MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 chromosome

Total Repeats: 2634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009778	GTAAA	2	10	5909	5918	60 %	20 %	20 %	0 %	156932245
2	NC_009778	CTGAA	2	10	6798	6807	40 %	20 %	20 %	20 %	156932248
3	NC_009778	TGGCC	2	10	8805	8814	0 %	20 %	40 %	40 %	156932253
4	NC_009778	GCCGA	2	10	10958	10967	20 %	0 %	40 %	40 %	156932257
5	NC_009778	CGATC	2	10	13323	13332	20 %	20 %	20 %	40 %	156932260
6	NC_009778	TTAGC	2	10	17161	17170	20 %	40 %	20 %	20 %	156932266
7	NC_009778	AGCTG	2	10	18785	18794	20 %	20 %	40 %	20 %	156932267
8	NC_009778	CGGGG	2	10	20683	20692	0 %	0 %	80 %	20 %	156932269
9	NC_009778	GAAAA	2	10	22168	22177	80 %	0 %	20 %	0 %	156932271
10	NC_009778	GCAAC	2	10	23513	23522	40 %	0 %	20 %	40 %	156932273
11	NC_009778	CATCA	2	10	30926	30935	40 %	20 %	0 %	40 %	156932277
12	NC_009778	CGTCG	2	10	31885	31894	0 %	20 %	40 %	40 %	156932278
13	NC_009778	GCAGT	2	10	32890	32899	20 %	20 %	40 %	20 %	156932278
14	NC_009778	TGGTG	2	10	34115	34124	0 %	40 %	60 %	0 %	156932279
15	NC_009778	AAGGC	2	10	35039	35048	40 %	0 %	40 %	20 %	156932280
16	NC_009778	CGCAG	2	10	36820	36829	20 %	0 %	40 %	40 %	156932281
17	NC_009778	GTCGC	2	10	43699	43708	0 %	20 %	40 %	40 %	156932285
18	NC_009778	TGCGC	2	10	47907	47916	0 %	20 %	40 %	40 %	156932289
19	NC_009778	ACGCG	2	10	51073	51082	20 %	0 %	40 %	40 %	156932292
20	NC_009778	GGCGC	2	10	51203	51212	0 %	0 %	60 %	40 %	156932292
21	NC_009778	TCGCT	2	10	55460	55469	0 %	40 %	20 %	40 %	156932300
22	NC_009778	CGGCG	2	10	55719	55728	0 %	0 %	60 %	40 %	156932300
23	NC_009778	CTGGG	2	10	56643	56652	0 %	20 %	60 %	20 %	156932301
24	NC_009778	GCGCG	2	10	59032	59041	0 %	0 %	60 %	40 %	156932303
25	NC_009778	CGCGC	2	10	59120	59129	0 %	0 %	40 %	60 %	156932303
26	NC_009778	GGCGC	2	10	59289	59298	0 %	0 %	60 %	40 %	156932303
27	NC_009778	AGCCA	2	10	61146	61155	40 %	0 %	20 %	40 %	156932305
28	NC_009778	GTCGG	2	10	61190	61199	0 %	20 %	60 %	20 %	156932305
29	NC_009778	CAGAG	2	10	63668	63677	40 %	0 %	40 %	20 %	156932306
30	NC_009778	CATAA	2	10	63870	63879	60 %	20 %	0 %	20 %	156932306
31	NC_009778	CTGCG	2	10	65067	65076	0 %	20 %	40 %	40 %	156932307
32	NC_009778	TTACT	2	10	67109	67118	20 %	60 %	0 %	20 %	156932309
33	NC_009778	TGGAG	2	10	68369	68378	20 %	20 %	60 %	0 %	156932311
34	NC_009778	GTGAC	2	10	68633	68642	20 %	20 %	40 %	20 %	156932311
35	NC_009778	CGATC	2	10	72233	72242	20 %	20 %	20 %	40 %	156932313
36	NC_009778	GCACA	2	10	75348	75357	40 %	0 %	20 %	40 %	156932317
37	NC_009778	CGATG	2	10	76474	76483	20 %	20 %	40 %	20 %	156932319
38	NC_009778	GGCGT	2	10	76493	76502	0 %	20 %	60 %	20 %	156932319
39	NC_009778	GGCGT	2	10	77051	77060	0 %	20 %	60 %	20 %	156932319
40	NC_009778	GTCAC	2	10	78594	78603	20 %	20 %	20 %	40 %	156932320
41	NC_009778	ACCCA	2	10	82198	82207	40 %	0 %	0 %	60 %	156932325
42	NC_009778	CGTAA	2	10	84622	84631	40 %	20 %	20 %	20 %	156932326
43	NC_009778	TCATC	2	10	86927	86936	20 %	40 %	0 %	40 %	156932328
44	NC_009778	GATGT	2	10	87395	87404	20 %	40 %	40 %	0 %	156932329
45	NC_009778	GCACG	2	10	89188	89197	20 %	0 %	40 %	40 %	156932332
46	NC_009778	GCGTG	2	10	89383	89392	0 %	20 %	60 %	20 %	156932332
47	NC_009778	TGCGC	2	10	89994	90003	0 %	20 %	40 %	40 %	156932332
48	NC_009778	GCGCT	2	10	90829	90838	0 %	20 %	40 %	40 %	156932332
49	NC_009778	GCTGG	2	10	92863	92872	0 %	20 %	60 %	20 %	156932334
50	NC_009778	TAACG	2	10	93241	93250	40 %	20 %	20 %	20 %	156932334
51	NC_009778	TCTGC	2	10	93863	93872	0 %	40 %	20 %	40 %	156932335
52	NC_009778	GGCGC	2	10	94553	94562	0 %	0 %	60 %	40 %	156932336
53	NC_009778	CGTTC	2	10	97986	97995	0 %	40 %	20 %	40 %	156932341
54	NC_009778	CCGTC	2	10	101777	101786	0 %	20 %	20 %	60 %	156932344
55	NC_009778	TTTCA	2	10	102101	102110	20 %	60 %	0 %	20 %	156932344
56	NC_009778	GCGCA	2	10	102728	102737	20 %	0 %	40 %	40 %	156932344
57	NC_009778	TAGCG	2	10	102937	102946	20 %	20 %	40 %	20 %	156932344
58	NC_009778	CGGCG	2	10	103392	103401	0 %	0 %	60 %	40 %	156932345
59	NC_009778	GCCTG	2	10	107671	107680	0 %	20 %	40 %	40 %	156932348
60	NC_009778	TGGCG	2	10	111003	111012	0 %	20 %	60 %	20 %	156932351
61	NC_009778	ATCGA	2	10	111265	111274	40 %	20 %	20 %	20 %	156932351
62	NC_009778	ATGGC	2	10	113292	113301	20 %	20 %	40 %	20 %	156932352
63	NC_009778	GCCGC	2	10	113499	113508	0 %	0 %	40 %	60 %	156932352
64	NC_009778	GCTTT	2	10	114629	114638	0 %	60 %	20 %	20 %	156932353
65	NC_009778	CGCCA	2	10	115384	115393	20 %	0 %	20 %	60 %	156932355
66	NC_009778	TATTT	2	10	115862	115871	20 %	80 %	0 %	0 %	156932356
67	NC_009778	AGCGG	2	10	117167	117176	20 %	0 %	60 %	20 %	156932358
68	NC_009778	GTACC	2	10	121201	121210	20 %	20 %	20 %	40 %	156932360
69	NC_009778	ATGAA	2	10	122091	122100	60 %	20 %	20 %	0 %	156932362
70	NC_009778	CGCGC	2	10	122695	122704	0 %	0 %	40 %	60 %	156932363
71	NC_009778	GGCGC	2	10	124116	124125	0 %	0 %	60 %	40 %	156932364
72	NC_009778	ACGCC	2	10	124554	124563	20 %	0 %	20 %	60 %	156932364
73	NC_009778	GAAAG	2	10	125644	125653	60 %	0 %	40 %	0 %	156932366
74	NC_009778	TACCG	2	10	126970	126979	20 %	20 %	20 %	40 %	156932367
75	NC_009778	CGTGA	2	10	128926	128935	20 %	20 %	40 %	20 %	156932367
76	NC_009778	GCCGG	2	10	131627	131636	0 %	0 %	60 %	40 %	156932369
77	NC_009778	GTCAG	2	10	133323	133332	20 %	20 %	40 %	20 %	156932371
78	NC_009778	CGGCG	2	10	135962	135971	0 %	0 %	60 %	40 %	156932373
79	NC_009778	GCCAC	2	10	136507	136516	20 %	0 %	20 %	60 %	156932374
80	NC_009778	TGCGC	2	10	141590	141599	0 %	20 %	40 %	40 %	156932378
81	NC_009778	CTGCA	2	10	141769	141778	20 %	20 %	20 %	40 %	156932378
82	NC_009778	GAGCA	2	10	142303	142312	40 %	0 %	40 %	20 %	156932379
83	NC_009778	GCTCG	2	10	142918	142927	0 %	20 %	40 %	40 %	156932380
84	NC_009778	GCGCG	2	10	146418	146427	0 %	0 %	60 %	40 %	156932385
85	NC_009778	ACCAG	2	10	147222	147231	40 %	0 %	20 %	40 %	156932387
86	NC_009778	GCTCT	2	10	153786	153795	0 %	40 %	20 %	40 %	156932391
87	NC_009778	GCGCC	2	10	154400	154409	0 %	0 %	40 %	60 %	156932391
88	NC_009778	TCTTT	2	10	158304	158313	0 %	80 %	0 %	20 %	156932396
89	NC_009778	TGACG	2	10	159831	159840	20 %	20 %	40 %	20 %	156932397
90	NC_009778	CGCCT	2	10	161537	161546	0 %	20 %	20 %	60 %	156932399
91	NC_009778	TGACG	2	10	163469	163478	20 %	20 %	40 %	20 %	156932401
92	NC_009778	GCCTG	2	10	169099	169108	0 %	20 %	40 %	40 %	156932406
93	NC_009778	CGGCC	2	10	170721	170730	0 %	0 %	40 %	60 %	156932408
94	NC_009778	GCCGT	2	10	171269	171278	0 %	20 %	40 %	40 %	156932408
95	NC_009778	ATCCC	2	10	172281	172290	20 %	20 %	0 %	60 %	156932410
96	NC_009778	CGGCG	2	10	174574	174583	0 %	0 %	60 %	40 %	156932410
97	NC_009778	AAGCG	2	10	174663	174672	40 %	0 %	40 %	20 %	156932410
98	NC_009778	GCGCC	2	10	178966	178975	0 %	0 %	40 %	60 %	156932415
99	NC_009778	ATGGC	2	10	183212	183221	20 %	20 %	40 %	20 %	156932420
100	NC_009778	ATTGA	2	10	184250	184259	40 %	40 %	20 %	0 %	156932422
101	NC_009778	TCCCG	2	10	186198	186207	0 %	20 %	20 %	60 %	156932427
102	NC_009778	GCGCG	2	10	186400	186409	0 %	0 %	60 %	40 %	156932427
103	NC_009778	GTCGC	2	10	187170	187179	0 %	20 %	40 %	40 %	156932429
104	NC_009778	ATCGG	2	10	196335	196344	20 %	20 %	40 %	20 %	156932439
105	NC_009778	GCTTT	2	10	196476	196485	0 %	60 %	20 %	20 %	156932439
106	NC_009778	AAGGC	2	10	198026	198035	40 %	0 %	40 %	20 %	156932440
107	NC_009778	CGTAC	2	10	198451	198460	20 %	20 %	20 %	40 %	156932441
108	NC_009778	GAAAA	2	10	199100	199109	80 %	0 %	20 %	0 %	156932443
109	NC_009778	AAGCA	2	10	205033	205042	60 %	0 %	20 %	20 %	156932448
110	NC_009778	CGCCA	2	10	207197	207206	20 %	0 %	20 %	60 %	156932449
111	NC_009778	CAATA	2	10	209958	209967	60 %	20 %	0 %	20 %	156932451
112	NC_009778	CCGAC	2	10	209971	209980	20 %	0 %	20 %	60 %	156932451
113	NC_009778	GCTGA	2	10	210300	210309	20 %	20 %	40 %	20 %	156932451
114	NC_009778	GAGCA	2	10	210945	210954	40 %	0 %	40 %	20 %	156932451
115	NC_009778	GGCGA	2	10	212891	212900	20 %	0 %	60 %	20 %	156932455
116	NC_009778	CGCGG	2	10	215573	215582	0 %	0 %	60 %	40 %	156932458
117	NC_009778	CGCAC	2	10	216379	216388	20 %	0 %	20 %	60 %	156932459
118	NC_009778	TGGCG	2	10	216650	216659	0 %	20 %	60 %	20 %	156932459
119	NC_009778	GCGCA	2	10	217814	217823	20 %	0 %	40 %	40 %	156932460
120	NC_009778	CGCGC	2	10	220490	220499	0 %	0 %	40 %	60 %	156932462
121	NC_009778	TAATG	2	10	222365	222374	40 %	40 %	20 %	0 %	156932463
122	NC_009778	TGCGC	2	10	223266	223275	0 %	20 %	40 %	40 %	156932464
123	NC_009778	AGCGC	2	10	223625	223634	20 %	0 %	40 %	40 %	156932465
124	NC_009778	GCCTC	2	10	224488	224497	0 %	20 %	20 %	60 %	156932465
125	NC_009778	GCTCA	2	10	225831	225840	20 %	20 %	20 %	40 %	156932468
126	NC_009778	TGCCG	2	10	227129	227138	0 %	20 %	40 %	40 %	156932471
127	NC_009778	GCCTG	2	10	227309	227318	0 %	20 %	40 %	40 %	156932471
128	NC_009778	CAGCA	2	10	229748	229757	40 %	0 %	20 %	40 %	156932475
129	NC_009778	AAACG	2	10	231346	231355	60 %	0 %	20 %	20 %	156932477
130	NC_009778	CGCGC	2	10	233129	233138	0 %	0 %	40 %	60 %	156932477
131	NC_009778	ATTAA	2	10	233675	233684	60 %	40 %	0 %	0 %	156932479
132	NC_009778	TTGAA	2	10	236658	236667	40 %	40 %	20 %	0 %	156932481
133	NC_009778	CGCGG	2	10	237491	237500	0 %	0 %	60 %	40 %	156932482
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