MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009778	TAACCA	2	12	54756	54767	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009778	TCCTCT	2	12	97008	97019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009778	ACCCCA	2	12	139829	139840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009778	AAGTGA	2	12	186582	186593	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009778	GCTTTA	2	12	222794	222805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009778	CCCAGC	2	12	448533	448544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009778	GATCCC	2	12	483791	483802	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009778	CAGTCT	2	12	507050	507061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009778	GCTTAT	2	12	507202	507213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009778	GCGCAT	2	12	517801	517812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009778	AGGTGC	2	12	603758	603769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009778	TTTTGC	2	12	634879	634890	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009778	CGGTTG	2	12	644861	644872	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009778	CTGCCG	2	12	658865	658876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009778	GGTTGG	2	12	676965	676976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009778	TGAAAA	2	12	678399	678410	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009778	ACATTT	2	12	712517	712528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009778	CGGTTG	2	12	736396	736407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009778	TTTCTG	2	12	852676	852687	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009778	TTTTCT	2	12	872998	873009	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009778	GAAAAT	2	12	876960	876971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009778	CTTTTT	2	12	928855	928866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009778	GAAATA	2	12	937434	937445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009778	CCCCGA	2	12	988968	988979	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009778	GCAAGA	2	12	1054457	1054468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009778	TTTCCC	2	12	1068966	1068977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009778	CTTTTA	2	12	1090496	1090507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009778	ACCCGC	2	12	1100868	1100879	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009778	TATTGT	2	12	1198400	1198411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009778	CTGAAC	2	12	1235552	1235563	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009778	AAAGCT	2	12	1285571	1285582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009778	TTTGAG	2	12	1298615	1298626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009778	TATTAG	2	12	1315769	1315780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009778	CATAGC	2	12	1349727	1349738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009778	GGAAGG	2	12	1411214	1411225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009778	TAAAAA	2	12	1444442	1444453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009778	TACCCA	2	12	1466265	1466276	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009778	ATGATA	2	12	1504262	1504273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009778	GGATTG	2	12	1524939	1524950	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009778	TTAATT	2	12	1533283	1533294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009778	GCTCCT	2	12	1573170	1573181	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009778	GCCTTA	2	12	1595873	1595884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009778	GTAAGC	2	12	1637408	1637419	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009778	GTAAGC	2	12	1637462	1637473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009778	ATCTAT	2	12	1649085	1649096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009778	TGAATA	2	12	1703361	1703372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009778	TTTATC	2	12	1720139	1720150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009778	GTAATG	2	12	1744018	1744029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009778	CAGGGG	2	12	1745904	1745915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009778	GCTTTT	2	12	1801157	1801168	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009778	GATATA	2	12	1847923	1847934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009778	TTTCTG	2	12	1868901	1868912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009778	TTCACG	2	12	1895687	1895698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009778	TTGACG	2	12	1978968	1978979	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009778	CTTTGC	2	12	1990912	1990923	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009778	TATCAG	2	12	2031058	2031069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009778	ACACCT	2	12	2031546	2031557	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009778	CTGCGT	2	12	2162945	2162956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009778	TCAAAT	2	12	2223283	2223294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009778	ATTACA	2	12	2235533	2235544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009778	GATAGT	2	12	2248776	2248787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009778	TTTAGT	2	12	2248868	2248879	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009778	TTGTTT	2	12	2260321	2260332	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009778	CAAACC	2	12	2265151	2265162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009778	AAGCGC	2	12	2282986	2282997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009778	AAGCGC	2	12	2283152	2283163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009778	GCTTAC	2	12	2343364	2343375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009778	GTAAGC	2	12	2343414	2343425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009778	CTGCAT	2	12	2411763	2411774	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009778	CCCCAC	2	12	2421885	2421896	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_009778	AAGCGC	2	12	2451665	2451676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009778	AAGCGC	2	12	2451714	2451725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009778	AAGCGC	2	12	2451763	2451774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009778	AAGCGC	2	12	2451812	2451823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009778	AAGCGC	2	12	2451861	2451872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009778	AAGCGC	2	12	2451910	2451921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009778	CAAAAC	2	12	2480852	2480863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009778	AAGCGC	2	12	2484327	2484338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009778	CTGGCG	2	12	2530623	2530634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009778	CTTTCA	2	12	2539386	2539397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009778	AAGCGC	2	12	2572483	2572494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009778	CCTTTT	2	12	2630068	2630079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009778	TGCGTT	2	12	2670204	2670215	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009778	GCAGCG	2	12	2685755	2685766	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009778	TCCAGA	2	12	2693281	2693292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009778	TTTTTG	2	12	2883859	2883870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009778	CACGCC	2	12	3029320	3029331	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009778	AAAAAC	2	12	3031181	3031192	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009778	TTGTGG	2	12	3069437	3069448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009778	TCCGGC	2	12	3087369	3087380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009778	GTGATG	2	12	3131409	3131420	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009778	CCTTTT	2	12	3141647	3141658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009778	AATAAA	2	12	3189532	3189543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009778	AGACGC	2	12	3214001	3214012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009778	ACGCTC	2	12	3218953	3218964	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009778	AAAAAC	2	12	3226002	3226013	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009778	ATCATT	2	12	3324429	3324440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009778	CTTCCC	2	12	3333187	3333198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009778	GCGGGT	2	12	3338871	3338882	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009778	GAATCT	2	12	3455849	3455860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009778	TTTATA	2	12	3466912	3466923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009778	GGTTAA	2	12	3510960	3510971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009778	GGCCAG	2	12	3597255	3597266	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009778	GCAAAA	2	12	3604069	3604080	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009778	AGGGTA	2	12	3829419	3829430	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009778	AAGGGA	2	12	3831939	3831950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009778	GGAAAA	2	12	3838570	3838581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009778	TATCCT	2	12	3899324	3899335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009778	CTGGTG	2	12	4015128	4015139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009778	CTGGTG	2	12	4015179	4015190	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009778	GATATT	2	12	4040811	4040822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009778	CAAAAA	2	12	4177814	4177825	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009778	GGCGTC	2	12	4242906	4242917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009778	AATGAT	2	12	4261391	4261402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009778	CATTTT	2	12	4316850	4316861	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.