MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	GCGG	2	8	395	402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009780	TGCC	2	8	467	474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009780	CTAT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009780	TCGC	2	8	1320	1327	0 %	25 %	25 %	50 %	156936547
5	NC_009780	GCGT	2	8	2064	2071	0 %	25 %	50 %	25 %	156936548
6	NC_009780	CTGG	2	8	2608	2615	0 %	25 %	50 %	25 %	156936549
7	NC_009780	TCGC	2	8	3073	3080	0 %	25 %	25 %	50 %	156936549
8	NC_009780	TTAA	2	8	3446	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	156936549
9	NC_009780	CACG	2	8	3701	3708	25 %	0 %	25 %	50 %	156936550
10	NC_009780	TGCG	2	8	3720	3727	0 %	25 %	50 %	25 %	156936550
11	NC_009780	CAGC	2	8	3999	4006	25 %	0 %	25 %	50 %	156936550
12	NC_009780	CGTT	2	8	4329	4336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009780	TCAG	2	8	6156	6163	25 %	25 %	25 %	25 %	156936553
14	NC_009780	GACC	2	8	6322	6329	25 %	0 %	25 %	50 %	156936553
15	NC_009780	ATCA	2	8	7270	7277	50 %	25 %	0 %	25 %	156936554
16	NC_009780	GACG	2	8	7641	7648	25 %	0 %	50 %	25 %	156936554
17	NC_009780	ACCG	2	8	8653	8660	25 %	0 %	25 %	50 %	156936556
18	NC_009780	GACC	2	8	10913	10920	25 %	0 %	25 %	50 %	156936559
19	NC_009780	GGCT	2	8	11325	11332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009780	CTGC	2	8	11966	11973	0 %	25 %	25 %	50 %	156936560
21	NC_009780	GCCA	2	8	12094	12101	25 %	0 %	25 %	50 %	156936560
22	NC_009780	TCGC	2	8	12152	12159	0 %	25 %	25 %	50 %	156936561
23	NC_009780	GCCC	2	8	12434	12441	0 %	0 %	25 %	75 %	156936561
24	NC_009780	TCCG	2	8	12697	12704	0 %	25 %	25 %	50 %	156936561
25	NC_009780	TCGC	2	8	12779	12786	0 %	25 %	25 %	50 %	156936561
26	NC_009780	GGCA	2	8	12880	12887	25 %	0 %	50 %	25 %	156936561
27	NC_009780	GGCG	2	8	12998	13005	0 %	0 %	75 %	25 %	156936561
28	NC_009780	CGCC	2	8	13132	13139	0 %	0 %	25 %	75 %	156936561
29	NC_009780	GCCA	2	8	13268	13275	25 %	0 %	25 %	50 %	156936561
30	NC_009780	ACGA	2	8	13313	13320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009780	TCTT	2	8	13442	13449	0 %	75 %	0 %	25 %	156936562
32	NC_009780	GACC	2	8	13519	13526	25 %	0 %	25 %	50 %	156936562
33	NC_009780	TTGC	2	8	13703	13710	0 %	50 %	25 %	25 %	156936562
34	NC_009780	CTCA	2	8	14128	14135	25 %	25 %	0 %	50 %	156936562
35	NC_009780	GGCG	2	8	14464	14471	0 %	0 %	75 %	25 %	156936562
36	NC_009780	TGAC	2	8	14700	14707	25 %	25 %	25 %	25 %	156936563
37	NC_009780	GTGA	2	8	15143	15150	25 %	25 %	50 %	0 %	156936563
38	NC_009780	GGCG	2	8	15775	15782	0 %	0 %	75 %	25 %	156936563
39	NC_009780	GCTG	2	8	16035	16042	0 %	25 %	50 %	25 %	156936563
40	NC_009780	ATCG	2	8	16283	16290	25 %	25 %	25 %	25 %	156936563
41	NC_009780	GGCG	2	8	17047	17054	0 %	0 %	75 %	25 %	156936563
42	NC_009780	CCTG	2	8	17515	17522	0 %	25 %	25 %	50 %	156936563
43	NC_009780	TGAT	2	8	17814	17821	25 %	50 %	25 %	0 %	156936564
44	NC_009780	GTCG	2	8	18049	18056	0 %	25 %	50 %	25 %	156936565
45	NC_009780	CGTC	2	8	18658	18665	0 %	25 %	25 %	50 %	156936566
46	NC_009780	GGCT	2	8	19005	19012	0 %	25 %	50 %	25 %	156936566
47	NC_009780	TGCC	2	8	19842	19849	0 %	25 %	25 %	50 %	156936568
48	NC_009780	AGAA	2	8	19919	19926	75 %	0 %	25 %	0 %	156936568
49	NC_009780	TGAA	2	8	20310	20317	50 %	25 %	25 %	0 %	156936567
50	NC_009780	GCCC	2	8	20341	20348	0 %	0 %	25 %	75 %	156936567
51	NC_009780	CAGC	2	8	21467	21474	25 %	0 %	25 %	50 %	156936569
52	NC_009780	GGTG	2	8	21863	21870	0 %	25 %	75 %	0 %	156936569
53	NC_009780	TCGC	2	8	22095	22102	0 %	25 %	25 %	50 %	156936569
54	NC_009780	CGGT	2	8	23044	23051	0 %	25 %	50 %	25 %	156936570
55	NC_009780	TATG	2	8	24519	24526	25 %	50 %	25 %	0 %	156936573
56	NC_009780	GCAC	2	8	24862	24869	25 %	0 %	25 %	50 %	156936573
57	NC_009780	TGGC	2	8	25512	25519	0 %	25 %	50 %	25 %	156936575
58	NC_009780	GCGG	2	8	25554	25561	0 %	0 %	75 %	25 %	156936575
59	NC_009780	GCCT	2	8	25823	25830	0 %	25 %	25 %	50 %	156936575
60	NC_009780	GCCA	2	8	25845	25852	25 %	0 %	25 %	50 %	156936575
61	NC_009780	TCCA	2	8	25886	25893	25 %	25 %	0 %	50 %	156936575
62	NC_009780	GGCT	2	8	26317	26324	0 %	25 %	50 %	25 %	156936576
63	NC_009780	GTCG	2	8	26484	26491	0 %	25 %	50 %	25 %	156936576
64	NC_009780	ATTT	2	8	27527	27534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009780	CTAT	2	8	27955	27962	25 %	50 %	0 %	25 %	156936581
66	NC_009780	CCAG	2	8	28733	28740	25 %	0 %	25 %	50 %	156936581
67	NC_009780	GTGA	2	8	29214	29221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009780	CGGC	2	8	29514	29521	0 %	0 %	50 %	50 %	156936582
69	NC_009780	GATG	2	8	29651	29658	25 %	25 %	50 %	0 %	156936582
70	NC_009780	CGCC	2	8	29753	29760	0 %	0 %	25 %	75 %	156936582
71	NC_009780	CCGG	2	8	30017	30024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009780	CAGC	2	8	30083	30090	25 %	0 %	25 %	50 %	156936583
73	NC_009780	CGCC	2	8	30179	30186	0 %	0 %	25 %	75 %	156936583
74	NC_009780	CGCC	2	8	30527	30534	0 %	0 %	25 %	75 %	156936583
75	NC_009780	GGTT	2	8	32156	32163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009780	CATT	2	8	32369	32376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009780	ATTC	2	8	32377	32384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009780	CGCT	2	8	32658	32665	0 %	25 %	25 %	50 %	156936584
79	NC_009780	TGGA	2	8	32730	32737	25 %	25 %	50 %	0 %	156936584
80	NC_009780	GATG	2	8	34244	34251	25 %	25 %	50 %	0 %	156936589
81	NC_009780	GCCA	2	8	34450	34457	25 %	0 %	25 %	50 %	156936589
82	NC_009780	GGCG	2	8	34511	34518	0 %	0 %	75 %	25 %	156936589
83	NC_009780	GGCT	2	8	34743	34750	0 %	25 %	50 %	25 %	156936589
84	NC_009780	CTGG	2	8	35758	35765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009780	ACGA	2	8	35843	35850	50 %	0 %	25 %	25 %	156936591
86	NC_009780	GCAA	2	8	36692	36699	50 %	0 %	25 %	25 %	156936591
87	NC_009780	GGCG	2	8	36901	36908	0 %	0 %	75 %	25 %	156936591
88	NC_009780	AAAT	2	8	37358	37365	75 %	25 %	0 %	0 %	156936592
89	NC_009780	CCCG	2	8	37493	37500	0 %	0 %	25 %	75 %	156936592
90	NC_009780	CGCT	2	8	37583	37590	0 %	25 %	25 %	50 %	156936592
91	NC_009780	TATC	2	8	38520	38527	25 %	50 %	0 %	25 %	156936592
92	NC_009780	GGAA	2	8	39433	39440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009780	TTTC	2	8	39812	39819	0 %	75 %	0 %	25 %	156936594
94	NC_009780	CTGT	2	8	41820	41827	0 %	50 %	25 %	25 %	156936597
95	NC_009780	GCGT	2	8	42082	42089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009780	TTCA	2	8	42243	42250	25 %	50 %	0 %	25 %	156936598
97	NC_009780	ATTA	2	8	43078	43085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009780	TGAA	2	8	43430	43437	50 %	25 %	25 %	0 %	156936600
99	NC_009780	CTTT	2	8	43594	43601	0 %	75 %	0 %	25 %	156936600
100	NC_009780	CGCC	2	8	43709	43716	0 %	0 %	25 %	75 %	156936600
101	NC_009780	TCTG	2	8	43765	43772	0 %	50 %	25 %	25 %	156936600
102	NC_009780	CAGA	2	8	43858	43865	50 %	0 %	25 %	25 %	156936600
103	NC_009780	ATAC	2	8	44080	44087	50 %	25 %	0 %	25 %	156936601
104	NC_009780	TGAA	2	8	44102	44109	50 %	25 %	25 %	0 %	156936601
105	NC_009780	GGCG	2	8	44215	44222	0 %	0 %	75 %	25 %	156936601
106	NC_009780	CAGA	3	12	44561	44572	50 %	0 %	25 %	25 %	156936601
107	NC_009780	CACT	2	8	44870	44877	25 %	25 %	0 %	50 %	156936601
108	NC_009780	CCCG	2	8	45014	45021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009780	CCTG	2	8	45126	45133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009780	GCTC	2	8	45631	45638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009780	TCAT	2	8	45666	45673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009780	TTTC	2	8	46846	46853	0 %	75 %	0 %	25 %	156936603
113	NC_009780	GCGT	2	8	47089	47096	0 %	25 %	50 %	25 %	156936603
114	NC_009780	TGCC	2	8	47674	47681	0 %	25 %	25 %	50 %	156936605
115	NC_009780	CCAG	2	8	48109	48116	25 %	0 %	25 %	50 %	156936605
116	NC_009780	CGAG	2	8	48382	48389	25 %	0 %	50 %	25 %	156936605
117	NC_009780	CTGA	2	8	49963	49970	25 %	25 %	25 %	25 %	156936607
118	NC_009780	CCCG	2	8	50470	50477	0 %	0 %	25 %	75 %	156936608
119	NC_009780	ATAC	2	8	50529	50536	50 %	25 %	0 %	25 %	156936608
120	NC_009780	GCCA	2	8	50649	50656	25 %	0 %	25 %	50 %	156936608
121	NC_009780	CGGG	2	8	50818	50825	0 %	0 %	75 %	25 %	156936608
122	NC_009780	GGCA	2	8	51109	51116	25 %	0 %	50 %	25 %	156936608
123	NC_009780	CAGC	2	8	51154	51161	25 %	0 %	25 %	50 %	156936608
124	NC_009780	CGCC	2	8	51226	51233	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_009780	GCTT	2	8	51616	51623	0 %	50 %	25 %	25 %	156936609
126	NC_009780	GGCG	2	8	51706	51713	0 %	0 %	75 %	25 %	156936609
127	NC_009780	GCGG	2	8	51949	51956	0 %	0 %	75 %	25 %	156936609
128	NC_009780	CTGG	2	8	52078	52085	0 %	25 %	50 %	25 %	156936609
129	NC_009780	AGAA	2	8	52123	52130	75 %	0 %	25 %	0 %	156936609
130	NC_009780	CGAA	2	8	52219	52226	50 %	0 %	25 %	25 %	156936609
131	NC_009780	CAGG	2	8	52357	52364	25 %	0 %	50 %	25 %	156936609
132	NC_009780	ATTC	2	8	52909	52916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009780	CAGC	2	8	53989	53996	25 %	0 %	25 %	50 %	156936611
134	NC_009780	GTGC	2	8	54796	54803	0 %	25 %	50 %	25 %	156936611
135	NC_009780	GGCG	2	8	54820	54827	0 %	0 %	75 %	25 %	156936611
136	NC_009780	TGAC	2	8	55203	55210	25 %	25 %	25 %	25 %	156936611
137	NC_009780	TGCC	2	8	55698	55705	0 %	25 %	25 %	50 %	156936612
138	NC_009780	GCTG	2	8	55820	55827	0 %	25 %	50 %	25 %	156936612
139	NC_009780	GACT	2	8	56203	56210	25 %	25 %	25 %	25 %	156936612
140	NC_009780	CTGG	2	8	56778	56785	0 %	25 %	50 %	25 %	156936613
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142	NC_009780	CAGG	2	8	56971	56978	25 %	0 %	50 %	25 %	156936613
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319	NC_009780	ACTG	2	8	130404	130411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
320	NC_009780	GTGA	2	8	130692	130699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
321	NC_009780	GATG	2	8	130956	130963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
322	NC_009780	CTCG	2	8	130986	130993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.