CTGGT	2	10	3221	3230	0 %	40 %	40 %	20 %	156936549
2	NC_009780	TGGCG	2	10	4846	4855	0 %	20 %	60 %	20 %	156936551
3	NC_009780	CAAAA	2	10	6869	6878	80 %	0 %	0 %	20 %	156936553
4	NC_009780	TTTAC	2	10	8231	8240	20 %	60 %	0 %	20 %	156936555
5	NC_009780	ACGGC	2	10	8748	8757	20 %	0 %	40 %	40 %	156936556
6	NC_009780	TCAGT	2	10	12451	12460	20 %	40 %	20 %	20 %	156936561
7	NC_009780	GGCAG	2	10	13999	14008	20 %	0 %	60 %	20 %	156936562
8	NC_009780	GGCGA	2	10	14507	14516	20 %	0 %	60 %	20 %	156936562
9	NC_009780	CTGGC	2	10	14683	14692	0 %	20 %	40 %	40 %	156936563
10	NC_009780	CGTGA	2	10	16598	16607	20 %	20 %	40 %	20 %	156936563
11	NC_009780	GCGCC	2	10	18220	18229	0 %	0 %	40 %	60 %	156936565
12	NC_009780	CAGCG	2	10	18538	18547	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009780	GTGGG	2	10	20068	20077	0 %	20 %	80 %	0 %	156936567
14	NC_009780	GTGAG	2	10	24074	24083	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009780	GCGCC	2	10	24556	24565	0 %	0 %	40 %	60 %	156936573
16	NC_009780	GGCTG	2	10	25090	25099	0 %	20 %	60 %	20 %	156936573
17	NC_009780	GCCGC	2	10	26047	26056	0 %	0 %	40 %	60 %	156936575
18	NC_009780	CGTCG	2	10	28024	28033	0 %	20 %	40 %	40 %	156936581
19	NC_009780	GCCTG	2	10	28965	28974	0 %	20 %	40 %	40 %	156936581
20	NC_009780	TGCTC	2	10	31553	31562	0 %	40 %	20 %	40 %	156936583
21	NC_009780	ACGGC	2	10	33904	33913	20 %	0 %	40 %	40 %	156936588
22	NC_009780	ACAAA	2	10	37238	37247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009780	TGGCG	2	10	38397	38406	0 %	20 %	60 %	20 %	156936592
24	NC_009780	GAATG	2	10	38897	38906	40 %	20 %	40 %	0 %	156936593
25	NC_009780	CGCAC	2	10	39774	39783	20 %	0 %	20 %	60 %	156936594
26	NC_009780	GCGCA	2	10	43610	43619	20 %	0 %	40 %	40 %	156936600
27	NC_009780	CTGCG	2	10	45462	45471	0 %	20 %	40 %	40 %	156936602
28	NC_009780	GCTGC	2	10	45798	45807	0 %	20 %	40 %	40 %	156936603
29	NC_009780	GCGCT	2	10	46712	46721	0 %	20 %	40 %	40 %	156936603
30	NC_009780	GCATC	2	10	47309	47318	20 %	20 %	20 %	40 %	156936604
31	NC_009780	AAAGG	2	10	47612	47621	60 %	0 %	40 %	0 %	156936605
32	NC_009780	CGAGG	2	10	48335	48344	20 %	0 %	60 %	20 %	156936605
33	NC_009780	GCGCC	2	10	48547	48556	0 %	0 %	40 %	60 %	156936605
34	NC_009780	GGACG	2	10	51176	51185	20 %	0 %	60 %	20 %	156936608
35	NC_009780	AAGGA	2	10	52957	52966	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009780	GACAG	2	10	55741	55750	40 %	0 %	40 %	20 %	156936612
37	NC_009780	TCAGG	2	10	55857	55866	20 %	20 %	40 %	20 %	156936612
38	NC_009780	CTGTG	2	10	55978	55987	0 %	40 %	40 %	20 %	156936612
39	NC_009780	CAGGC	2	10	56019	56028	20 %	0 %	40 %	40 %	156936612
40	NC_009780	GCGAG	2	10	56901	56910	20 %	0 %	60 %	20 %	156936613
41	NC_009780	CGCTG	2	10	57343	57352	0 %	20 %	40 %	40 %	156936613
42	NC_009780	GCAGG	2	10	57374	57383	20 %	0 %	60 %	20 %	156936613
43	NC_009780	AGGCC	2	10	58782	58791	20 %	0 %	40 %	40 %	156936614
44	NC_009780	CGCTG	2	10	60856	60865	0 %	20 %	40 %	40 %	156936616
45	NC_009780	AACAG	2	10	61291	61300	60 %	0 %	20 %	20 %	156936616
46	NC_009780	ATTTT	2	10	62817	62826	20 %	80 %	0 %	0 %	156936617
47	NC_009780	TGCAC	2	10	64803	64812	20 %	20 %	20 %	40 %	156936619
48	NC_009780	GGAAA	2	10	66913	66922	60 %	0 %	40 %	0 %	156936620
49	NC_009780	TAAAT	2	10	68057	68066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009780	CGGTG	2	10	70211	70220	0 %	20 %	60 %	20 %	156936626
51	NC_009780	CGGGC	2	10	70975	70984	0 %	0 %	60 %	40 %	156936627
52	NC_009780	GCGAG	2	10	71466	71475	20 %	0 %	60 %	20 %	156936627
53	NC_009780	CAGCA	2	10	72491	72500	40 %	0 %	20 %	40 %	156936628
54	NC_009780	TTGGG	2	10	74177	74186	0 %	40 %	60 %	0 %	156936632
55	NC_009780	TGACG	2	10	77011	77020	20 %	20 %	40 %	20 %	156936637
56	NC_009780	GGTTT	2	10	78487	78496	0 %	60 %	40 %	0 %	156936638
57	NC_009780	GCCCG	2	10	79115	79124	0 %	0 %	40 %	60 %	156936638
58	NC_009780	CGGCG	2	10	81832	81841	0 %	0 %	60 %	40 %	156936640
59	NC_009780	GCTCT	2	10	86224	86233	0 %	40 %	20 %	40 %	156936642
60	NC_009780	CATGG	2	10	86359	86368	20 %	20 %	40 %	20 %	156936642
61	NC_009780	TGCGG	2	10	87400	87409	0 %	20 %	60 %	20 %	156936642
62	NC_009780	CCGGT	2	10	87757	87766	0 %	20 %	40 %	40 %	156936642
63	NC_009780	TGCGT	2	10	88341	88350	0 %	40 %	40 %	20 %	156936643
64	NC_009780	AGAGA	2	10	88864	88873	60 %	0 %	40 %	0 %	156936644
65	NC_009780	TTCCA	2	10	89067	89076	20 %	40 %	0 %	40 %	156936644
66	NC_009780	CGGCG	2	10	89713	89722	0 %	0 %	60 %	40 %	156936646
67	NC_009780	CGCGC	2	10	89729	89738	0 %	0 %	40 %	60 %	156936646
68	NC_009780	CCTGA	2	10	91068	91077	20 %	20 %	20 %	40 %	156936646
69	NC_009780	CGACC	2	10	92428	92437	20 %	0 %	20 %	60 %	156936648
70	NC_009780	CCCGC	2	10	94863	94872	0 %	0 %	20 %	80 %	156936649
71	NC_009780	CCTGC	2	10	97124	97133	0 %	20 %	20 %	60 %	156936651
72	NC_009780	TTCTC	2	10	97517	97526	0 %	60 %	0 %	40 %	156936651
73	NC_009780	ATTTT	2	10	98647	98656	20 %	80 %	0 %	0 %	156936652
74	NC_009780	CAGAG	2	10	99809	99818	40 %	0 %	40 %	20 %	156936654
75	NC_009780	GCGCG	2	10	100880	100889	0 %	0 %	60 %	40 %	156936655
76	NC_009780	CCTGC	2	10	103082	103091	0 %	20 %	20 %	60 %	156936655
77	NC_009780	GTAAA	2	10	103763	103772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009780	GCACG	2	10	106379	106388	20 %	0 %	40 %	40 %	156936658
79	NC_009780	GCCCT	2	10	107508	107517	0 %	20 %	20 %	60 %	156936658
80	NC_009780	GTCTC	2	10	108034	108043	0 %	40 %	20 %	40 %	156936658
81	NC_009780	GCTTC	2	10	111374	111383	0 %	40 %	20 %	40 %	156936660
82	NC_009780	CCGGC	2	10	112385	112394	0 %	0 %	40 %	60 %	156936660
83	NC_009780	CCCTC	2	10	113491	113500	0 %	20 %	0 %	80 %	156936661
84	NC_009780	CCGCG	2	10	115257	115266	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_009780	GCCCG	2	10	115783	115792	0 %	0 %	40 %	60 %	156936662
86	NC_009780	CCTGC	2	10	116488	116497	0 %	20 %	20 %	60 %	156936662
87	NC_009780	CGCAG	2	10	117834	117843	20 %	0 %	40 %	40 %	156936664
88	NC_009780	TGCGC	2	10	119414	119423	0 %	20 %	40 %	40 %	156936666
89	NC_009780	CGCTG	2	10	119797	119806	0 %	20 %	40 %	40 %	156936666
90	NC_009780	CGCGC	2	10	121479	121488	0 %	0 %	40 %	60 %	156936667
91	NC_009780	GGCCG	2	10	121509	121518	0 %	0 %	60 %	40 %	156936667
92	NC_009780	CGACG	2	10	121554	121563	20 %	0 %	40 %	40 %	156936667
93	NC_009780	GGCGC	2	10	121709	121718	0 %	0 %	60 %	40 %	156936667
94	NC_009780	CTCGC	2	10	122829	122838	0 %	20 %	20 %	60 %	156936668
95	NC_009780	TGCCG	2	10	126404	126413	0 %	20 %	40 %	40 %	156936670
96	NC_009780	GTTCT	2	10	127209	127218	0 %	60 %	20 %	20 %	156936670
97	NC_009780	CCACA	2	10	127227	127236	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_009780	CAGGA	2	10	130751	130760	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.