MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 378

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	GC	5	10	285	294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009780	GC	3	6	461	466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009780	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009780	GC	3	6	1030	1035	0 %	0 %	50 %	50 %	156936547
5	NC_009780	CG	4	8	1131	1138	0 %	0 %	50 %	50 %	156936547
6	NC_009780	CT	3	6	1179	1184	0 %	50 %	0 %	50 %	156936547
7	NC_009780	GC	3	6	1426	1431	0 %	0 %	50 %	50 %	156936547
8	NC_009780	CT	3	6	2480	2485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009780	CG	3	6	2881	2886	0 %	0 %	50 %	50 %	156936549
10	NC_009780	CG	3	6	2922	2927	0 %	0 %	50 %	50 %	156936549
11	NC_009780	GC	3	6	3204	3209	0 %	0 %	50 %	50 %	156936549
12	NC_009780	CG	3	6	3633	3638	0 %	0 %	50 %	50 %	156936550
13	NC_009780	GC	3	6	4028	4033	0 %	0 %	50 %	50 %	156936550
14	NC_009780	TC	4	8	4108	4115	0 %	50 %	0 %	50 %	156936550
15	NC_009780	AT	3	6	4369	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009780	CG	3	6	4854	4859	0 %	0 %	50 %	50 %	156936551
17	NC_009780	GA	3	6	5854	5859	50 %	0 %	50 %	0 %	156936552
18	NC_009780	AT	3	6	5974	5979	50 %	50 %	0 %	0 %	156936552
19	NC_009780	GC	3	6	6242	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	156936553
20	NC_009780	CA	3	6	6952	6957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009780	GC	3	6	7175	7180	0 %	0 %	50 %	50 %	156936554
22	NC_009780	CT	3	6	7191	7196	0 %	50 %	0 %	50 %	156936554
23	NC_009780	CG	3	6	7848	7853	0 %	0 %	50 %	50 %	156936555
24	NC_009780	GC	3	6	7961	7966	0 %	0 %	50 %	50 %	156936555
25	NC_009780	AT	4	8	9844	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	156936558
26	NC_009780	CT	3	6	9961	9966	0 %	50 %	0 %	50 %	156936558
27	NC_009780	GC	3	6	10081	10086	0 %	0 %	50 %	50 %	156936558
28	NC_009780	CG	3	6	10288	10293	0 %	0 %	50 %	50 %	156936558
29	NC_009780	GT	3	6	10495	10500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009780	GA	3	6	11305	11310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009780	GC	3	6	11683	11688	0 %	0 %	50 %	50 %	156936560
32	NC_009780	CG	4	8	11744	11751	0 %	0 %	50 %	50 %	156936560
33	NC_009780	TC	3	6	12119	12124	0 %	50 %	0 %	50 %	156936561
34	NC_009780	CG	3	6	12586	12591	0 %	0 %	50 %	50 %	156936561
35	NC_009780	GC	3	6	12607	12612	0 %	0 %	50 %	50 %	156936561
36	NC_009780	GC	3	6	12847	12852	0 %	0 %	50 %	50 %	156936561
37	NC_009780	CG	3	6	13115	13120	0 %	0 %	50 %	50 %	156936561
38	NC_009780	GC	3	6	13720	13725	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
39	NC_009780	GC	3	6	13770	13775	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
40	NC_009780	GC	3	6	13863	13868	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
41	NC_009780	CG	3	6	13927	13932	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
42	NC_009780	CG	4	8	14097	14104	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
43	NC_009780	GC	3	6	14316	14321	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
44	NC_009780	GC	3	6	14482	14487	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
45	NC_009780	TC	3	6	14539	14544	0 %	50 %	0 %	50 %	156936563
46	NC_009780	GC	3	6	15193	15198	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
47	NC_009780	GC	3	6	15256	15261	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
48	NC_009780	CG	3	6	15436	15441	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
49	NC_009780	GC	3	6	15598	15603	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
50	NC_009780	GC	3	6	15699	15704	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
51	NC_009780	CG	3	6	15794	15799	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
52	NC_009780	GC	3	6	16043	16048	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
53	NC_009780	GC	3	6	16104	16109	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
54	NC_009780	GC	3	6	16400	16405	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
55	NC_009780	CG	3	6	16555	16560	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
56	NC_009780	CG	3	6	16665	16670	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
57	NC_009780	CG	4	8	17012	17019	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
58	NC_009780	GC	3	6	17557	17562	0 %	0 %	50 %	50 %	156936563
59	NC_009780	CA	4	8	18495	18502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009780	TG	3	6	18846	18851	0 %	50 %	50 %	0 %	156936566
61	NC_009780	GC	3	6	19412	19417	0 %	0 %	50 %	50 %	156936568
62	NC_009780	CT	3	6	19651	19656	0 %	50 %	0 %	50 %	156936568
63	NC_009780	CG	3	6	20199	20204	0 %	0 %	50 %	50 %	156936567
64	NC_009780	CG	3	6	20479	20484	0 %	0 %	50 %	50 %	156936567
65	NC_009780	GC	3	6	20520	20525	0 %	0 %	50 %	50 %	156936567
66	NC_009780	CG	3	6	20554	20559	0 %	0 %	50 %	50 %	156936567
67	NC_009780	TA	3	6	20840	20845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009780	CT	3	6	21264	21269	0 %	50 %	0 %	50 %	156936569
69	NC_009780	GC	4	8	21640	21647	0 %	0 %	50 %	50 %	156936569
70	NC_009780	GC	3	6	21871	21876	0 %	0 %	50 %	50 %	156936569
71	NC_009780	CT	3	6	22008	22013	0 %	50 %	0 %	50 %	156936569
72	NC_009780	GC	3	6	22219	22224	0 %	0 %	50 %	50 %	156936569
73	NC_009780	GC	3	6	22504	22509	0 %	0 %	50 %	50 %	156936570
74	NC_009780	GC	3	6	22637	22642	0 %	0 %	50 %	50 %	156936570
75	NC_009780	CG	4	8	22786	22793	0 %	0 %	50 %	50 %	156936570
76	NC_009780	CG	3	6	22981	22986	0 %	0 %	50 %	50 %	156936570
77	NC_009780	CG	3	6	23313	23318	0 %	0 %	50 %	50 %	156936571
78	NC_009780	CG	3	6	23599	23604	0 %	0 %	50 %	50 %	156936571
79	NC_009780	CG	3	6	23820	23825	0 %	0 %	50 %	50 %	156936571
80	NC_009780	GC	3	6	24286	24291	0 %	0 %	50 %	50 %	156936572
81	NC_009780	CG	3	6	24577	24582	0 %	0 %	50 %	50 %	156936573
82	NC_009780	CG	3	6	24740	24745	0 %	0 %	50 %	50 %	156936573
83	NC_009780	AG	3	6	24960	24965	50 %	0 %	50 %	0 %	156936573
84	NC_009780	CG	3	6	25023	25028	0 %	0 %	50 %	50 %	156936573
85	NC_009780	GC	3	6	25723	25728	0 %	0 %	50 %	50 %	156936575
86	NC_009780	CG	3	6	25979	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	156936575
87	NC_009780	GA	3	6	26309	26314	50 %	0 %	50 %	0 %	156936576
88	NC_009780	TC	3	6	26897	26902	0 %	50 %	0 %	50 %	156936578
89	NC_009780	CG	3	6	27004	27009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009780	CG	3	6	28146	28151	0 %	0 %	50 %	50 %	156936581
91	NC_009780	GC	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	156936581
92	NC_009780	GC	3	6	28369	28374	0 %	0 %	50 %	50 %	156936581
93	NC_009780	GC	3	6	28462	28467	0 %	0 %	50 %	50 %	156936581
94	NC_009780	TC	3	6	29006	29011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009780	TC	3	6	29039	29044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009780	GA	3	6	29188	29193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009780	GC	3	6	29659	29664	0 %	0 %	50 %	50 %	156936582
98	NC_009780	GC	3	6	29697	29702	0 %	0 %	50 %	50 %	156936582
99	NC_009780	GC	3	6	29906	29911	0 %	0 %	50 %	50 %	156936582
100	NC_009780	CG	3	6	30115	30120	0 %	0 %	50 %	50 %	156936583
101	NC_009780	GA	3	6	30317	30322	50 %	0 %	50 %	0 %	156936583
102	NC_009780	GC	3	6	30684	30689	0 %	0 %	50 %	50 %	156936583
103	NC_009780	TG	3	6	31366	31371	0 %	50 %	50 %	0 %	156936583
104	NC_009780	GC	3	6	31596	31601	0 %	0 %	50 %	50 %	156936583
105	NC_009780	AC	3	6	31643	31648	50 %	0 %	0 %	50 %	156936583
106	NC_009780	GC	3	6	32019	32024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009780	AT	3	6	32116	32121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009780	CA	3	6	32812	32817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009780	GC	3	6	33099	33104	0 %	0 %	50 %	50 %	156936585
110	NC_009780	CA	3	6	33180	33185	50 %	0 %	0 %	50 %	156936585
111	NC_009780	GA	3	6	33576	33581	50 %	0 %	50 %	0 %	156936587
112	NC_009780	TC	3	6	33584	33589	0 %	50 %	0 %	50 %	156936587
113	NC_009780	GC	3	6	33788	33793	0 %	0 %	50 %	50 %	156936588
114	NC_009780	CG	3	6	34012	34017	0 %	0 %	50 %	50 %	156936588
115	NC_009780	CG	3	6	34219	34224	0 %	0 %	50 %	50 %	156936589
116	NC_009780	GC	3	6	34237	34242	0 %	0 %	50 %	50 %	156936589
117	NC_009780	GC	3	6	34312	34317	0 %	0 %	50 %	50 %	156936589
118	NC_009780	CG	3	6	34322	34327	0 %	0 %	50 %	50 %	156936589
119	NC_009780	GC	3	6	34488	34493	0 %	0 %	50 %	50 %	156936589
120	NC_009780	GC	3	6	34796	34801	0 %	0 %	50 %	50 %	156936589
121	NC_009780	GC	3	6	35232	35237	0 %	0 %	50 %	50 %	156936590
122	NC_009780	TC	3	6	35339	35344	0 %	50 %	0 %	50 %	156936590
123	NC_009780	CG	3	6	35382	35387	0 %	0 %	50 %	50 %	156936590
124	NC_009780	GC	3	6	36390	36395	0 %	0 %	50 %	50 %	156936591
125	NC_009780	GC	3	6	36561	36566	0 %	0 %	50 %	50 %	156936591
126	NC_009780	GC	3	6	36936	36941	0 %	0 %	50 %	50 %	156936591
127	NC_009780	AT	3	6	37992	37997	50 %	50 %	0 %	0 %	156936592
128	NC_009780	CG	3	6	38020	38025	0 %	0 %	50 %	50 %	156936592
129	NC_009780	GC	3	6	38495	38500	0 %	0 %	50 %	50 %	156936592
130	NC_009780	GC	3	6	39147	39152	0 %	0 %	50 %	50 %	156936593
131	NC_009780	TG	3	6	39444	39449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009780	CA	3	6	39590	39595	50 %	0 %	0 %	50 %	156936594
133	NC_009780	GC	3	6	40259	40264	0 %	0 %	50 %	50 %	156936595
134	NC_009780	GC	3	6	40723	40728	0 %	0 %	50 %	50 %	156936597
135	NC_009780	CG	3	6	41088	41093	0 %	0 %	50 %	50 %	156936597
136	NC_009780	TG	3	6	41132	41137	0 %	50 %	50 %	0 %	156936597
137	NC_009780	GC	3	6	42281	42286	0 %	0 %	50 %	50 %	156936598
138	NC_009780	GC	3	6	42321	42326	0 %	0 %	50 %	50 %	156936598
139	NC_009780	CG	3	6	42457	42462	0 %	0 %	50 %	50 %	156936598
140	NC_009780	GT	3	6	42614	42619	0 %	50 %	50 %	0 %	156936598
141	NC_009780	TC	3	6	45029	45034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009780	AC	3	6	45134	45139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009780	GC	3	6	45382	45387	0 %	0 %	50 %	50 %	156936602
144	NC_009780	TG	3	6	45675	45680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009780	GC	3	6	47857	47862	0 %	0 %	50 %	50 %	156936605
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.