MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA2

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009779	GAAA	2	8	99	106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009779	GAGG	2	8	886	893	25 %	0 %	75 %	0 %	156936509
3	NC_009779	GAAA	2	8	1160	1167	75 %	0 %	25 %	0 %	156936509
4	NC_009779	ATTT	2	8	1686	1693	25 %	75 %	0 %	0 %	156936509
5	NC_009779	AGGC	2	8	2273	2280	25 %	0 %	50 %	25 %	156936509
6	NC_009779	GCCT	2	8	2440	2447	0 %	25 %	25 %	50 %	156936509
7	NC_009779	GAAA	2	8	2518	2525	75 %	0 %	25 %	0 %	156936510
8	NC_009779	TGAT	2	8	3372	3379	25 %	50 %	25 %	0 %	156936511
9	NC_009779	GCTG	2	8	3552	3559	0 %	25 %	50 %	25 %	156936511
10	NC_009779	CAAC	2	8	3742	3749	50 %	0 %	0 %	50 %	156936511
11	NC_009779	GCAT	2	8	4171	4178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009779	CTGA	2	8	4582	4589	25 %	25 %	25 %	25 %	156936514
13	NC_009779	TCAA	2	8	7327	7334	50 %	25 %	0 %	25 %	156936516
14	NC_009779	CGAG	2	8	7667	7674	25 %	0 %	50 %	25 %	156936516
15	NC_009779	GAAC	2	8	7970	7977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009779	TCGT	2	8	8170	8177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009779	ACCC	2	8	8481	8488	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009779	GCGT	2	8	8543	8550	0 %	25 %	50 %	25 %	156936517
19	NC_009779	GACC	2	8	8887	8894	25 %	0 %	25 %	50 %	156936517
20	NC_009779	TCCG	2	8	9756	9763	0 %	25 %	25 %	50 %	156936519
21	NC_009779	CGCT	2	8	10223	10230	0 %	25 %	25 %	50 %	156936520
22	NC_009779	CCAT	2	8	11108	11115	25 %	25 %	0 %	50 %	156936522
23	NC_009779	CGGT	2	8	11458	11465	0 %	25 %	50 %	25 %	156936523
24	NC_009779	GCCC	2	8	12196	12203	0 %	0 %	25 %	75 %	156936524
25	NC_009779	GACG	2	8	12283	12290	25 %	0 %	50 %	25 %	156936524
26	NC_009779	TGGC	2	8	12347	12354	0 %	25 %	50 %	25 %	156936524
27	NC_009779	CGCC	2	8	12513	12520	0 %	0 %	25 %	75 %	156936524
28	NC_009779	CAAG	2	8	12748	12755	50 %	0 %	25 %	25 %	156936524
29	NC_009779	CGCC	2	8	12942	12949	0 %	0 %	25 %	75 %	156936524
30	NC_009779	CCGA	2	8	13028	13035	25 %	0 %	25 %	50 %	156936524
31	NC_009779	TGAC	2	8	15425	15432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009779	TTCG	2	8	16094	16101	0 %	50 %	25 %	25 %	156936526
33	NC_009779	ATCC	2	8	16576	16583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009779	GTAA	2	8	16947	16954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009779	TTAC	2	8	17005	17012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009779	TCAC	2	8	17876	17883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009779	CCGT	2	8	18105	18112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009779	GGCA	2	8	18324	18331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009779	CATT	2	8	18363	18370	25 %	50 %	0 %	25 %	156936528
40	NC_009779	ACCC	2	8	18703	18710	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_009779	TCTG	2	8	19570	19577	0 %	50 %	25 %	25 %	156936530
42	NC_009779	TCAC	2	8	20091	20098	25 %	25 %	0 %	50 %	156936532
43	NC_009779	ATCC	2	8	21286	21293	25 %	25 %	0 %	50 %	156936534
44	NC_009779	CGTT	2	8	21415	21422	0 %	50 %	25 %	25 %	156936534
45	NC_009779	TGGA	2	8	23815	23822	25 %	25 %	50 %	0 %	156936535
46	NC_009779	CAAT	2	8	24270	24277	50 %	25 %	0 %	25 %	156936535
47	NC_009779	AAAT	2	8	24356	24363	75 %	25 %	0 %	0 %	156936535
48	NC_009779	GCTG	2	8	24743	24750	0 %	25 %	50 %	25 %	156936537
49	NC_009779	AATT	2	8	25936	25943	50 %	50 %	0 %	0 %	156936539
50	NC_009779	TCCC	2	8	26231	26238	0 %	25 %	0 %	75 %	156936539
51	NC_009779	CAGA	2	8	26574	26581	50 %	0 %	25 %	25 %	156936539
52	NC_009779	TTAT	2	8	26709	26716	25 %	75 %	0 %	0 %	156936540
53	NC_009779	CCCA	2	8	26923	26930	25 %	0 %	0 %	75 %	156936540
54	NC_009779	TAAA	2	8	27717	27724	75 %	25 %	0 %	0 %	156936541
55	NC_009779	GCCC	2	8	28144	28151	0 %	0 %	25 %	75 %	156936541
56	NC_009779	GGGC	2	8	28463	28470	0 %	0 %	75 %	25 %	156936541
57	NC_009779	ATGG	2	8	28568	28575	25 %	25 %	50 %	0 %	156936541
58	NC_009779	GTTG	2	8	29121	29128	0 %	50 %	50 %	0 %	156936542
59	NC_009779	GAAT	2	8	29816	29823	50 %	25 %	25 %	0 %	156936542
60	NC_009779	ATTT	2	8	29827	29834	25 %	75 %	0 %	0 %	156936542
61	NC_009779	CAGC	2	8	30219	30226	25 %	0 %	25 %	50 %	156936543
62	NC_009779	ATTT	2	8	30258	30265	25 %	75 %	0 %	0 %	156936543
63	NC_009779	TGTA	2	8	30395	30402	25 %	50 %	25 %	0 %	156936544
64	NC_009779	TAAT	2	8	30718	30725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.