MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	GCGG	2	8	395	402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009780	TGCC	2	8	467	474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009780	CTAT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009780	CGTT	2	8	4329	4336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009780	GGCT	2	8	11325	11332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009780	ACGA	2	8	13313	13320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009780	ATTT	2	8	27527	27534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009780	GTGA	2	8	29214	29221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009780	CCGG	2	8	30017	30024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009780	GGTT	2	8	32156	32163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009780	CATT	2	8	32369	32376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009780	ATTC	2	8	32377	32384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009780	CTGG	2	8	35758	35765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009780	GGAA	2	8	39433	39440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009780	GCGT	2	8	42082	42089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009780	ATTA	2	8	43078	43085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009780	CCCG	2	8	45014	45021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009780	CCTG	2	8	45126	45133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009780	GCTC	2	8	45631	45638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009780	TCAT	2	8	45666	45673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009780	CGCC	2	8	51226	51233	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009780	ATTC	2	8	52909	52916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009780	CAGC	2	8	59604	59611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009780	AGGG	2	8	63084	63091	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009780	CCTT	2	8	67293	67300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009780	TTAT	2	8	68043	68050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009780	AAAT	2	8	68504	68511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009780	ATCT	2	8	73341	73348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009780	GGCT	2	8	79324	79331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009780	TAAA	2	8	79811	79818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009780	TGCG	2	8	80496	80503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009780	ATAC	2	8	89462	89469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009780	GTCT	2	8	93742	93749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009780	CGGG	2	8	94036	94043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009780	TGAC	2	8	94232	94239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009780	ATAC	2	8	95459	95466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009780	TCAT	2	8	98694	98701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009780	CTGC	2	8	98798	98805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009780	ATAA	2	8	99015	99022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009780	GCAG	2	8	100438	100445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009780	TAAA	2	8	100618	100625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009780	TTTA	2	8	110658	110665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009780	ATAC	2	8	116915	116922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009780	TGTT	2	8	119245	119252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009780	AAAG	2	8	127639	127646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009780	GCAG	2	8	127734	127741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009780	AACG	2	8	130072	130079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009780	CGTT	2	8	130089	130096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009780	ACTG	2	8	130404	130411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009780	GTGA	2	8	130692	130699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009780	GATG	2	8	130956	130963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009780	CTCG	2	8	130986	130993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.