MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA2

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009779	GAC	2	6	566	571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936508
2	NC_009779	CGC	2	6	682	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936508
3	NC_009779	TCT	3	9	942	950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936509
4	NC_009779	ACC	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936509
5	NC_009779	GAT	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
6	NC_009779	TGC	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936509
7	NC_009779	ACC	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936509
8	NC_009779	TTC	2	6	1374	1379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936509
9	NC_009779	TTA	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936509
10	NC_009779	TTG	2	6	1413	1418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936509
11	NC_009779	GAA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936509
12	NC_009779	GCA	2	6	1637	1642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936509
13	NC_009779	GGA	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936509
14	NC_009779	AGA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936509
15	NC_009779	GCT	2	6	1824	1829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936509
16	NC_009779	ATT	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936509
17	NC_009779	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936509
18	NC_009779	TGA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
19	NC_009779	ATC	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936509
20	NC_009779	CAG	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936509
21	NC_009779	TTG	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936509
22	NC_009779	ATG	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
23	NC_009779	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
24	NC_009779	TGC	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936509
25	NC_009779	CCA	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936509
26	NC_009779	CTT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936509
27	NC_009779	TCT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936510
28	NC_009779	AGG	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936510
29	NC_009779	CTG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936510
30	NC_009779	GAA	2	6	2877	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936510
31	NC_009779	ATT	2	6	2950	2955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936510
32	NC_009779	TGT	2	6	2973	2978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936510
33	NC_009779	GCC	2	6	3046	3051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936510
34	NC_009779	GTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936510
35	NC_009779	GAA	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936510
36	NC_009779	GCA	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936511
37	NC_009779	TGA	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936511
38	NC_009779	AGG	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936511
39	NC_009779	GGC	2	6	3924	3929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936512
40	NC_009779	ATC	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936512
41	NC_009779	GCT	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936512
42	NC_009779	TGG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936512
43	NC_009779	GAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936512
44	NC_009779	GCA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936513
45	NC_009779	CTG	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936513
46	NC_009779	TCA	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936514
47	NC_009779	ACC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936514
48	NC_009779	GTC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936514
49	NC_009779	ATC	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936514
50	NC_009779	CAG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936514
51	NC_009779	CAA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936514
52	NC_009779	AGT	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936514
53	NC_009779	TGG	2	6	4836	4841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936514
54	NC_009779	TGC	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936514
55	NC_009779	CGG	2	6	4936	4941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936514
56	NC_009779	TTA	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
57	NC_009779	GAG	2	6	5668	5673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936515
58	NC_009779	ACC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936515
59	NC_009779	ATT	2	6	5805	5810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
60	NC_009779	TTA	2	6	5913	5918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
61	NC_009779	CAG	2	6	5938	5943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936515
62	NC_009779	TTG	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936515
63	NC_009779	ATT	2	6	5954	5959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
64	NC_009779	GTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936515
65	NC_009779	CCG	2	6	6190	6195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936515
66	NC_009779	CCG	2	6	6201	6206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936515
67	NC_009779	TCA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936515
68	NC_009779	GCA	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936515
69	NC_009779	GCA	3	9	6402	6410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936515
70	NC_009779	TGC	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936515
71	NC_009779	TCA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936515
72	NC_009779	CGT	2	6	6781	6786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936516
73	NC_009779	AAC	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936516
74	NC_009779	ATG	2	6	7180	7185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936516
75	NC_009779	CAC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936516
76	NC_009779	CCG	2	6	7450	7455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936516
77	NC_009779	AGC	2	6	7689	7694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936516
78	NC_009779	GGC	2	6	8615	8620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936517
79	NC_009779	CAG	2	6	8632	8637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936517
80	NC_009779	CTT	2	6	8638	8643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936517
81	NC_009779	GCC	2	6	8683	8688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936517
82	NC_009779	GCT	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936517
83	NC_009779	GAA	3	9	8782	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936517
84	NC_009779	GAC	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936517
85	NC_009779	GCA	2	6	8940	8945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936517
86	NC_009779	CTT	2	6	9143	9148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936518
87	NC_009779	TCC	2	6	9226	9231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936518
88	NC_009779	CAG	2	6	9270	9275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936518
89	NC_009779	GCA	2	6	9278	9283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936518
90	NC_009779	TGG	2	6	9305	9310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936518
91	NC_009779	CGA	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936518
92	NC_009779	CCG	2	6	9464	9469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936519
93	NC_009779	CAG	2	6	9521	9526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936519
94	NC_009779	ACC	2	6	9558	9563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936519
95	NC_009779	CGG	2	6	9604	9609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936519
96	NC_009779	CCG	2	6	9624	9629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936519
97	NC_009779	GAT	2	6	9638	9643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936519
98	NC_009779	GTA	2	6	9698	9703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936519
99	NC_009779	GCG	2	6	9704	9709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936519
100	NC_009779	TGG	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936519
101	NC_009779	GCA	3	9	9793	9801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936519
102	NC_009779	ATC	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936519
103	NC_009779	ATC	2	6	9915	9920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936519
104	NC_009779	GCA	2	6	9975	9980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936520
105	NC_009779	CCG	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936520
106	NC_009779	GGC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936520
107	NC_009779	GCT	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936520
108	NC_009779	CAG	2	6	10123	10128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936520
109	NC_009779	CTT	2	6	10210	10215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936520
110	NC_009779	CGA	2	6	10248	10253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936520
111	NC_009779	GCG	2	6	10264	10269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936520
112	NC_009779	TCG	2	6	10931	10936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936522
113	NC_009779	CGG	2	6	10950	10955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936522
114	NC_009779	CAC	2	6	11002	11007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936522
115	NC_009779	TGC	2	6	11061	11066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936522
116	NC_009779	GCC	2	6	11126	11131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936522
117	NC_009779	ATG	2	6	11153	11158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936522
118	NC_009779	CTG	2	6	11164	11169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936522
119	NC_009779	AAG	2	6	11186	11191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936522
120	NC_009779	CTG	2	6	11239	11244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936522
121	NC_009779	CGG	2	6	11322	11327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936523
122	NC_009779	CAG	2	6	11343	11348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936523
123	NC_009779	AGC	2	6	11365	11370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936523
124	NC_009779	TTC	3	9	11379	11387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936523
125	NC_009779	CAA	2	6	11403	11408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936523
126	NC_009779	GCA	2	6	11471	11476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936523
127	NC_009779	CCG	2	6	11734	11739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936524
128	NC_009779	CCG	3	9	11751	11759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936524
129	NC_009779	CTG	2	6	11771	11776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936524
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254	NC_009779	TGA	2	6	22851	22856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936534
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.